30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_06201 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_06201  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  362  2e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0388112 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0587  hypothetical protein  60.23 
 
 
173 aa  223  1e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.683361  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1777  hypothetical protein  62.21 
 
 
188 aa  222  3e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04281  hypothetical protein  48.84 
 
 
176 aa  187  6e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1763  hypothetical protein  49.65 
 
 
160 aa  159  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.893095  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04851  hypothetical protein  49.28 
 
 
139 aa  154  8e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04941  hypothetical protein  40.29 
 
 
160 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.67443  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04561  hypothetical protein  35.46 
 
 
153 aa  119  2e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0431  hypothetical protein  35.46 
 
 
152 aa  117  1e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04871  hypothetical protein  34.75 
 
 
161 aa  113  1e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0908407  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  39.24 
 
 
134 aa  52.4  4e-06  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5098  protein of unknown function DUF721  28.77 
 
 
178 aa  51.2  7e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0628947  normal  0.0645069 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  28.57 
 
 
183 aa  50.1  2e-05  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0164  hypothetical protein  27.81 
 
 
185 aa  50.1  2e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0004  hypothetical protein  37.5 
 
 
164 aa  48.5  5e-05  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0796  hypothetical protein  24.84 
 
 
181 aa  47  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0005  protein of unknown function DUF721  29.67 
 
 
166 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0042  hypothetical protein  28.72 
 
 
155 aa  46.2  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2350  hypothetical protein  33.77 
 
 
153 aa  45.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000367866  normal  0.0123481 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  32.5 
 
 
196 aa  45.1  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  32.91 
 
 
168 aa  45.1  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.16141e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  30.84 
 
 
179 aa  44.7  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0655  protein of unknown function DUF721  27.27 
 
 
174 aa  44.3  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0240864  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0005  hypothetical protein  31.25 
 
 
173 aa  43.9  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0499719  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0005  protein of unknown function DUF721  31.25 
 
 
172 aa  42  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0005  hypothetical protein  35.62 
 
 
273 aa  41.6  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0987513  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4084  hypothetical protein  22.01 
 
 
184 aa  41.2  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172895 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  30.26 
 
 
190 aa  41.2  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  30.26 
 
 
190 aa  41.2  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  30.26 
 
 
190 aa  41.2  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.104942 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>