More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_04621 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_15861  fumarate lyase  67.46 
 
 		 466 aa  671    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04621  fumarate hydratase  100 
 
 		 465 aa  953    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0997  fumarate hydratase  60.43 
 
 		 464 aa  606  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0628  fumarate hydratase  66.74 
 
 		 465 aa  604  1.0000000000000001e-171  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.390858  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18661  fumarate hydratase  60.43 
 
 		 464 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.697239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16681  fumarate hydratase  56.58 
 
 		 461 aa  575  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.120243  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1559  fumarate hydratase  56.58 
 
 		 461 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16561  fumarate hydratase  56.36 
 
 		 461 aa  569  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16461  fumarate hydratase  55.22 
 
 		 461 aa  561  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2041  fumarate hydratase  62.77 
 
 		 477 aa  557  1e-157  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2970  fumarate hydratase  55.1 
 
 		 468 aa  535  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1007  fumarate hydratase  58.28 
 
 		 463 aa  531  1e-150  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0281395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1449  fumarate hydratase  55.12 
 
 		 513 aa  529  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352432 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1724  fumarate hydratase  55.1 
 
 		 513 aa  531  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.90897  decreased coverage  0.00664146 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1328  fumarate hydratase  54.7 
 
 		 469 aa  522  1e-147  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  57.58 
 
 		 461 aa  520  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  56.7 
 
 		 461 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  56.7 
 
 		 461 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1627  fumarate hydratase  55.19 
 
 		 468 aa  514  1e-144  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  55.48 
 
 		 464 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  54.8 
 
 		 459 aa  505  9.999999999999999e-143  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  54.8 
 
 		 459 aa  506  9.999999999999999e-143  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  55.43 
 
 		 464 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  55.6 
 
 		 471 aa  505  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  56.26 
 
 		 469 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  55.17 
 
 		 631 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  54.96 
 
 		 464 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3005  fumarate hydratase  55.36 
 
 		 464 aa  503  1e-141  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2866  fumarate hydratase  55.12 
 
 		 463 aa  502  1e-141  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  54.96 
 
 		 464 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  54.96 
 
 		 464 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  55.26 
 
 		 464 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6106  fumarate hydratase  55.04 
 
 		 474 aa  503  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  54.96 
 
 		 464 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  54.51 
 
 		 472 aa  504  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  54.74 
 
 		 464 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  54.51 
 
 		 472 aa  504  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  54.96 
 
 		 464 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  54.7 
 
 		 464 aa  498  1e-140  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  55.87 
 
 		 463 aa  498  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7115  fumarate hydratase, class II  55.9 
 
 		 487 aa  500  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2935  fumarate hydratase  57.36 
 
 		 468 aa  501  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.317569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  54.92 
 
 		 466 aa  499  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  54.68 
 
 		 474 aa  500  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  55.38 
 
 		 469 aa  499  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2151  fumarate hydratase, class II  55.9 
 
 		 467 aa  501  1e-140  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0733926 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  55.6 
 
 		 463 aa  498  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  53.36 
 
 		 467 aa  495  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0192  fumarate hydratase  55.16 
 
 		 463 aa  498  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  54.29 
 
 		 463 aa  497  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4014  fumarate hydratase  55.04 
 
 		 475 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2786  fumarate hydratase, class II  54.73 
 
 		 472 aa  495  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.347801 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0174  fumarate hydratase  55.16 
 
 		 478 aa  496  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000137978  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4521  fumarate hydratase, class II  54.51 
 
 		 469 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0283  fumarate hydratase, class II  54.9 
 
 		 468 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3215  fumarate hydratase, class II  55.38 
 
 		 468 aa  493  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587959  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  53.61 
 
 		 462 aa  493  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  53.59 
 
 		 467 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.799774 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2353  fumarate hydratase  53.07 
 
 		 469 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.499046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  53.66 
 
 		 464 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  53.59 
 
 		 467 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.952 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2445  fumarate hydratase  52.97 
 
 		 466 aa  492  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890321  normal  0.353648 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  53.66 
 
 		 464 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  53.59 
 
 		 467 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  53.59 
 
 		 467 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1908  fumarate hydratase  53.7 
 
 		 465 aa  493  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.856676  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  53.59 
 
 		 467 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2881  fumarate hydratase  54.61 
 
 		 468 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3022  fumarate hydratase  54.07 
 
 		 463 aa  490  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0975  fumarate hydratase  55.22 
 
 		 463 aa  491  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526915  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0494  fumarate hydratase, class II  54.07 
 
 		 464 aa  488  1e-137  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2213  fumarate hydratase  53.88 
 
 		 464 aa  488  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.620267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1545  fumarate hydratase  53.7 
 
 		 485 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1166  fumarate hydratase, class II  54.95 
 
 		 482 aa  490  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  53.45 
 
 		 464 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1576  fumarate hydratase  53.63 
 
 		 482 aa  489  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0866386  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  53.45 
 
 		 464 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3664  fumarate hydratase  52.07 
 
 		 462 aa  488  1e-137  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1102  fumarate hydratase  52.17 
 
 		 464 aa  490  1e-137  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  53.45 
 
 		 464 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2270  fumarate hydratase  52.84 
 
 		 465 aa  489  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  53.16 
 
 		 463 aa  490  1e-137  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  53.7 
 
 		 470 aa  488  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1491  fumarate hydratase  54.07 
 
 		 461 aa  488  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535004  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1873  fumarate hydratase  52.84 
 
 		 465 aa  488  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0104019  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34880  fumarate hydratase  57.27 
 
 		 464 aa  486  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143963  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0637  fumarate hydratase  53.29 
 
 		 461 aa  486  1e-136  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.536555  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4203  fumarate hydratase  52.8 
 
 		 464 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2030  fumarate hydratase  53.73 
 
 		 472 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1985  fumarate hydratase  52.62 
 
 		 465 aa  487  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0420  fumarate hydratase  52.61 
 
 		 463 aa  487  1e-136  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.425613  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  53.73 
 
 		 465 aa  486  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3152  fumarate hydratase  57.77 
 
 		 471 aa  485  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2279  fumarate hydratase  53.16 
 
 		 465 aa  486  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2032  fumarate hydratase, class II  53.36 
 
 		 467 aa  481  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000761073  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1696  fumarate hydratase  55.92 
 
 		 458 aa  483  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397787  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  53.29 
 
 		 461 aa  483  1e-135  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2394  fumarate hydratase  51.42 
 
 		 462 aa  483  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.344054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2320  fumarate hydratase  53.36 
 
 		 467 aa  482  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46735  predicted protein  54.65 
 
 		 458 aa  483  1e-135  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.344273  normal  0.29017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>