More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_04601 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0320  DSH domain protein  44.25 
 
 		 1003 aa  774    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163283 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1286  DSH domain protein  44.73 
 
 		 967 aa  739    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  67.82 
 
 		 927 aa  1307    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  76.73 
 
 		 924 aa  1479    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  54.24 
 
 		 893 aa  891    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  83.9 
 
 		 926 aa  1542    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  86.22 
 
 		 924 aa  1589    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  56 
 
 		 908 aa  1098    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  56.88 
 
 		 919 aa  1011    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  53.59 
 
 		 890 aa  870    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  53.86 
 
 		 905 aa  918    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  52.41 
 
 		 889 aa  886    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  56.11 
 
 		 908 aa  1095    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  55.67 
 
 		 908 aa  1063    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  67.93 
 
 		 927 aa  1308    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  100 
 
 		 924 aa  1891    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  56.22 
 
 		 908 aa  1095    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1315  DSH domain protein  44.63 
 
 		 967 aa  736    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  48.19 
 
 		 1055 aa  481  1e-134  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1765  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  33.51 
 
 		 947 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.64 
 
 		 984 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000527696 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  34.73 
 
 		 904 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.47 
 
 		 950 aa  416  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.459724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2321  DSH domain protein  34.99 
 
 		 916 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000521506  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2656  DSH domain-containing protein  34.02 
 
 		 936 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294225  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2476  DEAD/DEAH box helicase-like protein  34.68 
 
 		 918 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2521  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.68 
 
 		 918 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18500  superfamily II RNA helicase  34.06 
 
 		 972 aa  399  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00038205  normal  0.0935996 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  34.55 
 
 		 906 aa  399  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21930  superfamily II RNA helicase  34.45 
 
 		 918 aa  397  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0392753  normal  0.495503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2513  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.46 
 
 		 918 aa  399  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.701769 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12127  ATP-dependent DNA helicase helY  34.69 
 
 		 906 aa  394  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.511305 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.53 
 
 		 917 aa  393  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5856  putative nuclear exosomal RNA helicase MTR4 ; K01529  34.73 
 
 		 909 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.918517 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2256  DSH domain-containing protein  34.92 
 
 		 935 aa  392  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1517  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.03 
 
 		 950 aa  392  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.729212  normal  0.376472 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.83 
 
 		 922 aa  389  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.983336  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1777  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.91 
 
 		 981 aa  384  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.147105  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3440  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.83 
 
 		 929 aa  385  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.5 
 
 		 996 aa  382  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1885  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.69 
 
 		 931 aa  377  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14030  superfamily II RNA helicase  32.09 
 
 		 953 aa  375  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00460424  normal  0.326096 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.43 
 
 		 919 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0976741  hitchhiker  0.00000193784 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.65 
 
 		 921 aa  370  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.215592 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.44 
 
 		 933 aa  368  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.208331  normal  0.0647712 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.44 
 
 		 952 aa  365  2e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1872  DSH domain protein  43.66 
 
 		 952 aa  362  2e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2692  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.26 
 
 		 951 aa  359  9.999999999999999e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517948  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0793  DEAD/DEAH box helicase  38.88 
 
 		 877 aa  357  6.999999999999999e-97  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.575248 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.53 
 
 		 932 aa  341  2.9999999999999998e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.891699  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2953  DSH domain protein  42.36 
 
 		 940 aa  339  1.9999999999999998e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000014502  hitchhiker  0.00117174 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0467  superfamily II RNA helicase  38.92 
 
 		 863 aa  326  1e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.82 
 
 		 762 aa  317  6e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  28.8 
 
 		 998 aa  314  3.9999999999999997e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04412  ATP dependent RNA helicase (Dob1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07160)  37.63 
 
 		 1073 aa  314  5.999999999999999e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36809  Dead-box family helicase required for mRNA export from nucleus  35.56 
 
 		 1068 aa  312  2e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.787056 
 
 
-
 
NC_006686  CND05090  conserved hypothetical protein  28.45 
 
 		 1068 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.130071  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0918  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.63 
 
 		 815 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  38.46 
 
 		 872 aa  303  9e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50379  predicted protein  35.02 
 
 		 1023 aa  302  2e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0819342  normal  0.0284916 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49799  predicted protein  37.32 
 
 		 933 aa  298  2e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.238463 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1028  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.01 
 
 		 709 aa  291  6e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.42 
 
 		 843 aa  280  8e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.63 
 
 		 817 aa  227  8e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4867  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.92 
 
 		 990 aa  222  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335008 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11980  superfamily II RNA helicase  55.68 
 
 		 994 aa  218  4e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2442  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.66 
 
 		 951 aa  216  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.312521 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2605  DSH-like  51.66 
 
 		 1026 aa  215  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.022552  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16000  superfamily II RNA helicase  51.72 
 
 		 961 aa  212  3e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0348006  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.82 
 
 		 845 aa  211  5e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.15 
 
 		 964 aa  209  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.510547  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.19 
 
 		 861 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400672  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2074  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.4 
 
 		 848 aa  202  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.19 
 
 		 861 aa  202  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10920  superfamily II RNA helicase  32.69 
 
 		 869 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.769865  normal  0.737548 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  31.45 
 
 		 838 aa  200  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.17 
 
 		 837 aa  200  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.164928  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18660  superfamily II RNA helicase  31.33 
 
 		 853 aa  199  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103147  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3781  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.43 
 
 		 876 aa  199  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.485646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2231  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.7 
 
 		 710 aa  199  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.588321  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1019  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.58 
 
 		 837 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.67 
 
 		 832 aa  198  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.451486  normal  0.464159 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3468  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.95 
 
 		 868 aa  197  9e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.132888 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05480  superfamily II RNA helicase  31.39 
 
 		 842 aa  196  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1695  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.69 
 
 		 873 aa  196  1e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.558592  decreased coverage  0.000760063 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3065  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.33 
 
 		 847 aa  196  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.220572  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5274  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.44 
 
 		 827 aa  196  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.89 
 
 		 847 aa  195  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000659674 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0827  DEAD/DEAH box helicase  31.64 
 
 		 842 aa  194  6e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3396  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.93 
 
 		 832 aa  194  7e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17865  normal  0.487568 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3405  DEAD/DEAH box helicase-like  30.77 
 
 		 861 aa  194  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4778  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.17 
 
 		 861 aa  193  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1183  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.89 
 
 		 866 aa  192  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.195641  normal  0.316111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6200  putative ATP-dependent helicase  31.81 
 
 		 830 aa  192  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2373  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.37 
 
 		 894 aa  191  5e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.385543  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0040  superfamily II helicase  32.45 
 
 		 855 aa  190  8e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4192  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.02 
 
 		 950 aa  191  8e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43406  predicted protein  45.41 
 
 		 1209 aa  190  9e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.738221  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02710  translation repressor, putative  47.03 
 
 		 1185 aa  189  2e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0773  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.08 
 
 		 835 aa  189  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>