More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_03941 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_03941  GTPase ObgE  100 
 
 
329 aa  650    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.937616 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0511  GTPase ObgE  82.37 
 
 
329 aa  511  1e-144  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130161  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1824  GTPase ObgE  80.85 
 
 
329 aa  470  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.853156  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02961  GTPase ObgE  70.73 
 
 
329 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.115383  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1586  GTPase ObgE  70.73 
 
 
329 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.928628  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02391  GTPase ObgE  71.43 
 
 
329 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02481  GTPase ObgE  64.53 
 
 
327 aa  421  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.492857  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02391  GTPase ObgE  63 
 
 
327 aa  401  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02381  GTPase ObgE  63 
 
 
327 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.636357  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0220  GTPase ObgE  63 
 
 
327 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.915369  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  62.08 
 
 
350 aa  382  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  61.77 
 
 
338 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  62.69 
 
 
329 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  62.69 
 
 
329 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1586  GTPase ObgE  65.64 
 
 
342 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0414808  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  65.14 
 
 
343 aa  372  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2049  GTPase ObgE  66.06 
 
 
359 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390946  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  61.96 
 
 
352 aa  363  2e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  51.22 
 
 
427 aa  302  6.000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  51.67 
 
 
397 aa  294  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.45 
 
 
356 aa  288  7e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0866  GTPase ObgE  51.94 
 
 
350 aa  287  2e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  53.44 
 
 
346 aa  286  2e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.74 
 
 
438 aa  287  2e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  49.7 
 
 
353 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  50.15 
 
 
395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  50.15 
 
 
372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  48.33 
 
 
387 aa  283  3.0000000000000004e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0524  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.52 
 
 
390 aa  281  1e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000179136  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  50.15 
 
 
343 aa  281  1e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  53.85 
 
 
419 aa  281  1e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  52.68 
 
 
345 aa  280  2e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  52.1 
 
 
405 aa  280  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4505  GTPase ObgE  51.52 
 
 
390 aa  281  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000250571  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  50.15 
 
 
397 aa  281  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0002  GTPase ObgE  49.24 
 
 
424 aa  280  2e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  50.45 
 
 
372 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  50.45 
 
 
372 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0343  GTPase ObgE  52.12 
 
 
346 aa  280  3e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591605  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  50.45 
 
 
372 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  50.45 
 
 
372 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  50.45 
 
 
372 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  50.45 
 
 
372 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  50 
 
 
373 aa  279  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3476  GTPase ObgE  52.44 
 
 
391 aa  279  4e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000303711  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  49.25 
 
 
373 aa  279  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3598  GTPase ObgE  51.22 
 
 
390 aa  278  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  50.15 
 
 
372 aa  278  7e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3493  GTPase ObgE  51.22 
 
 
390 aa  278  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364177  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3491  GTPase ObgE  51.22 
 
 
390 aa  278  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000240056  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3660  GTPase ObgE  51.22 
 
 
390 aa  278  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0449011  normal  0.0890894 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3562  GTPase ObgE  51.22 
 
 
390 aa  278  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.238363  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_2  GTP-binding protein, GTP1/OBG family  48.64 
 
 
424 aa  278  8e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  47.42 
 
 
337 aa  277  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3357  GTPase ObgE  51.83 
 
 
392 aa  276  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0207536  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  49.4 
 
 
370 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  53.74 
 
 
406 aa  277  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3619  GTPase ObgE  50.61 
 
 
392 aa  276  3e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000171752  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  48.8 
 
 
370 aa  276  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1817  GTPase ObgE  52.01 
 
 
354 aa  276  4e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.389419  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0642  GTPase ObgE  49.39 
 
 
336 aa  276  4e-73  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0561  GTPase ObgE  52.28 
 
 
390 aa  275  5e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00587502  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.62 
 
 
417 aa  276  5e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  51.16 
 
 
341 aa  275  6e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  48.96 
 
 
407 aa  275  6e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  51.35 
 
 
347 aa  275  7e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0796  GTPase ObgE  52.28 
 
 
390 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000620978  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.79 
 
 
429 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  49.39 
 
 
392 aa  274  1.0000000000000001e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  50.83 
 
 
341 aa  274  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.16 
 
 
482 aa  274  2.0000000000000002e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_002936  DET0002  GTPase ObgE  48.34 
 
 
424 aa  273  3e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0460  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.99 
 
 
374 aa  273  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177259 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0527  GTPase ObgE  54.13 
 
 
386 aa  273  3e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0283  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.99 
 
 
374 aa  273  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03048  GTPase involved in cell partioning and DNA repair  51.52 
 
 
390 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00301118  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0517  GTPase ObgE  51.52 
 
 
390 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000402809  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02999  hypothetical protein  51.52 
 
 
390 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0026544  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  47.4 
 
 
326 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3376  GTPase ObgE  51.52 
 
 
390 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000688776  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3668  GTPase ObgE  51.52 
 
 
390 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139354  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3479  GTPase ObgE  51.52 
 
 
390 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000528393  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3587  GTPase ObgE  51.52 
 
 
390 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000763921  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  50.15 
 
 
437 aa  273  4.0000000000000004e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1525  GTPase ObgE  50.32 
 
 
357 aa  272  5.000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  50.15 
 
 
406 aa  272  6e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1470  GTPase ObgE  50.15 
 
 
435 aa  271  1e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  48.62 
 
 
337 aa  271  1e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  53.45 
 
 
402 aa  271  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  51.7 
 
 
365 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  48.62 
 
 
327 aa  270  2e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.25 
 
 
426 aa  270  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  47.15 
 
 
435 aa  270  2e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3736  GTPase ObgE  49.7 
 
 
397 aa  270  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0046392  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1582  GTPase ObgE  50.32 
 
 
357 aa  270  2e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  51.29 
 
 
406 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3187  GTPase ObgE  48.44 
 
 
350 aa  271  2e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  48.63 
 
 
365 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  47.15 
 
 
435 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.23 
 
 
437 aa  269  5e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>