183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_03631 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  320  3e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  42.75 
 
 		 162 aa  114  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  39.57 
 
 		 227 aa  105  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  40.43 
 
 		 183 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  44.44 
 
 		 157 aa  101  4e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  35.33 
 
 		 244 aa  95.5  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0805  nuclease (SNase-like)  30.82 
 
 		 165 aa  95.1  3e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  37.86 
 
 		 233 aa  94.4  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  35.47 
 
 		 186 aa  89  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  32.9 
 
 		 153 aa  84.3  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  37.86 
 
 		 206 aa  84  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  38.19 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  33.54 
 
 		 192 aa  80.9  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3707  nuclease (SNase domain protein)  32.62 
 
 		 171 aa  80.5  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.112464  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3653  nuclease (SNase domain protein)  32.62 
 
 		 171 aa  80.5  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  35.15 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  35.76 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  33.75 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  31.9 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  36.23 
 
 		 227 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  33.12 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  34.84 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  35.71 
 
 		 167 aa  77.4  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  37.91 
 
 		 205 aa  77  0.00000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  39.69 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  38.97 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  37.91 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  35 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  32.72 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  35.61 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  35.04 
 
 		 171 aa  73.9  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  36.09 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  33.76 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  35.97 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  35.25 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  34.16 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  32.74 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  34.53 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  36.17 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  31.17 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  38.24 
 
 		 214 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  35.51 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  33.09 
 
 		 174 aa  71.2  0.000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  37.78 
 
 		 182 aa  70.5  0.000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  33.09 
 
 		 232 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  33.33 
 
 		 216 aa  70.5  0.000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  33.54 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  36.03 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  36.64 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00761  hypothetical protein  37.21 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.489486 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  36.64 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  34.59 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  34.81 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  34.92 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  35.34 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  34.56 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  34.59 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06071  micrococcal nuclease  39.42 
 
 		 185 aa  67.8  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.312315  normal  0.542138 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  29.88 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  36.64 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  35.56 
 
 		 226 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  27.33 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  37.88 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  34.29 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  34.81 
 
 		 214 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  45.65 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0135  nuclease (SNase-like)  32.23 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000156916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  31.69 
 
 		 228 aa  60.5  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  38.52 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  30.19 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  32.21 
 
 		 534 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  30.86 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  30.19 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0781  nuclease (SNase-like)  37.07 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0368621  normal  0.0365666 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  29.19 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0211  thermonuclease family protein  35.61 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  31.43 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  29.5 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  27.33 
 
 		 241 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  32.76 
 
 		 199 aa  57.8  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2315  nuclease (SNase domain protein)  30 
 
 		 185 aa  57.4  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  33.78 
 
 		 212 aa  57  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  31.54 
 
 		 209 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  31.82 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  31.37 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  30.49 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1467  Excalibur domain-containing protein  33.33 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  28.48 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  32.08 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  29.01 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0982  nuclease (SNase-like)  26.22 
 
 		 249 aa  54.3  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  33.88 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  31.82 
 
 		 224 aa  54.3  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  32.56 
 
 		 175 aa  53.9  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  34.51 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11681  hypothetical protein  55.1 
 
 		 52 aa  54.3  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  26.71 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  33.08 
 
 		 178 aa  53.9  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  30.54 
 
 		 226 aa  53.9  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>