More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_03241 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  100 
 
 
144 aa  302  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2257  methionine sulfoxide reductase B  78.23 
 
 
133 aa  205  1e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  72.66 
 
 
133 aa  198  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  65.62 
 
 
140 aa  177  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  61.65 
 
 
135 aa  176  7e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  61.42 
 
 
131 aa  176  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  66.13 
 
 
163 aa  174  4e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  62.1 
 
 
146 aa  171  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  61.6 
 
 
138 aa  170  6.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1841  methionine-R-sulfoxide reductase  59.84 
 
 
141 aa  169  7.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  64.41 
 
 
132 aa  168  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  59.23 
 
 
159 aa  168  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  59.06 
 
 
136 aa  168  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  56.25 
 
 
135 aa  167  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2319  methionine-R-sulfoxide reductase  60.66 
 
 
131 aa  163  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.69896  normal  0.111888 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  59.84 
 
 
133 aa  163  8e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2964  methionine sulfoxide reductase B  63.87 
 
 
156 aa  163  8e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  60.32 
 
 
183 aa  163  8e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  56.49 
 
 
134 aa  162  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  55.81 
 
 
142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1027  methionine sulfoxide reductase B  60.63 
 
 
161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0822  methionine-R-sulfoxide reductase  53.52 
 
 
154 aa  161  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000300416  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  55 
 
 
148 aa  161  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  57.69 
 
 
136 aa  161  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  57.81 
 
 
136 aa  160  7e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1817  methionine sulfoxide reductase B  61.42 
 
 
154 aa  160  7e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.706847  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2451  PilB-related protein  56.59 
 
 
137 aa  159  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  58.87 
 
 
131 aa  159  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  58.73 
 
 
132 aa  159  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  57.14 
 
 
151 aa  159  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  55.56 
 
 
128 aa  158  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  55.56 
 
 
128 aa  159  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  56.45 
 
 
131 aa  157  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  55.56 
 
 
128 aa  158  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  57.02 
 
 
141 aa  158  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  57.36 
 
 
132 aa  157  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0705  methionine-R-sulfoxide reductase  56.91 
 
 
137 aa  157  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.906192  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  55.65 
 
 
131 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  58.06 
 
 
137 aa  157  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  52.67 
 
 
139 aa  157  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  54.55 
 
 
133 aa  156  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  52.55 
 
 
147 aa  157  7e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  54.2 
 
 
131 aa  156  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  56.2 
 
 
135 aa  156  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0697  methionine-R-sulfoxide reductase  54.26 
 
 
135 aa  155  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  55.91 
 
 
131 aa  155  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  56.45 
 
 
137 aa  154  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01256  methionine sulfoxide reductase B  52.34 
 
 
142 aa  154  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.779389  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2975  protein-methionine-S-oxide reductase  58.97 
 
 
135 aa  154  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0725689 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1638  methionine-R-sulfoxide reductase  54.76 
 
 
127 aa  155  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1835  methionine-R-sulfoxide reductase  58.14 
 
 
136 aa  155  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.462521 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1165  protein-methionine-S-oxide reductase  53.49 
 
 
134 aa  154  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  51.45 
 
 
142 aa  154  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1350  protein-methionine-S-oxide reductase  57.6 
 
 
133 aa  154  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000258473  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  51.85 
 
 
142 aa  154  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  55.37 
 
 
136 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  50.35 
 
 
140 aa  153  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  54.84 
 
 
131 aa  153  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  50.35 
 
 
140 aa  153  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0972  methionine-R-sulfoxide reductase  55.65 
 
 
134 aa  153  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  56.3 
 
 
164 aa  152  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2777  methionine-R-sulfoxide reductase  53.49 
 
 
140 aa  152  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3070  methionine-R-sulfoxide reductase  53.62 
 
 
166 aa  152  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.972743 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  55.47 
 
 
185 aa  152  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  54.33 
 
 
131 aa  151  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1767  methionine-S-oxide reductase  52.55 
 
 
138 aa  151  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0415378 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15440  methionine sulfoxide reductase B  51.52 
 
 
133 aa  151  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2643  methionine-R-sulfoxide reductase  51.15 
 
 
137 aa  150  4e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.427446  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2658  methionine-R-sulfoxide reductase  56.91 
 
 
133 aa  150  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173178  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2039  methionine-R-sulfoxide reductase  56.45 
 
 
131 aa  150  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.122601  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5464  methionine-R-sulfoxide reductase  57.26 
 
 
135 aa  150  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2028  methionine-R-sulfoxide reductase  60.47 
 
 
137 aa  149  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1676  methionine-R-sulfoxide reductase  60.47 
 
 
137 aa  149  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2582  protein-methionine-S-oxide reductase  53.79 
 
 
136 aa  149  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4073  methionine-R-sulfoxide reductase  55.83 
 
 
177 aa  149  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000057525  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2336  methionine-R-sulfoxide reductase  52.07 
 
 
134 aa  149  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2521  methionine sulfoxide reductase B  52.76 
 
 
131 aa  148  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0744717  normal  0.336049 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2268  protein-methionine-S-oxide reductase  52.59 
 
 
139 aa  149  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000330807  hitchhiker  0.00194582 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0693  protein-methionine-S-oxide reductase  53.49 
 
 
141 aa  148  3e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0153772  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2948  methionine-R-sulfoxide reductase  61.24 
 
 
137 aa  147  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.948084 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0090  methionine-R-sulfoxide reductase  51.09 
 
 
180 aa  147  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1234  methionine-R-sulfoxide reductase  56.56 
 
 
290 aa  147  4e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0160878 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  54.4 
 
 
322 aa  147  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  56.82 
 
 
138 aa  147  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  56.82 
 
 
138 aa  147  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6049  methionine-R-sulfoxide reductase  48.91 
 
 
171 aa  147  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0487159  normal  0.218402 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27510  methionine sulfoxide reductase B  56.3 
 
 
132 aa  147  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156355  normal  0.0230939 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2627  methionine-R-sulfoxide reductase  54.92 
 
 
136 aa  146  9e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.277502  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0336  methionine-R-sulfoxide reductase  56 
 
 
140 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  51.85 
 
 
138 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2097  methionine-R-sulfoxide reductase  52.71 
 
 
167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.3057 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0092  methionine-R-sulfoxide reductase  48.18 
 
 
150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1761  methionine-R-sulfoxide reductase  52.71 
 
 
198 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.490223  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0159  methionine-R-sulfoxide reductase  53.62 
 
 
164 aa  145  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0065  methionine-R-sulfoxide reductase  50.36 
 
 
177 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1676  methionine sulfoxide reductase B  54.47 
 
 
137 aa  144  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000216334  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0352  methionine sulfoxide reductase B  51.09 
 
 
202 aa  145  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3054  methionine-R-sulfoxide reductase  54.4 
 
 
155 aa  145  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000457549  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0348  methionine-R-sulfoxide reductase  55.2 
 
 
140 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2328  methionine sulfoxide reductase B  55.46 
 
 
132 aa  144  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>