16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_03181 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_03181  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  264  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.932316 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0417  hypothetical protein  65.08 
 
 
165 aa  165  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2263  hypothetical protein  66.67 
 
 
176 aa  159  2e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.596766 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2014  hypothetical protein  35.16 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.598603 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4015  WD40 domain protein beta Propeller  29.77 
 
 
174 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.482104 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3466  WD40 domain protein beta Propeller  31.78 
 
 
190 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2651  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  31.78 
 
 
190 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.136026 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2264  hypothetical protein  36.36 
 
 
158 aa  52.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.607727 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03171  hypothetical protein  32.14 
 
 
168 aa  52  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.954075 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0056  WD40 domain-containing protein  29.27 
 
 
184 aa  52  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0416  hypothetical protein  33.64 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0520  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  27.69 
 
 
186 aa  47  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.118512  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  25.42 
 
 
434 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3979  hypothetical protein  26.36 
 
 
171 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4021  WD40 domain protein beta Propeller  26.36 
 
 
171 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3632  tolB protein, putative  27.1 
 
 
441 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000231281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>