More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_01931 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_01931  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 398 aa  781    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0162  Holliday junction DNA helicase RuvB  77.52 
 
 		 347 aa  518  1e-146  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0118  Holliday junction DNA helicase RuvB  78.39 
 
 		 348 aa  518  1e-146  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17401  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.94 
 
 		 348 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1192  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.48 
 
 		 356 aa  461  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20671  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.77 
 
 		 356 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0835  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.31 
 
 		 375 aa  422  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0909626  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2503  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.39 
 
 		 370 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.54699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1008  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.66 
 
 		 366 aa  415  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000228051  hitchhiker  0.00140746 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1892  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.62 
 
 		 371 aa  408  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.912644  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2534  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.68 
 
 		 360 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.113994 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1365  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.87 
 
 		 386 aa  405  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3579  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.68 
 
 		 360 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1554  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.95 
 
 		 366 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0582053 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.7 
 
 		 336 aa  373  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.1 
 
 		 342 aa  374  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2113  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.1 
 
 		 332 aa  370  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1796  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  57.56 
 
 		 341 aa  370  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827733 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2234  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.39 
 
 		 353 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.98 
 
 		 333 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0327  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.21 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.71 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.4 
 
 		 345 aa  364  2e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3124  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.19 
 
 		 346 aa  363  2e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.2 
 
 		 338 aa  362  4e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.59 
 
 		 356 aa  363  4e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0270  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.12 
 
 		 335 aa  362  4e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2104  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.49 
 
 		 334 aa  362  6e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1820  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.49 
 
 		 336 aa  362  8e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0486722  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3625  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.49 
 
 		 348 aa  362  9e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.528643  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.29 
 
 		 356 aa  361  1e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.13 
 
 		 334 aa  361  1e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.88 
 
 		 338 aa  360  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0531  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.84 
 
 		 348 aa  360  2e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01831  Holliday junction DNA helicase B  54.71 
 
 		 336 aa  359  5e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1780  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.71 
 
 		 336 aa  359  5e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115623  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2090  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.71 
 
 		 336 aa  359  5e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376613  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1953  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.71 
 
 		 336 aa  359  5e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.128474  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0956  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.71 
 
 		 336 aa  359  5e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00553774  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01819  hypothetical protein  54.71 
 
 		 336 aa  359  5e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1772  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.71 
 
 		 336 aa  359  5e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0145511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2596  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.71 
 
 		 336 aa  359  5e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0158351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1326  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.71 
 
 		 336 aa  358  6e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0442858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.96 
 
 		 334 aa  359  6e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.96 
 
 		 334 aa  359  6e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4237  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.49 
 
 		 354 aa  358  8e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913769  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2420  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.96 
 
 		 334 aa  358  9e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00322281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0528  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.37 
 
 		 338 aa  358  9e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.59 
 
 		 361 aa  357  9.999999999999999e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.18 
 
 		 334 aa  358  9.999999999999999e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2521  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.49 
 
 		 333 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.51 
 
 		 344 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1272  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.49 
 
 		 350 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197391  normal  0.338771 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.89 
 
 		 351 aa  358  9.999999999999999e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.92 
 
 		 337 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4070  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.84 
 
 		 354 aa  356  3.9999999999999996e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2944  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.24 
 
 		 335 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000368947  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2034  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.02 
 
 		 338 aa  356  5e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0438556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.45 
 
 		 336 aa  356  5e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.92 
 
 		 337 aa  356  5e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1217  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.47 
 
 		 348 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  57.91 
 
 		 541 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.8 
 
 		 344 aa  355  6.999999999999999e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1889  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.02 
 
 		 337 aa  355  6.999999999999999e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1246  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.47 
 
 		 348 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.63 
 
 		 336 aa  355  7.999999999999999e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.91 
 
 		 336 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.69 
 
 		 337 aa  354  1e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.91 
 
 		 333 aa  354  1e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.01 
 
 		 336 aa  354  1e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4541  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.96 
 
 		 352 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4657  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.86 
 
 		 354 aa  354  1e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3998  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.47 
 
 		 348 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1063  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.02 
 
 		 343 aa  355  1e-96  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2777  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.14 
 
 		 351 aa  354  1e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.928098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0612  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.82 
 
 		 351 aa  355  1e-96  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3954  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.45 
 
 		 363 aa  354  1e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150024 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.91 
 
 		 336 aa  354  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.91 
 
 		 336 aa  354  2e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003922  holliday junction DNA helicase RuvB  53.29 
 
 		 355 aa  353  2e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000262975  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.55 
 
 		 338 aa  354  2e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.51 
 
 		 345 aa  353  2e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.23 
 
 		 333 aa  353  2e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0512  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.06 
 
 		 356 aa  353  2.9999999999999997e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01601  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.49 
 
 		 334 aa  353  4e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.65 
 
 		 341 aa  353  4e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0944  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.71 
 
 		 343 aa  353  4e-96  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.91 
 
 		 333 aa  352  5e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.85 
 
 		 357 aa  352  5e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.91 
 
 		 333 aa  352  5e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.17 
 
 		 338 aa  352  5e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.85 
 
 		 357 aa  352  5e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.92 
 
 		 338 aa  352  5e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1410  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.82 
 
 		 353 aa  352  7e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.585511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0140  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.42 
 
 		 348 aa  352  7e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51780  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.63 
 
 		 352 aa  352  7e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261912 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18251  Holliday junction DNA helicase RuvB  49.42 
 
 		 352 aa  352  8e-96  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.159071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.59 
 
 		 333 aa  352  8e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.59 
 
 		 333 aa  352  8e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.28 
 
 		 354 aa  352  8e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>