295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_01821 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_01821  solute-binding family 1 protein  100 
 
 		 434 aa  872    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0108  twin-arginine translocation pathway signal  69.61 
 
 		 435 aa  576  1.0000000000000001e-163  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.77402 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0152  putative sugar-binding protein  68.08 
 
 		 436 aa  547  1e-154  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4213  extracellular solute-binding protein family 1  46.93 
 
 		 426 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.215316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4174  extracellular solute-binding protein family 1  46.93 
 
 		 426 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  43.02 
 
 		 432 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  46.87 
 
 		 421 aa  387  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  46.12 
 
 		 432 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  43.73 
 
 		 432 aa  367  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1604  extracellular solute-binding protein  34.36 
 
 		 425 aa  301  1e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0687  extracellular solute-binding protein  28.78 
 
 		 407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.376534  normal  0.15795 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 		 420 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  29.21 
 
 		 420 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  28.49 
 
 		 416 aa  170  5e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0192  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.12 
 
 		 463 aa  141  3e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5002  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.68 
 
 		 426 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.287585  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2114  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 		 428 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1187  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 426 aa  133  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1080  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 		 426 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103993 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0284  extracellular solute-binding protein family 1  24.15 
 
 		 414 aa  124  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2254  extracellular solute-binding protein family 1  24.22 
 
 		 432 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534892  hitchhiker  0.00235651 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10950  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.71 
 
 		 423 aa  121  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.575293  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2013  extracellular solute-binding protein family 1  24.72 
 
 		 423 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.991542  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3075  sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  25.31 
 
 		 431 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.111769 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 399 aa  103  7e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14790  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.1 
 
 		 424 aa  100  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.0502834 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  25.68 
 
 		 434 aa  98.6  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04610  extracellular solute-binding protein family 1  21.99 
 
 		 431 aa  92.8  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  24.36 
 
 		 446 aa  92.4  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.56 
 
 		 422 aa  90.1  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  22.8 
 
 		 411 aa  87.4  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 		 430 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  22.84 
 
 		 424 aa  84  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  21.99 
 
 		 423 aa  83.2  0.000000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  25 
 
 		 430 aa  80.5  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  22.96 
 
 		 440 aa  80.1  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  20.61 
 
 		 410 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  19.38 
 
 		 411 aa  79.7  0.00000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 		 430 aa  79  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  21.21 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  20.49 
 
 		 411 aa  79.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  21.98 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3553  extracellular solute-binding protein  21.99 
 
 		 419 aa  77.8  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  25.68 
 
 		 456 aa  73.9  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  22 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2305  extracellular solute-binding protein  23.49 
 
 		 459 aa  73.9  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  22.68 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3982  extracellular solute-binding protein family 1  26.62 
 
 		 435 aa  73.2  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  20.85 
 
 		 429 aa  72.8  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  26.96 
 
 		 425 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  20.5 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1023  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.705733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  20.92 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  22.76 
 
 		 420 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  23.13 
 
 		 411 aa  70.1  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  20.05 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 424 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  22.89 
 
 		 411 aa  69.7  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  18.96 
 
 		 366 aa  69.3  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2365  extracellular solute-binding protein family 1  26.8 
 
 		 416 aa  69.7  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  20.51 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  23.38 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2293  extracellular solute-binding protein family 1  20.83 
 
 		 425 aa  67.8  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0656119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  19.51 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2834  extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 		 459 aa  67.4  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  24.91 
 
 		 441 aa  67.4  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3999  extracellular solute-binding protein family 1  24.35 
 
 		 452 aa  67  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  20.58 
 
 		 419 aa  67  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6192  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  21.17 
 
 		 431 aa  66.6  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1371  extracellular solute-binding protein family 1  22.89 
 
 		 438 aa  66.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  23.89 
 
 		 419 aa  66.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  20.91 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  20.85 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2707  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  20.05 
 
 		 440 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.069342  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2640  extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 		 436 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.932575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  20.73 
 
 		 437 aa  65.1  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0358  extracellular solute-binding protein family 1  26.28 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  19.95 
 
 		 426 aa  64.7  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.13 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  23.41 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2297  extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  23.41 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2041  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 		 436 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  25.08 
 
 		 418 aa  63.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  22.46 
 
 		 422 aa  63.9  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2925  putative maltose/mannitol ABC transporter binding protein subunit  23.61 
 
 		 436 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.732093  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34420  putative binding protein component of ABC maltose/mannitol transporter  23.97 
 
 		 436 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000870468  normal  0.425479 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4116  extracellular solute-binding protein  21.5 
 
 		 447 aa  62.4  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000719407  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4468  extracellular solute-binding protein  23.3 
 
 		 436 aa  62  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5097  extracellular solute-binding protein family 1  24.57 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.59554 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4758  extracellular solute-binding protein family 1  24.55 
 
 		 417 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  22.25 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  21.08 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5365  extracellular solute-binding protein family 1  24.01 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.559287 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  20.27 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  21.9 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>