More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_00701 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_00701  trigger factor  100 
 
 
479 aa  958    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.195146 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0063  trigger factor  66.52 
 
 
447 aa  630  1e-179  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.461988  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0066  trigger factor  68.42 
 
 
469 aa  630  1e-179  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17811  trigger factor  59.65 
 
 
471 aa  569  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1253  trigger factor  57.69 
 
 
472 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21241  trigger factor  57.4 
 
 
472 aa  542  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18451  trigger factor  50.11 
 
 
473 aa  468  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.344876  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18451  trigger factor  49.43 
 
 
477 aa  460  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.546976  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1747  trigger factor  49.32 
 
 
481 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18641  trigger factor  48.97 
 
 
474 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0250835  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  44.85 
 
 
471 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2524  trigger factor  42.36 
 
 
474 aa  352  8e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2922  trigger factor  39.59 
 
 
460 aa  340  2.9999999999999998e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.583147  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0586  trigger factor  37.95 
 
 
485 aa  340  4e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.960131  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3133  trigger factor  39.86 
 
 
479 aa  333  5e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4363  trigger factor  38.84 
 
 
500 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2925  trigger factor  39.54 
 
 
455 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3171  trigger factor  39.54 
 
 
455 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  32.91 
 
 
429 aa  218  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  31.82 
 
 
425 aa  202  8e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  31.99 
 
 
488 aa  202  9e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  27.85 
 
 
433 aa  202  9.999999999999999e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  31.29 
 
 
446 aa  202  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  31.28 
 
 
427 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  29.86 
 
 
433 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  29.86 
 
 
433 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  29.38 
 
 
433 aa  197  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  29.37 
 
 
428 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  28.57 
 
 
435 aa  196  7e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  29.57 
 
 
428 aa  195  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  31.42 
 
 
425 aa  192  8e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  31.42 
 
 
425 aa  192  8e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  31.42 
 
 
425 aa  192  8e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  31.42 
 
 
425 aa  192  8e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  31.42 
 
 
425 aa  192  8e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  31.42 
 
 
425 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  31.42 
 
 
425 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  31.42 
 
 
425 aa  192  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  31.42 
 
 
425 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  29.88 
 
 
446 aa  188  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  31.18 
 
 
432 aa  188  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  28.81 
 
 
438 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  28.16 
 
 
426 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  27.87 
 
 
436 aa  183  6e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  28.04 
 
 
431 aa  182  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  30.11 
 
 
445 aa  181  4e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  29.17 
 
 
438 aa  180  4.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  32.64 
 
 
441 aa  175  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1940  trigger factor  29.18 
 
 
447 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2233  trigger factor  28.95 
 
 
447 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0292986  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  30.37 
 
 
436 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  27.95 
 
 
438 aa  172  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  29.16 
 
 
439 aa  170  5e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  28.76 
 
 
428 aa  169  7e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  27.75 
 
 
435 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  27.06 
 
 
435 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  25.98 
 
 
428 aa  167  5.9999999999999996e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  24.52 
 
 
433 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  29.97 
 
 
434 aa  166  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  27.35 
 
 
434 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  26.82 
 
 
435 aa  164  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  29.12 
 
 
428 aa  163  6e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  29.42 
 
 
436 aa  162  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  27.23 
 
 
440 aa  161  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  28.09 
 
 
428 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  27.25 
 
 
448 aa  160  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1735  trigger factor  27.06 
 
 
433 aa  161  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  30.23 
 
 
434 aa  160  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1464  trigger factor  27.38 
 
 
435 aa  160  6e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  26.86 
 
 
434 aa  160  7e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  27.7 
 
 
427 aa  159  8e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  30.23 
 
 
434 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  27.79 
 
 
434 aa  159  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  30.77 
 
 
430 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  30.23 
 
 
434 aa  159  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  30.23 
 
 
434 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0198  trigger factor  26.88 
 
 
435 aa  159  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  28.18 
 
 
500 aa  159  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  27.84 
 
 
444 aa  157  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  27.49 
 
 
434 aa  157  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  27.71 
 
 
449 aa  157  4e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  28.36 
 
 
434 aa  157  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  31.66 
 
 
471 aa  157  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  26.22 
 
 
437 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  28.67 
 
 
432 aa  156  6e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  27.68 
 
 
434 aa  156  8e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  26.07 
 
 
435 aa  156  9e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  29.9 
 
 
436 aa  156  9e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  28.03 
 
 
427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2341  trigger factor  27.21 
 
 
435 aa  154  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0955017  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0843  trigger factor  26.34 
 
 
544 aa  153  5e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.793444  normal  0.0950155 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  26.04 
 
 
434 aa  153  7e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000061134  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  27.71 
 
 
432 aa  153  7e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  30.87 
 
 
435 aa  153  7e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  28.79 
 
 
434 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  27.1 
 
 
442 aa  152  8.999999999999999e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  27.85 
 
 
432 aa  152  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  27.85 
 
 
432 aa  152  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  27.85 
 
 
432 aa  152  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  27.85 
 
 
432 aa  152  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>