More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_00181 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_00181  PilT1-like protein  100 
 
 
358 aa  735    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0019  twitching motility protein  85.79 
 
 
360 aa  634    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  71.55 
 
 
374 aa  538  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  69.47 
 
 
362 aa  536  1e-151  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  68.45 
 
 
372 aa  528  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  68.73 
 
 
374 aa  530  1e-149  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1611  twitching motility protein  68.73 
 
 
372 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1637  twitching motility protein  68.73 
 
 
372 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.601857  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4183  twitching motility protein  67.89 
 
 
372 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212541 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1747  twitching motility protein  61.06 
 
 
370 aa  441  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.555642  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1188  twitching motility protein  54 
 
 
358 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231991  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06901  twitching motility protein  52.11 
 
 
357 aa  378  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.595138  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  55.46 
 
 
367 aa  380  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  52.49 
 
 
347 aa  370  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0537  twitching motility protein  52.45 
 
 
344 aa  365  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  51.74 
 
 
347 aa  365  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3053  twitching motility protein  54.71 
 
 
346 aa  365  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39006  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  52.68 
 
 
360 aa  364  1e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  51 
 
 
351 aa  364  1e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  52.91 
 
 
344 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  52.91 
 
 
344 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  52.33 
 
 
344 aa  362  4e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  51.1 
 
 
360 aa  362  8e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5318  pilus retraction protein PilT  52.16 
 
 
344 aa  361  1e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  52.34 
 
 
345 aa  360  2e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03090  Pilus retraction protein  52.87 
 
 
344 aa  360  3e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.166876  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  52.05 
 
 
347 aa  359  3e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  48.59 
 
 
397 aa  358  6e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  49.86 
 
 
382 aa  358  8e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  52.05 
 
 
345 aa  358  9e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  52.34 
 
 
345 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  52.34 
 
 
345 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  52.34 
 
 
345 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  51.3 
 
 
344 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3760  Pili biogenesis ATPase  49.57 
 
 
347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112866  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  52.05 
 
 
345 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  49.3 
 
 
368 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  51.75 
 
 
345 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1068  twitching motility protein  50.43 
 
 
347 aa  355  5.999999999999999e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.365161 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  51.75 
 
 
345 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  51.75 
 
 
345 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  51.3 
 
 
349 aa  355  6.999999999999999e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  50.43 
 
 
349 aa  355  7.999999999999999e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  51.46 
 
 
345 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  49.86 
 
 
378 aa  355  8.999999999999999e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  49.85 
 
 
347 aa  354  1e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  51.14 
 
 
351 aa  354  1e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  52.34 
 
 
345 aa  354  1e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  51.59 
 
 
344 aa  354  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0267  pilus retraction protein PilT  51.87 
 
 
350 aa  354  2e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  50.45 
 
 
349 aa  353  2e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  51.75 
 
 
345 aa  353  2e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  51.46 
 
 
345 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  51.62 
 
 
344 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0293  twitching motility protein  51.3 
 
 
350 aa  353  4e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3640  twitching motility protein PilT  50.72 
 
 
344 aa  352  5e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  48.47 
 
 
375 aa  352  5e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  51.75 
 
 
344 aa  352  5e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  50.88 
 
 
345 aa  352  5e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2414  twitching motility protein  50.14 
 
 
344 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  50 
 
 
365 aa  352  7e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2918  twitching motility protein PilT  50.14 
 
 
344 aa  351  8.999999999999999e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.683879  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0396  twitching motility protein  50.58 
 
 
347 aa  351  8.999999999999999e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4813  twitching motility protein  50.29 
 
 
347 aa  351  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2800  pilus retraction protein PilT  50.29 
 
 
347 aa  350  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0637  twitching motility protein  50 
 
 
347 aa  351  1e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  50.88 
 
 
349 aa  351  1e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1631  twitching motility protein  50 
 
 
347 aa  351  1e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0179805 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  49.57 
 
 
347 aa  349  3e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  50.15 
 
 
345 aa  350  3e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  48.16 
 
 
351 aa  349  4e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0412  twitching motility protein  49.42 
 
 
347 aa  349  5e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0420  twitching motility protein  49.42 
 
 
347 aa  349  5e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  49.86 
 
 
347 aa  348  6e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  50.58 
 
 
347 aa  348  6e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  48.31 
 
 
365 aa  348  7e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  51.34 
 
 
344 aa  348  1e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2936  twitching motility protein  49.42 
 
 
347 aa  348  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.745836  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  49.15 
 
 
363 aa  348  1e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  51.34 
 
 
344 aa  347  2e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3004  pilus retraction protein PilT  49.56 
 
 
345 aa  347  2e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1609  twitching motility protein  50.29 
 
 
345 aa  347  2e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.409997 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  47.89 
 
 
566 aa  346  4e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  48.73 
 
 
365 aa  346  5e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  48.58 
 
 
366 aa  345  5e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  49.16 
 
 
368 aa  346  5e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  49.71 
 
 
344 aa  345  6e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  49.28 
 
 
345 aa  345  6e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  48.3 
 
 
366 aa  345  8e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1688  twitching motility protein  50.3 
 
 
347 aa  345  8.999999999999999e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  47.61 
 
 
365 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  49.13 
 
 
347 aa  344  2e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  49.71 
 
 
349 aa  344  2e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  49.42 
 
 
344 aa  343  2e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  50.14 
 
 
403 aa  343  2e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  49.71 
 
 
349 aa  344  2e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  47.61 
 
 
366 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  48.87 
 
 
372 aa  342  4e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  48.96 
 
 
350 aa  343  4e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  53.73 
 
 
339 aa  342  4e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0974985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>