More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_00051 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  100 
 
 
297 aa  589  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0006  hypothetical protein  65.34 
 
 
293 aa  332  5e-90  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0006  TPR repeat-containing protein  63.41 
 
 
293 aa  330  2e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.437171  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00051  Flp pilus assembly protein TadD  49.05 
 
 
297 aa  252  6e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000470033 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0006  TPR repeat-containing protein  38.52 
 
 
287 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  37.31 
 
 
287 aa  193  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.589169  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  38.85 
 
 
287 aa  192  5e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  37.98 
 
 
276 aa  189  4e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1333  TPR repeat-containing protein  35.93 
 
 
288 aa  189  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  35.64 
 
 
284 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.668643  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0531  TPR repeat-containing protein  39.63 
 
 
287 aa  177  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.259397  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2856  TPR repeat-containing protein  35.38 
 
 
297 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  32.83 
 
 
291 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5036  tetratricopeptide TPR_2  29.86 
 
 
288 aa  127  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0840723  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2822  tetratricopeptide repeat-containing protein  32.55 
 
 
290 aa  126  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0986349  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3161  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 
297 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2957  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 
297 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338311  normal  0.060469 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4071  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.73 
 
 
291 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  27.88 
 
 
1694 aa  89.4  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 
878 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.85 
 
 
810 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 
1192 aa  68.9  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  29.9 
 
 
505 aa  66.2  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 
3172 aa  65.9  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25.56 
 
 
725 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 
409 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.19 
 
 
1056 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  36.21 
 
 
718 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  31.71 
 
 
733 aa  62.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  28.78 
 
 
699 aa  62.8  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 
3301 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  30.13 
 
 
3145 aa  61.6  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.09 
 
 
632 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  30.32 
 
 
647 aa  62  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  24.7 
 
 
927 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  24.38 
 
 
279 aa  60.8  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 
649 aa  60.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  27.27 
 
 
576 aa  60.1  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 
573 aa  60.5  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 
3035 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  32.37 
 
 
535 aa  60.1  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 
1276 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  25.47 
 
 
676 aa  59.3  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.68 
 
 
1737 aa  59.3  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  27.72 
 
 
462 aa  58.9  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 
732 aa  58.9  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 
602 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 
4079 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  31.21 
 
 
315 aa  58.5  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  32.48 
 
 
623 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  30.27 
 
 
648 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  29.63 
 
 
340 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  28.67 
 
 
622 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  26.42 
 
 
391 aa  56.6  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  24.39 
 
 
661 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 
3560 aa  57  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  31.25 
 
 
1154 aa  57  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 
637 aa  56.6  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 
1276 aa  56.6  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  24.1 
 
 
562 aa  56.2  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.6 
 
 
988 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.16 
 
 
543 aa  56.2  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  21.56 
 
 
314 aa  56.2  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0195  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 
247 aa  55.1  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  27.87 
 
 
1979 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  28.85 
 
 
875 aa  55.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 
280 aa  55.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.36 
 
 
784 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  29.3 
 
 
865 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 
409 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 
311 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 
595 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1897  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 
214 aa  54.3  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2362  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.65 
 
 
256 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.78 
 
 
406 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 
270 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.78 
 
 
406 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  28 
 
 
864 aa  54.3  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1311  hypothetical protein  26.03 
 
 
331 aa  54.3  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 
634 aa  53.9  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 
270 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  27.84 
 
 
708 aa  53.9  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.23 
 
 
730 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  31.12 
 
 
620 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 
685 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 
909 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  21.88 
 
 
560 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0908  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 
388 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  23.16 
 
 
448 aa  53.5  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  25.39 
 
 
366 aa  53.5  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1009  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 
273 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0715627  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3518  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.73 
 
 
320 aa  53.5  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.86 
 
 
373 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  41.98 
 
 
762 aa  53.5  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0882  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 
388 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
681 aa  52.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 
565 aa  53.1  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 
619 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  29.5 
 
 
764 aa  53.1  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 
626 aa  52.8  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>