More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_00041 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  46.84 
 
 		 813 aa  748    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1367  DNA gyrase, A subunit  52.12 
 
 		 839 aa  734    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1332  DNA topoisomerase IV subunit A  57.2 
 
 		 827 aa  1004    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.393205  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2854  DNA topoisomerase IV subunit A  52.04 
 
 		 835 aa  777    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  57.44 
 
 		 827 aa  1007    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.885734 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1360  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  51.43 
 
 		 835 aa  731    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0005  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  73.24 
 
 		 806 aa  1156    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0005  DNA topoisomerase IV subunit A  70.77 
 
 		 822 aa  1164    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.793608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  62.38 
 
 		 828 aa  1115    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707356 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0005  DNA topoisomerase IV subunit A  46.27 
 
 		 813 aa  740    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.44739  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1694  DNA topoisomerase IV subunit A  54.47 
 
 		 858 aa  803    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  49.01 
 
 		 813 aa  789    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.768882  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1390  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  51.16 
 
 		 843 aa  734    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.113611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  100 
 
 		 829 aa  1668    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1901  DNA topoisomerase IV subunit A  66.87 
 
 		 873 aa  682    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2820  DNA gyrase subunit A  52.45 
 
 		 835 aa  767    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0257012  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0929  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  49.14 
 
 		 848 aa  737    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  48.51 
 
 		 813 aa  754    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4667  DNA gyrase subunit A  43.58 
 
 		 853 aa  629  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0531  DNA gyrase subunit A  47.51 
 
 		 869 aa  619  1e-176  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.897683  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4464  DNA gyrase subunit A  46.89 
 
 		 872 aa  613  9.999999999999999e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.32353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1074  DNA gyrase subunit A  46.84 
 
 		 863 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11531  DNA gyrase subunit A  46.84 
 
 		 863 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2787  DNA gyrase subunit A  43.03 
 
 		 864 aa  606  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.124644  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11271  DNA gyrase subunit A  46.31 
 
 		 881 aa  604  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.865928 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11691  DNA gyrase subunit A  45.68 
 
 		 865 aa  601  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11681  DNA gyrase subunit A  46.14 
 
 		 865 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0578  DNA gyrase subunit A  46.4 
 
 		 857 aa  599  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0254  DNA gyrase subunit A  46.71 
 
 		 856 aa  601  1e-170  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0561  DNA gyrase subunit A  46.4 
 
 		 857 aa  599  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15231  DNA gyrase subunit A  45.96 
 
 		 872 aa  597  1e-169  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0689  DNA gyrase subunit A  46.1 
 
 		 872 aa  597  1e-169  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.39823  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1942  DNA gyrase subunit A  46.68 
 
 		 865 aa  593  1e-168  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.72276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09151  DNA gyrase subunit A  47.63 
 
 		 875 aa  595  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.403302 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4186  DNA gyrase subunit A  46.76 
 
 		 885 aa  591  1e-167  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.327784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0723  DNA gyrase subunit A  46.94 
 
 		 886 aa  588  1e-166  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.217067  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  43.35 
 
 		 802 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  40.98 
 
 		 839 aa  556  1e-157  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  41.1 
 
 		 839 aa  558  1e-157  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  41.42 
 
 		 825 aa  549  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  40.97 
 
 		 807 aa  548  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  40.86 
 
 		 823 aa  542  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  40.8 
 
 		 823 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  40.8 
 
 		 823 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  40.8 
 
 		 823 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  40.6 
 
 		 823 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  40.86 
 
 		 823 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  43.42 
 
 		 812 aa  541  9.999999999999999e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000800696  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  40.8 
 
 		 823 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  40.8 
 
 		 823 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  40.8 
 
 		 823 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1263  DNA gyrase, A subunit  39.54 
 
 		 808 aa  541  9.999999999999999e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  40.73 
 
 		 823 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  38.15 
 
 		 807 aa  536  1e-151  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  39.25 
 
 		 818 aa  538  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  40.16 
 
 		 821 aa  534  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0008  DNA gyrase, A subunit  38.22 
 
 		 819 aa  532  1e-150  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  41.31 
 
 		 814 aa  530  1e-149  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  41.36 
 
 		 820 aa  530  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0005  DNA gyrase, A subunit  39.97 
 
 		 836 aa  531  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0005  DNA gyrase, A subunit  39.97 
 
 		 836 aa  528  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301958 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3049  DNA gyrase, A subunit  41.41 
 
 		 965 aa  523  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.288748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0007  DNA gyrase, A subunit  38.76 
 
 		 811 aa  525  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1067  DNA gyrase, A subunit  38.8 
 
 		 809 aa  523  1e-147  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0137  DNA gyrase, A subunit  37.12 
 
 		 826 aa  523  1e-147  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0005  DNA gyrase, A subunit  38.69 
 
 		 832 aa  523  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28121  predicted protein  52.15 
 
 		 897 aa  524  1e-147  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0542452  normal  0.0190346 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1476  DNA gyrase subunit A  40.61 
 
 		 913 aa  520  1e-146  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0249688 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0540  DNA gyrase subunit A  40.43 
 
 		 930 aa  520  1e-146  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0267481  normal  0.364195 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0004  DNA gyrase, A subunit  38.27 
 
 		 857 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  49.8 
 
 		 818 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2804  DNA gyrase subunit A  38.81 
 
 		 949 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.371561  hitchhiker  0.000745999 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1801  DNA gyrase subunit A  42.32 
 
 		 913 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.303162  normal  0.145926 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0005  DNA gyrase, A subunit  51.6 
 
 		 835 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.170541  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2192  DNA gyrase, A subunit  37.78 
 
 		 853 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0272  DNA gyrase, A subunit  40 
 
 		 816 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00337054  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1688  DNA gyrase subunit A  37.09 
 
 		 864 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.352233  normal  0.651217 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1332  DNA gyrase subunit A  41.24 
 
 		 912 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0828  hypothetical protein  37.62 
 
 		 816 aa  518  1.0000000000000001e-145  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.725746 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00070  DNA gyrase, A subunit  39.69 
 
 		 816 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2871  DNA gyrase subunit A  38.2 
 
 		 922 aa  516  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.236942  normal  0.0392982 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1287  DNA gyrase subunit A  40.96 
 
 		 907 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2630  DNA gyrase subunit A  40.96 
 
 		 907 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4317  DNA gyrase, A subunit  41.47 
 
 		 914 aa  514  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0088  DNA gyrase, subunit A  40.76 
 
 		 828 aa  514  1e-144  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4447  DNA gyrase, A subunit  41.34 
 
 		 914 aa  513  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.950017 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33633  predicted protein  39.25 
 
 		 818 aa  514  1e-144  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0303682  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1400  DNA gyrase subunit A  41.28 
 
 		 929 aa  513  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2473  DNA gyrase, A subunit  39.6 
 
 		 809 aa  514  1e-144  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335285 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4181  DNA gyrase, A subunit  41.48 
 
 		 911 aa  515  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.549723  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1630  DNA gyrase, A subunit  40.54 
 
 		 809 aa  509  1e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  38.85 
 
 		 893 aa  510  1e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0027  DNA gyrase, A subunit  38.55 
 
 		 848 aa  509  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000124476  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0007  DNA gyrase, A subunit  50.5 
 
 		 901 aa  510  1e-143  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.607285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0125  DNA gyrase, A subunit  37.33 
 
 		 828 aa  510  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000507659  decreased coverage  0.00116524 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1873  DNA gyrase subunit A  42.72 
 
 		 946 aa  509  1e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0970945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  38.05 
 
 		 834 aa  509  1e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1241  DNA gyrase subunit A  40.65 
 
 		 931 aa  509  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.998227  normal  0.707625 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0005  DNA gyrase, A subunit  37.56 
 
 		 843 aa  510  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000262861  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  50.2 
 
 		 809 aa  510  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>