89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_18531 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_18531  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  100 
 
 		 185 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00727116  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1755  TPR repeat-containing protein  94.59 
 
 		 185 aa  330  6e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18721  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  96.22 
 
 		 185 aa  329  1e-89  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18531  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  85.41 
 
 		 185 aa  322  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.564635  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17891  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  49.19 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0230228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21321  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  49.41 
 
 		 185 aa  169  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.285628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1261  TPR repeat-containing protein  48.82 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00551  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  46.15 
 
 		 187 aa  158  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0053  TPR repeat-containing protein  45.18 
 
 		 171 aa  147  6e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.406426  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0056  hypothetical protein  45.16 
 
 		 172 aa  144  9e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1274  TPR repeat-containing protein  37.42 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.891871 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0180  TPR repeat-containing protein  39.63 
 
 		 178 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.684496 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1137  TPR repeat-containing protein  38.04 
 
 		 177 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1167  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.04 
 
 		 177 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3320  TPR repeat-containing protein  35.09 
 
 		 180 aa  99.4  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3450  TPR repeat-containing protein  35.8 
 
 		 174 aa  97.1  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4306  TPR repeat-containing protein  35.19 
 
 		 174 aa  88.6  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1883  TPR repeat-containing protein  36.6 
 
 		 175 aa  85.5  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6274  predicted protein  28.83 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000285986  hitchhiker  0.0027813 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.44 
 
 		 1022 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0768  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 258 aa  49.7  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.638517  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  34.29 
 
 		 582 aa  49.7  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 		 269 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 392 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.03 
 
 		 293 aa  48.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.17 
 
 		 818 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.5 
 
 		 988 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.68 
 
 		 1056 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 		 1276 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 		 1056 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 284 aa  46.2  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  24.3 
 
 		 1406 aa  45.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  36.59 
 
 		 1049 aa  45.1  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.17 
 
 		 784 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  33.33 
 
 		 875 aa  44.7  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0699  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 563 aa  44.7  0.0009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000888687 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  27.52 
 
 		 626 aa  44.7  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  29.61 
 
 		 809 aa  44.3  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 512 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 1827 aa  44.3  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 605 aa  43.9  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 566 aa  43.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 		 611 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 		 687 aa  43.9  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 750 aa  44.3  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2255  hypothetical protein  34.52 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  31.58 
 
 		 1056 aa  44.3  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 		 635 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.17 
 
 		 1737 aa  43.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  35.23 
 
 		 750 aa  43.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 		 635 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 448 aa  43.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  40.98 
 
 		 688 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4440  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 393 aa  43.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0901  tfp pilus assembly protein PilF  37.14 
 
 		 246 aa  43.5  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1622  tetratricopeptide TPR_2  28.71 
 
 		 247 aa  43.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247403 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0112  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.33 
 
 		 546 aa  43.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.559777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 643 aa  43.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  33.93 
 
 		 539 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  38.3 
 
 		 936 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 592 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4580  photosystem I assembly protein Ycf3  35.38 
 
 		 182 aa  42.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 		 595 aa  42.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  30.08 
 
 		 267 aa  42.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0900  TPR repeat-containing protein  35.59 
 
 		 172 aa  42.7  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00123871  normal  0.293983 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 		 4489 aa  42.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 		 187 aa  42.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 1450 aa  42.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 		 562 aa  42.4  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  29.84 
 
 		 706 aa  42.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 636 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 612 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3751  tetratricopeptide TPR_2  32.77 
 
 		 204 aa  42  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87227  normal  0.451472 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.87 
 
 		 839 aa  42  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.56 
 
 		 747 aa  42  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0996  TPR repeat-containing protein  36.49 
 
 		 499 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468556 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32173  predicted protein  27.27 
 
 		 575 aa  42  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.623051  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  31 
 
 		 1550 aa  42  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.13 
 
 		 689 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1972  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 		 255 aa  42  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 617 aa  41.6  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3497  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 178 aa  42  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767668 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  40.32 
 
 		 718 aa  42  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 639 aa  41.2  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 833 aa  41.2  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 1038 aa  41.2  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0116  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 207 aa  40.8  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.266905 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  29.31 
 
 		 493 aa  40.8  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 		 352 aa  40.8  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>