More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_18271 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_18271  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 190 aa  387  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.125602  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18461  translation initiation factor IF-3  98.95 
 
 		 190 aa  384  1e-106  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1729  translation initiation factor IF-3  95.79 
 
 		 190 aa  357  8e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18251  translation initiation factor IF-3  95.77 
 
 		 195 aa  354  5e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.412706  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17631  translation initiation factor IF-3  86.17 
 
 		 202 aa  326  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0131  translation initiation factor IF-3  84.66 
 
 		 217 aa  319  9.999999999999999e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.122365  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0085  translation initiation factor IF-3  84.66 
 
 		 217 aa  319  9.999999999999999e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01551  translation initiation factor IF-3  84.57 
 
 		 219 aa  318  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1215  translation initiation factor IF-3  84.04 
 
 		 202 aa  311  3.9999999999999997e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20901  translation initiation factor IF-3  82.54 
 
 		 202 aa  310  1e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.240556  normal  0.63143 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0065  translation initiation factor IF-3  66.48 
 
 		 184 aa  259  1e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2038  translation initiation factor IF-3  69.23 
 
 		 177 aa  251  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.369536 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0441  translation initiation factor IF-3  69.05 
 
 		 179 aa  250  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.077533  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4675  translation initiation factor IF-3  68.64 
 
 		 177 aa  250  1e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.361003  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0802  translation initiation factor IF-3  70.29 
 
 		 176 aa  243  9e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0830  translation initiation factor IF-3  70.29 
 
 		 176 aa  243  9e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1924  translation initiation factor IF-3  70 
 
 		 177 aa  240  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0930  translation initiation factor 3  62.13 
 
 		 178 aa  235  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  48.37 
 
 		 357 aa  186  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 		 164 aa  177  9e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  49.7 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  46.11 
 
 		 222 aa  175  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  48 
 
 		 204 aa  174  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11652  predicted protein  53.85 
 
 		 186 aa  174  6e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 		 202 aa  173  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  49.09 
 
 		 227 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  50.61 
 
 		 187 aa  172  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 		 171 aa  172  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14590  translation initiation factor 3  46.33 
 
 		 401 aa  171  5e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  48.77 
 
 		 179 aa  171  5e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  51.81 
 
 		 190 aa  171  5.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1249  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 		 174 aa  170  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.246001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5483  translation initiation factor IF-3  49.09 
 
 		 250 aa  170  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3039  translation initiation factor IF-3  45.56 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271102  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  49.08 
 
 		 198 aa  167  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1875  translation initiation factor IF-3  45.61 
 
 		 239 aa  167  8e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.384688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  45.41 
 
 		 219 aa  167  9e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  46.51 
 
 		 243 aa  166  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  47.09 
 
 		 194 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  47.09 
 
 		 194 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1477  translation initiation factor 3  46.99 
 
 		 396 aa  166  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0613769  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2054  translation initiation factor IF-3  50.66 
 
 		 152 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000423398  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  44.38 
 
 		 205 aa  165  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  48.15 
 
 		 202 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  49.7 
 
 		 173 aa  165  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1103  translation initiation factor IF-3  45.51 
 
 		 233 aa  165  2.9999999999999998e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0433779  normal  0.928932 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  48.12 
 
 		 173 aa  165  4e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1480  translation initiation factor IF-3  46.99 
 
 		 356 aa  165  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000187235 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  45.93 
 
 		 194 aa  164  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1301  translation initiation factor 3  48.7 
 
 		 175 aa  164  5e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  49.08 
 
 		 172 aa  164  9e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  50.98 
 
 		 165 aa  164  9e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22440  translation initiation factor 3  46.67 
 
 		 329 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  49.02 
 
 		 154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  46.24 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1624  translation initiation factor IF-3  46.06 
 
 		 415 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.640548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2996  translation initiation factor 3  45.03 
 
 		 238 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171641  normal  0.0309942 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  48.15 
 
 		 190 aa  162  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2139  translation initiation factor IF-3  48.08 
 
 		 177 aa  162  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0045601  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2981  translation initiation factor 3  45.03 
 
 		 238 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3025  translation initiation factor 3  45.03 
 
 		 238 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  44.79 
 
 		 277 aa  162  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3328  translation initiation factor IF-3  44.44 
 
 		 243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  46.75 
 
 		 173 aa  161  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  47.24 
 
 		 197 aa  161  5.0000000000000005e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  46.34 
 
 		 182 aa  161  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1882  translation initiation factor IF-3  46.58 
 
 		 204 aa  161  6e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0284235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  46.63 
 
 		 164 aa  160  9e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3071  translation initiation factor IF-3  46.79 
 
 		 182 aa  160  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427548  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0265  translation initiation factor IF-3  46.75 
 
 		 173 aa  160  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.910814  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11658  translation initiation factor IF-3  45.4 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  48.78 
 
 		 178 aa  159  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  48.78 
 
 		 178 aa  159  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  46.3 
 
 		 195 aa  159  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  45.66 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  46.3 
 
 		 195 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  46.3 
 
 		 195 aa  159  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  46.3 
 
 		 195 aa  159  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2066  translation initiation factor 3  47.44 
 
 		 179 aa  159  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.383221  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  46.91 
 
 		 166 aa  159  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  46.3 
 
 		 186 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  43.79 
 
 		 175 aa  159  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  44.71 
 
 		 174 aa  159  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  45.2 
 
 		 178 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  45.03 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  46.91 
 
 		 166 aa  159  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1218  translation initiation factor IF-3  47.13 
 
 		 173 aa  158  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0326522  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  46.3 
 
 		 166 aa  158  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  46.3 
 
 		 166 aa  158  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  45.06 
 
 		 180 aa  158  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  46.3 
 
 		 166 aa  158  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2538  translation initiation factor IF-3  44.97 
 
 		 173 aa  158  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.838605  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0475  translation initiation factor IF-3  46.95 
 
 		 253 aa  158  5e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0218  translation initiation factor IF-3  42.37 
 
 		 200 aa  158  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1316  translation initiation factor IF-3  43.68 
 
 		 351 aa  157  7e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  48.03 
 
 		 181 aa  157  7e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  45.4 
 
 		 198 aa  157  7e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  47.02 
 
 		 192 aa  157  8e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  44.63 
 
 		 204 aa  157  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  43.35 
 
 		 207 aa  157  9e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>