More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_18251 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  55.05 
 
 		 640 aa  678    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  51.11 
 
 		 665 aa  672    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1617  DNA topoisomerase IV subunit B  52.66 
 
 		 656 aa  657    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000200667  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  52.88 
 
 		 642 aa  666    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  54.52 
 
 		 640 aa  668    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  51.3 
 
 		 654 aa  689    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0002  DNA gyrase, B subunit  53.88 
 
 		 638 aa  677    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  56.73 
 
 		 642 aa  718    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  54.83 
 
 		 643 aa  663    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0862  DNA gyrase, B subunit  54.6 
 
 		 652 aa  694    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557988 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  81.18 
 
 		 655 aa  1080    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  54.83 
 
 		 640 aa  672    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3617  DNA topoisomerase IV subunit B  53.45 
 
 		 654 aa  659    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000282926  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18441  DNA gyrase subunit B  98.02 
 
 		 655 aa  1325    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.768958  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  54.91 
 
 		 636 aa  697    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  52.44 
 
 		 650 aa  637    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  57.67 
 
 		 640 aa  714    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  54.98 
 
 		 640 aa  672    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3392  DNA topoisomerase IV subunit B  53.45 
 
 		 654 aa  659    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00614907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  54.98 
 
 		 640 aa  672    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3355  DNA topoisomerase IV subunit B  53.45 
 
 		 654 aa  658    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000033182  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3608  DNA topoisomerase IV subunit B  53.45 
 
 		 654 aa  658    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.88333e-33 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  55.45 
 
 		 640 aa  679    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3304  DNA topoisomerase IV subunit B  53.45 
 
 		 654 aa  658    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418623  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0403  DNA gyrase, B subunit  51.6 
 
 		 659 aa  678    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3069  transcriptional regulator, XRE family  72.64 
 
 		 1191 aa  709    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.251884 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  54.67 
 
 		 640 aa  671    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1609  DNA topoisomerase IV subunit B  53.29 
 
 		 654 aa  654    Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000967673  decreased coverage  0.000000000000694445 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1213  DNA gyrase subunit B  81.34 
 
 		 655 aa  1082    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  52.85 
 
 		 644 aa  686    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  56.63 
 
 		 633 aa  712    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2517  DNA gyrase subunit B  74.19 
 
 		 645 aa  953    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000275107  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1453  DNA gyrase, B subunit  51 
 
 		 658 aa  654    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  53.74 
 
 		 640 aa  650    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  54.98 
 
 		 640 aa  672    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21316  predicted protein  56.04 
 
 		 727 aa  718    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  52.35 
 
 		 644 aa  666    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  80.83 
 
 		 655 aa  1087    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  52.83 
 
 		 637 aa  670    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  81.29 
 
 		 655 aa  1083    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3706  DNA topoisomerase IV subunit B  53.61 
 
 		 654 aa  657    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3624  DNA topoisomerase IV subunit B  53.45 
 
 		 654 aa  659    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000439989  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  52.74 
 
 		 651 aa  708    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  54.98 
 
 		 640 aa  672    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  53.45 
 
 		 654 aa  659    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000134084  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  54.11 
 
 		 642 aa  688    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1727  DNA gyrase subunit B  95.88 
 
 		 655 aa  1260    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22827  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2491  DNA gyrase subunit B  76.35 
 
 		 645 aa  983    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434823 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  82.73 
 
 		 658 aa  1106    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0041  DNA gyrase, B subunit  50.71 
 
 		 634 aa  635    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  56.66 
 
 		 634 aa  724    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2247  DNA topoisomerase IV subunit B  53.13 
 
 		 654 aa  655    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000227299  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  55.88 
 
 		 640 aa  736    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  53.63 
 
 		 651 aa  682    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  52.96 
 
 		 675 aa  702    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  58.32 
 
 		 638 aa  730    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  54.1 
 
 		 627 aa  664    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01571  DNA gyrase subunit B  81.16 
 
 		 655 aa  1092    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  90.69 
 
 		 655 aa  1234    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3285  DNA topoisomerase IV subunit B  53.38 
 
 		 654 aa  656    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014971  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  55.28 
 
 		 632 aa  728    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0966  DNA gyrase, B subunit  53.09 
 
 		 650 aa  679    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  56.92 
 
 		 644 aa  709    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  52.72 
 
 		 642 aa  660    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  55.3 
 
 		 640 aa  676    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  53.3 
 
 		 656 aa  689    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  51.71 
 
 		 646 aa  678    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  54.98 
 
 		 640 aa  672    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  53.79 
 
 		 644 aa  708    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4986  DNA gyrase, B subunit  51.92 
 
 		 651 aa  676    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  54.6 
 
 		 636 aa  693    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  52.11 
 
 		 652 aa  697    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  57.89 
 
 		 638 aa  699    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  57.89 
 
 		 638 aa  699    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  57.57 
 
 		 641 aa  717    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  58.75 
 
 		 633 aa  725    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  53.14 
 
 		 643 aa  686    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  54.66 
 
 		 633 aa  701    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30508  predicted protein  56.31 
 
 		 662 aa  733    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.351472 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  55.8 
 
 		 650 aa  713    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  54.48 
 
 		 651 aa  673    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2993  DNA gyrase subunit B  73.88 
 
 		 645 aa  947    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0005  DNA gyrase subunit B  50.84 
 
 		 652 aa  640    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.986745  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  53.86 
 
 		 637 aa  685    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  57.38 
 
 		 635 aa  721    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1311  DNA gyrase subunit B  74.88 
 
 		 641 aa  953    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.78635 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  54.9 
 
 		 637 aa  710    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  52.53 
 
 		 650 aa  635    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1282  DNA gyrase subunit B  74.88 
 
 		 641 aa  953    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  53.74 
 
 		 640 aa  650    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  54.84 
 
 		 628 aa  723    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  52.7 
 
 		 644 aa  684    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2816  DNA gyrase subunit B  74.5 
 
 		 645 aa  955    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0322238  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0995  DNA gyrase, B subunit  54.39 
 
 		 645 aa  664    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0442  DNA gyrase, B subunit  52.55 
 
 		 634 aa  640    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  54.25 
 
 		 643 aa  689    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18251  DNA gyrase subunit B  100 
 
 		 655 aa  1345    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  56.14 
 
 		 635 aa  688    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  53.62 
 
 		 649 aa  677    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  54.94 
 
 		 642 aa  680    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>