241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_17761 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_17761  putative ribonuclease D  100 
 
 		 211 aa  427  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17921  putative ribonuclease D  96.68 
 
 		 211 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1676  putative ribonuclease D  91.94 
 
 		 211 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17711  putative ribonuclease D  78.1 
 
 		 213 aa  340  8e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.606229  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20321  putative ribonuclease D  57.62 
 
 		 214 aa  257  1e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1157  putative ribonuclease D  57.14 
 
 		 214 aa  256  3e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17051  putative ribonuclease D  57.77 
 
 		 214 aa  251  7e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1922  3'-5' exonuclease  54.77 
 
 		 214 aa  248  7e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0431536  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0407  3'-5' exonuclease  56.06 
 
 		 214 aa  247  7e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.23143  normal  0.475558 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1914  3'-5' exonuclease  53.77 
 
 		 209 aa  237  8e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0678  3'-5' exonuclease  51.66 
 
 		 211 aa  237  1e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1621  3'-5' exonuclease  56.57 
 
 		 207 aa  236  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.169628  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2509  3'-5' exonuclease  54.63 
 
 		 209 aa  233  1.0000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1118  3'-5' exonuclease  52.91 
 
 		 210 aa  230  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1147  3'-5' exonuclease  52.91 
 
 		 210 aa  229  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2246  3'-5' exonuclease  53.03 
 
 		 217 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.520239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3799  3'-5' exonuclease  51.22 
 
 		 209 aa  216  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22631  putative ribonuclease D  52.97 
 
 		 212 aa  215  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.528712 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0419  3'-5' exonuclease  48.98 
 
 		 204 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3589  3'-5' exonuclease  47.96 
 
 		 203 aa  188  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0327  3'-5' exonuclease  48.97 
 
 		 213 aa  188  5e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0155  3'-5' exonuclease  50 
 
 		 204 aa  187  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.299764 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0047  3'-5' exonuclease  47.96 
 
 		 204 aa  185  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0659  3'-5' exonuclease  49.49 
 
 		 204 aa  184  7e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.265112 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2425  3'-5' exonuclease  43.19 
 
 		 209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0125  putative 3'-5' exonuclease family protein  48.47 
 
 		 204 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00602859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0572  3'-5' exonuclease  49.19 
 
 		 204 aa  183  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0878  3'-5' exonuclease  51.89 
 
 		 206 aa  182  4.0000000000000006e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0529  3'-5' exonuclease family protein  48.69 
 
 		 206 aa  181  7e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0174  3'-5' exonuclease  47.96 
 
 		 204 aa  181  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5922  3'-5' exonuclease  46.07 
 
 		 204 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0171  3'-5' exonuclease  46.95 
 
 		 206 aa  179  4e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2497  3'-5' exonuclease  41.31 
 
 		 209 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.308179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2720  3'-5' exonuclease  41.78 
 
 		 209 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.0609935 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1011  3'-5' exonuclease family protein  47.96 
 
 		 204 aa  177  1e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0881939  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5125  3'-5' exonuclease  46.94 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0268839  normal  0.933758 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1152  ribonuclease D  44.67 
 
 		 204 aa  176  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5275  3'-5' exonuclease  45.55 
 
 		 204 aa  176  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28449  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0179  3'-5' exonuclease  46.95 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00803697  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2813  3'-5' exonuclease  44.67 
 
 		 204 aa  176  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2609  3'-5' exonuclease  44.23 
 
 		 204 aa  175  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0228  3'-5' exonuclease  45.18 
 
 		 203 aa  175  5e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0816  3'-5' exonuclease  48.47 
 
 		 216 aa  174  9.999999999999999e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00362431  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2343  3'-5' exonuclease  48.92 
 
 		 205 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0333  3'-5' exonuclease  48.11 
 
 		 210 aa  174  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273167  normal  0.287022 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4954  3'-5' exonuclease  43.52 
 
 		 205 aa  174  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.332898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3251  3'-5' exonuclease  46.46 
 
 		 205 aa  173  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2775  3'-5' exonuclease  43.65 
 
 		 204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1669  3'-5' exonuclease  45.77 
 
 		 218 aa  171  9e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.335885  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0068  3'-5' exonuclease  42.58 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0196  3'-5' exonuclease  47.57 
 
 		 203 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2903  3'-5' exonuclease  41.98 
 
 		 205 aa  168  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.865613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0135  3'-5' exonuclease  46.53 
 
 		 205 aa  168  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0120  ribonuclease D  46.49 
 
 		 208 aa  167  8e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.818192  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0109  3'-5' exonuclease  44.68 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.378562  normal  0.35649 
 
 
-
 
NC_004310  BR0120  3'-5' exonuclease family protein  46.04 
 
 		 205 aa  166  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0117  3'-5' exonuclease family protein  46.04 
 
 		 205 aa  166  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3984  3'-5' exonuclease  44.44 
 
 		 205 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4028  3'-5' exonuclease  44.21 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3464  3'-5' exonuclease  44.32 
 
 		 208 aa  161  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4358  3'-5' exonuclease  44.21 
 
 		 208 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583903 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0027  3'-5' exonuclease  42.35 
 
 		 204 aa  158  6e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.189554  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1219  3'-5' exonuclease domain-containing protein  46.56 
 
 		 206 aa  157  9e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485799  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0015  3'-5' exonuclease  41.33 
 
 		 206 aa  147  9e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3191  3'-5' exonuclease  31.55 
 
 		 382 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3636  3'-5' exonuclease  33.13 
 
 		 381 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172491  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0414  3'-5' exonuclease  32.94 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1164  3'-5' exonuclease  30.6 
 
 		 550 aa  80.5  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0638405  normal  0.521406 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0237  3'-5' exonuclease  31.11 
 
 		 377 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000118749  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0221  3'-5' exonuclease  30.77 
 
 		 377 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  32.7 
 
 		 388 aa  74.7  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3389  3'-5' exonuclease  27.72 
 
 		 382 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2546  ribonuclease D  29.67 
 
 		 389 aa  72.4  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12160  ribonuclease D  35.97 
 
 		 392 aa  72  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0326  ribonuclease D  31.61 
 
 		 392 aa  72  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0491656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1337  ribonuclease D  32.08 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118451  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5400  Ribonuclease D  29.38 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0443  ribonuclease D, putative  28.26 
 
 		 381 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0186  ribonuclease D, putative  31.82 
 
 		 392 aa  68.6  0.00000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0042  ribonuclease D  32.14 
 
 		 395 aa  68.6  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00728921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1249  ribonuclease D  29.56 
 
 		 381 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606694  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06230  ribonuclease D  32.28 
 
 		 399 aa  67  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000184069  hitchhiker  0.0058155 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1752  ribonuclease D  32.41 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00607213  normal  0.281233 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2522  ribonuclease D  28.5 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000280385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4287  3'-5' exonuclease  29.94 
 
 		 409 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.276505  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0703  3'-5' exonuclease  33.33 
 
 		 386 aa  65.9  0.0000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.807909  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5131  ribonuclease D  28.4 
 
 		 389 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1102  ribonuclease D  28.93 
 
 		 381 aa  65.5  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.447104 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  28.8 
 
 		 393 aa  65.9  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6686  Ribonuclease D  29.53 
 
 		 400 aa  65.5  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2542  ribonuclease D  28.18 
 
 		 385 aa  65.1  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  29.81 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4526  ribonuclease D  29.11 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780043  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0323  RNase D  30.99 
 
 		 375 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.85777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0300  putative ribonuclease D  33.33 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  29.81 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  27.75 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2762  ribonuclease D  31.45 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.713242 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2211  3'-5' exonuclease  30.64 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.493178  normal  0.0213505 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0601  DNA-directed DNA polymerase  32.65 
 
 		 587 aa  63.2  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>