More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_16971 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  100 
 
 
218 aa  451  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  92.66 
 
 
218 aa  424  1e-118  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  89.45 
 
 
218 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  85.32 
 
 
218 aa  398  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  71.03 
 
 
220 aa  327  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  70.56 
 
 
220 aa  325  3e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  69.59 
 
 
220 aa  324  7e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  69.81 
 
 
220 aa  318  5e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  62.98 
 
 
217 aa  285  2.9999999999999996e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  60.58 
 
 
211 aa  272  3e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0882  peptidase S16, lon-like  54.07 
 
 
218 aa  228  7e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000972451 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1285  peptidase S16, lon  50.24 
 
 
216 aa  217  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00129165  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0664  peptidase S16 lon domain-containing protein  51.18 
 
 
216 aa  217  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  52.15 
 
 
213 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  52.17 
 
 
212 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  52.17 
 
 
212 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0706  peptidase S16 lon domain protein  47.39 
 
 
216 aa  198  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.383851  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0478  peptidase S16, lon-like  47.37 
 
 
212 aa  197  7e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.06422  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2898  peptidase S16 lon domain protein  33.84 
 
 
220 aa  97.1  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000438482  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  33.33 
 
 
213 aa  97.1  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  30.35 
 
 
241 aa  88.2  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.25 
 
 
232 aa  88.2  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.81 
 
 
233 aa  85.1  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.02 
 
 
213 aa  84  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  26.5 
 
 
828 aa  82.4  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4129  ATP-dependent protease La  27.49 
 
 
825 aa  81.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.170203 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0885  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.16 
 
 
232 aa  80.9  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465483  hitchhiker  0.0012634 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  31.44 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2036  ATP-dependent protease La  28.49 
 
 
800 aa  80.5  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.326048  normal  0.210205 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  26.94 
 
 
780 aa  79.3  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4088  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.57 
 
 
233 aa  79  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.211402 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1793  peptidase S16 lon domain protein  32.02 
 
 
213 aa  79  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  33.33 
 
 
221 aa  79  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.69 
 
 
224 aa  78.6  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1193  ATP-dependent protease La  27.46 
 
 
833 aa  77.8  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  30.29 
 
 
226 aa  76.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  25.5 
 
 
843 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1487  peptidase S16, lon-like protein  37.61 
 
 
203 aa  77  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  25.5 
 
 
835 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  25.5 
 
 
835 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3340  peptidase S16 lon domain protein  28.77 
 
 
225 aa  76.3  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000299764  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  27.92 
 
 
823 aa  75.1  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4663  peptidase S16 lon domain protein  35.51 
 
 
208 aa  74.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112882  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5918  ATP-dependent protease La  29.44 
 
 
829 aa  73.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  28.71 
 
 
840 aa  73.6  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2666  peptidase S16, lon-like protein  38.68 
 
 
216 aa  73.9  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0836  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.53 
 
 
221 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827096 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1864  peptidase S16 lon domain protein  35.58 
 
 
219 aa  72  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5189  peptidase S16 lon domain protein  31.39 
 
 
222 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2169  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.68 
 
 
218 aa  72  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.830411  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4463  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.12 
 
 
222 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526428 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0267  peptidase S16, lon-like  38.32 
 
 
209 aa  71.2  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2518  Lon-A peptidase  25.76 
 
 
799 aa  70.5  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.571942  normal  0.381839 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2046  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.64 
 
 
228 aa  70.5  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143093  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0055  peptidase S16, lon-like  36.36 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2370  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.86 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  27.06 
 
 
819 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2954  peptidase S16, lon-like protein  38.46 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2992  ATP-dependent protease La  28.57 
 
 
813 aa  69.3  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  35.96 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2128  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.16 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  27.92 
 
 
805 aa  68.9  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1432  peptidase S16, lon-like  34.34 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103336  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3666  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.15 
 
 
204 aa  68.2  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3006  ATP-dependent protease La  25.63 
 
 
797 aa  68.2  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1311  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.06 
 
 
227 aa  68.2  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28291  hitchhiker  0.00327586 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0295  peptidase S16, lon-like  28.57 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0350179 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0455  peptidase S16, lon-like  29.1 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0971742  normal  0.103028 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0269  peptidase S16 lon domain protein  28.65 
 
 
225 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.713172  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4373  ATP-dependent protease La  26.09 
 
 
816 aa  67.4  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.574007  normal  0.577886 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0265  peptidase S16, lon-like  34.15 
 
 
223 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2647  ATP-dependent protease La  27.05 
 
 
804 aa  66.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.272722 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1457  Lon-A peptidase  26.73 
 
 
808 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181081  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  27.06 
 
 
816 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2915  ATP-dependent protease La  25 
 
 
805 aa  66.2  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0423  peptidase S16, lon-like  32.08 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2793  peptidase S16 lon domain-containing protein  36 
 
 
222 aa  65.9  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.609971  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.43 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.43 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0508  peptidase S16 lon domain protein  28.8 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7794  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.6 
 
 
786 aa  65.5  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0810999  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  28.43 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.43 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1340  ATP-dependent protease La  25.12 
 
 
802 aa  65.5  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0924778 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  25.98 
 
 
812 aa  65.1  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  26.61 
 
 
817 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2209  peptidase S16 lon domain protein  33.33 
 
 
222 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.124882 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2198  peptidase S16 lon domain protein  34.58 
 
 
219 aa  65.1  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.305968  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  26.61 
 
 
816 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  41.49 
 
 
210 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  41.49 
 
 
210 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0074  peptidase S16  27.75 
 
 
224 aa  64.7  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0481573 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  41.49 
 
 
210 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  41.49 
 
 
210 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2754  ATP-dependent protease La  26.49 
 
 
817 aa  64.7  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  41.49 
 
 
210 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0906  ATP-dependent protease La  27.51 
 
 
810 aa  64.7  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  41.49 
 
 
210 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3243  peptidase S16 lon domain protein  26.18 
 
 
265 aa  64.7  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  41.49 
 
 
210 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>