131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_16501 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1553  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  88.08 
 
 
428 aa  754    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16621  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  87.38 
 
 
428 aa  749    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.371034  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16501  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  100 
 
 
428 aa  840    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16391  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  70.26 
 
 
428 aa  614  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0990  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  41.23 
 
 
426 aa  348  1e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137792  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15791  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  42.29 
 
 
429 aa  340  4e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04711  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  38.26 
 
 
432 aa  333  4e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18591  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  41.23 
 
 
426 aa  330  4e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0472  putative C-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  37.47 
 
 
426 aa  327  3e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2204  putative C-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  34.85 
 
 
432 aa  301  1e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4997  ResB family protein  35.09 
 
 
459 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0535  ResB family protein  32.25 
 
 
461 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0552  ResB family protein  32.25 
 
 
461 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0322  c-type cytochrome biogenesis protein  32.92 
 
 
456 aa  229  6e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0627  ResB-like  33.01 
 
 
472 aa  224  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.305133  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2291  ResB family protein  31.78 
 
 
458 aa  219  7e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.35037 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3674  ResB family protein  30.51 
 
 
457 aa  209  7e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3824  ResB-like  29.76 
 
 
461 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27799  chloroplast cytochrome c biogenesis protein, Ccs1-like protein  29.05 
 
 
448 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1104  ResB family protein  23.27 
 
 
457 aa  104  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0859447  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0530  ResB family protein  28.93 
 
 
429 aa  102  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1119  ResB family protein  24.1 
 
 
457 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00407825  normal  0.622731 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3358  ResB family protein  22.82 
 
 
434 aa  99  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181016  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2074  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  24.94 
 
 
336 aa  97.8  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2229  ResB-like cytochrome c biosythesis protein  21.32 
 
 
457 aa  90.1  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0702  ResB family protein  26.47 
 
 
395 aa  89.7  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2901  ResB-like  22.32 
 
 
452 aa  88.6  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000032859  normal  0.767475 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1397  ResB family protein  29.38 
 
 
538 aa  88.2  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2221  ResB family protein  24.5 
 
 
553 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0244398  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3816  resB protein  27.99 
 
 
541 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000491918 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1384  resB protein  28.7 
 
 
541 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.615548  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1495  resB protein  28.7 
 
 
541 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1529  resB protein  27.99 
 
 
541 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1567  resB protein  28.7 
 
 
541 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.70106e-23 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1529  ResB family protein  25.16 
 
 
694 aa  84.3  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.469704  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3842  ResB family protein  23.53 
 
 
453 aa  84  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000782388  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1356  cytochrome c biogenesis protein  28.1 
 
 
541 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788517  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0613  ResB-like family protein  22.28 
 
 
454 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.051368  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3146  ResB-like  24.92 
 
 
733 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176659  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2757  ResB family protein  24.12 
 
 
455 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1895  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  22.52 
 
 
446 aa  80.9  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.541938  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1198  ResB family protein  28.06 
 
 
542 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0090  ResB family protein  23.8 
 
 
679 aa  79.7  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0039  ResB family protein  24.84 
 
 
678 aa  79.7  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0400  ResB family protein  25.08 
 
 
554 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3283  ResB-like protein  24.19 
 
 
750 aa  78.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0696  ResB family protein  22.73 
 
 
458 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.129347  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1491  ResB family protein  25.85 
 
 
535 aa  78.6  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.388611  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1635  resB protein  27.11 
 
 
541 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.749283  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1357  cytochrome c biogenesis protein  27.41 
 
 
541 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1599  resB protein  26.39 
 
 
541 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.85607  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2199  ResB-like  22.62 
 
 
423 aa  77.4  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2588  ResB family protein  21.88 
 
 
454 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000492342  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0665  ResB family protein  24.27 
 
 
742 aa  75.5  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.335724  hitchhiker  0.00675242 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2917  ResB family protein  24.27 
 
 
734 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105711 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3264  ResB family protein  24.83 
 
 
734 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.201427 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0711  ResB family protein  23.55 
 
 
717 aa  73.6  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.2296 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0360  ResB family protein  21.21 
 
 
737 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2726  ResB-like  21.21 
 
 
737 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0381  ResB family protein  21.21 
 
 
737 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0433  putative cytochrome c-type biogenesis transmembrane protein  24.19 
 
 
679 aa  73.6  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265528  normal  0.13422 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3742  ResB-like family protein  19.75 
 
 
718 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00865077  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3771  putative cytochrome C biogenesis protein  19.75 
 
 
718 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3136  cytochrome c assembly family protein  19.75 
 
 
718 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1957  cytochrome c assembly family protein  19.75 
 
 
718 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3713  putative cytochrome C biogenesis protein  20.25 
 
 
725 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3511  cytochrome c assembly family protein  20.25 
 
 
725 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0186  cytochrome c-type biogenesis protein  25.32 
 
 
670 aa  72.4  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229857  normal  0.30032 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3035  cytochrome c assembly family protein  20.86 
 
 
719 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0773  ResB-like  24.25 
 
 
739 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3480  ResB-like/cytochrome c biosynthesis protein  22.52 
 
 
738 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0691  ResB family protein  23.23 
 
 
717 aa  72  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.371554  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0309  ResB family protein  21.52 
 
 
738 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0116353  normal  0.247341 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0300  ResB family protein  21.52 
 
 
740 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4838  ResB family protein  23.32 
 
 
724 aa  71.2  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399827  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0630  ResB family protein  23.2 
 
 
572 aa  71.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.153575  hitchhiker  0.00598835 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17950  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  22.78 
 
 
565 aa  71.2  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3089  ResB family protein  26.52 
 
 
588 aa  70.1  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5588  ResB family protein  23.62 
 
 
727 aa  69.7  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.946506 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2169  ResB family protein  27.96 
 
 
700 aa  68.6  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3454  ResB family protein  22.65 
 
 
452 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000344779  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0985  ResB family protein  21.58 
 
 
732 aa  67.8  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2986  putative cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  22.41 
 
 
700 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0233  ResB-like protein  24.01 
 
 
660 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.96355 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3520  ResB family protein  22.63 
 
 
452 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428253 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0347  cytochrome C biogenesis protein  23.15 
 
 
740 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00552206 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0748  ResB-like protein  21.21 
 
 
484 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0282  ResB family protein  21.87 
 
 
738 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.877931  normal  0.492979 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3610  ResB family protein  22.04 
 
 
737 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12153  hitchhiker  0.0000000885403 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2806  ResB family protein  21.45 
 
 
741 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.924998  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4472  ResB family protein  25.37 
 
 
550 aa  63.9  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4303  ResB family protein  25.37 
 
 
550 aa  63.9  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4203  ResB family protein  25.37 
 
 
550 aa  63.9  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0825  ResB family protein  21.58 
 
 
522 aa  63.5  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.633442  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0048  ResB-like  24.5 
 
 
664 aa  63.2  0.000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000246708  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3290  ResB family protein  27.78 
 
 
576 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3252  ResB family protein  24.42 
 
 
558 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0625944  normal  0.0386797 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4429  ResB family protein  22.97 
 
 
544 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0548  ResB family protein  22.08 
 
 
461 aa  62.4  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2852  ResB family protein  21.2 
 
 
701 aa  61.2  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.199509  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>