201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_16341 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1537  small GTP-binding protein domain-containing protein  82.32 
 
 
413 aa  662    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16461  GTPase SAR1  85.47 
 
 
413 aa  688    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16341  GTPase SAR1 and related small G protein  100 
 
 
413 aa  807    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16231  GTPase SAR1 and related small G proteins  65.13 
 
 
413 aa  519  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.283634  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  37.59 
 
 
440 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  35.18 
 
 
440 aa  249  6e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  34.84 
 
 
440 aa  249  7e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04921  GTPase SAR1  32.93 
 
 
441 aa  246  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0497  GTPase  28.68 
 
 
420 aa  214  2.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2178  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.31 
 
 
431 aa  187  2e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.995116  normal  0.41065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.16 
 
 
492 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1080  small GTP-binding protein  28.21 
 
 
484 aa  166  5.9999999999999996e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0499  small GTP-binding protein  28.89 
 
 
475 aa  160  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362987  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1436  small GTP-binding protein  29.5 
 
 
479 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741449  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  28.99 
 
 
489 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1407  small GTP-binding protein  29.25 
 
 
479 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  27.51 
 
 
566 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1616  small GTP-binding protein  27.35 
 
 
453 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206677 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3709  small GTP-binding protein  29.92 
 
 
462 aa  145  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  24.88 
 
 
472 aa  141  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4509  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.05 
 
 
457 aa  137  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2342  small GTP-binding protein  26.62 
 
 
448 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2393  small GTP-binding protein  26.62 
 
 
448 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3839  small GTP-binding protein  26.35 
 
 
481 aa  122  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.674432 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0764  GTP-binding protein HSR1-related  24.8 
 
 
469 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0145  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.02 
 
 
517 aa  94.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07771  GTPase SAR1 and related small G proteins  26.67 
 
 
517 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0362439 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1544  small GTP-binding protein domain-containing protein  24.57 
 
 
517 aa  90.9  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  22.92 
 
 
531 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  22.66 
 
 
531 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4459  small GTP-binding protein  25.29 
 
 
520 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859915  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16501  GTPase SAR1 and related small G proteins  21.52 
 
 
532 aa  87  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.569133 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0884  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.65 
 
 
499 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102699  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  22.81 
 
 
529 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1709  small GTP-binding protein domain-containing protein  23.04 
 
 
513 aa  84.7  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000711006  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1260  hypothetical protein  21.19 
 
 
529 aa  84.3  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09991  GTPase SAR1 and related small G proteins  28.37 
 
 
496 aa  84  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10221  GTPase SAR1 and related small G protein  21.34 
 
 
516 aa  82.8  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.524471  normal  0.183753 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  22.9 
 
 
506 aa  82.8  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09451  GTPase SAR1  26.58 
 
 
499 aa  81.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1210  small GTP-binding protein domain-containing protein  23.32 
 
 
529 aa  79.7  0.00000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09441  GTPase SAR1 and related small G protein  27.17 
 
 
499 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1904  GTP-binding protein, HSR1-related  22.16 
 
 
545 aa  76.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30473  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0819  tRNA modification GTPase TrmE  33.16 
 
 
452 aa  57  0.0000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0524  GTP-binding protein EngA  28.47 
 
 
439 aa  56.2  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3840  hypothetical protein  25.3 
 
 
492 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.693476 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  30.77 
 
 
548 aa  55.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0117  tRNA modification GTPase TrmE  26.67 
 
 
455 aa  55.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  30.77 
 
 
546 aa  54.3  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  29.19 
 
 
301 aa  53.9  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1098  GTP-binding protein EngA  29.79 
 
 
441 aa  53.5  0.000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4193  hypothetical protein  20.47 
 
 
471 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.296514 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2089  small GTP-binding protein domain-containing protein  25.93 
 
 
637 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000643797  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_2271  predicted protein  23.03 
 
 
489 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0993  hypothetical protein  20.3 
 
 
459 aa  51.6  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.455493 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  36.76 
 
 
458 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2527  hypothetical protein  22.05 
 
 
463 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0392  GTP-binding protein EngA  30.08 
 
 
494 aa  50.8  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1758  small GTP-binding protein  27.81 
 
 
448 aa  50.4  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0053  GTP-binding protein EngA  25.95 
 
 
460 aa  50.8  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  28.07 
 
 
297 aa  50.4  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0223  small GTP-binding protein  28.23 
 
 
440 aa  50.4  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294804  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4307  GTP-binding protein HSR1-related  24.82 
 
 
650 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4133  tRNA modification GTPase TrmE  38.02 
 
 
456 aa  50.1  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  34.07 
 
 
458 aa  49.7  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1572  GTP-binding protein EngA  29.38 
 
 
460 aa  49.7  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  29.08 
 
 
447 aa  49.3  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  35 
 
 
460 aa  49.3  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  32.06 
 
 
461 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0121  GTP-binding protein EngA  25.55 
 
 
452 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl014  tRNA modification GTPase TrmE  36.26 
 
 
452 aa  48.5  0.0002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0118  GTP-binding protein EngA  25.55 
 
 
452 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.132129 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4013  tRNA modification GTPase TrmE  34.75 
 
 
456 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.205295  normal  0.289015 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2662  small GTP-binding protein  25.71 
 
 
453 aa  48.9  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.144738  hitchhiker  0.00576403 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2103  GTP-binding protein EngA  25.49 
 
 
441 aa  48.9  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0680  GTP-binding protein Era  36.17 
 
 
290 aa  48.9  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3579  hypothetical protein  20.61 
 
 
463 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0435  GTP-binding protein EngA  29.86 
 
 
460 aa  47.8  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0504  GTP-binding protein EngA  26.67 
 
 
442 aa  48.1  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.696313  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3785  GTP-binding protein EngA  28.67 
 
 
436 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0456792  normal  0.0699486 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  28.57 
 
 
455 aa  47.8  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  32.81 
 
 
458 aa  47.8  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0916  small GTP-binding protein  28.48 
 
 
439 aa  47.8  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.704291  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1029  small GTP-binding protein  28.66 
 
 
184 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1428  GTP-binding protein EngA  28.67 
 
 
436 aa  47.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0409  GTP-binding protein EngA  29.86 
 
 
460 aa  47.8  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0548  tRNA modification GTPase TrmE  35.94 
 
 
442 aa  47.4  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  34.4 
 
 
460 aa  47.4  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0536  putative GTP-binding protein EngA  24.22 
 
 
473 aa  47.4  0.0005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  32.88 
 
 
458 aa  47  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  33.86 
 
 
459 aa  47  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2081  small GTP-binding protein  31.21 
 
 
416 aa  47  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000627073  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1409  tRNA modification GTPase TrmE  32.35 
 
 
452 aa  46.6  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  25.6 
 
 
632 aa  46.6  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1009  GTPase  26.49 
 
 
442 aa  46.6  0.0009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.369054  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2889  tRNA modification GTPase TrmE  29.77 
 
 
464 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  32.03 
 
 
458 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  32.03 
 
 
458 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0018  tRNA modification GTPase TrmE  33.86 
 
 
438 aa  45.8  0.001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1291  GTP-binding protein EngA  21.76 
 
 
436 aa  45.8  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0244351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>