37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_16041 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_16041  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  286  5.0000000000000004e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1506  hypothetical protein  55.71 
 
 
141 aa  170  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12421  hypothetical protein  53.57 
 
 
141 aa  163  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0597  hypothetical protein  40.29 
 
 
146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.403415  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13991  hypothetical protein  39.57 
 
 
146 aa  110  6e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1204  hypothetical protein  34.21 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.259392  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0594  hypothetical protein  33.91 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13891  hypothetical protein  33.91 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1633  hypothetical protein  31.43 
 
 
141 aa  61.2  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10991  double-stranded beta-helix domain-containing protein  26.76 
 
 
146 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0998  hypothetical protein  31.58 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12971  hypothetical protein  31.39 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.298883  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13041  hypothetical protein  30.66 
 
 
140 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1225  hypothetical protein  29.55 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02199  hypothetical protein  30.6 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1610  cupin 2, barrel  27.4 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000344419 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1314  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.09 
 
 
166 aa  44.3  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000442476  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0909  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.04 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167326  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3656  cupin 2, barrel  25.96 
 
 
148 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110053  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0868  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.03 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1250  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.41 
 
 
193 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5021  cupin region  32.31 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00533136  normal  0.0498556 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5602  cupin 2 domain-containing protein  34.74 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.418121 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5257  cupin 2, barrel  34.74 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2157  cupin 2, barrel  25.51 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0974853 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1978  cupin 2 domain-containing protein  25.17 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0092  hypothetical protein  32.29 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16011  hypothetical protein  26.61 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8356 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0300  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.96 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2380  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.33 
 
 
231 aa  41.2  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1831  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.31 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137972  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1726  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.18 
 
 
150 aa  41.2  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.680674  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4626  cupin 2 domain-containing protein  33.68 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000448523 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2343  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.45 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04261  hypothetical protein  21.74 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.648244  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5795  cupin 2 domain-containing protein  31.63 
 
 
135 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732811  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.18 
 
 
112 aa  40.8  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>