More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_13281 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_13281  membrane fusion protein  100 
 
 
353 aa  689  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.403546  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1235  secretion protein HlyD  96.6 
 
 
353 aa  669  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.681968  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13141  membrane fusion protein  97.45 
 
 
353 aa  672  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13031  membrane fusion protein  83.85 
 
 
353 aa  593  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0747  secretion protein HlyD  47.67 
 
 
357 aa  330  3e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.554021  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15871  membrane fusion protein  47.47 
 
 
357 aa  330  3e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12131  membrane fusion protein  45.65 
 
 
356 aa  313  4e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.502636 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1965  secretion protein HlyD  43.71 
 
 
388 aa  283  3e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.455875 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08701  membrane fusion protein  41 
 
 
392 aa  283  3e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0694  secretion protein HlyD  39.4 
 
 
417 aa  255  1e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.459164  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.35 
 
 
432 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0553  secretion protein HlyD  35.65 
 
 
450 aa  157  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1966  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.16 
 
 
487 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1993  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.16 
 
 
487 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.702751  normal  0.0246521 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.78 
 
 
504 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  37.63 
 
 
489 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  35.68 
 
 
500 aa  140  4e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0926  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.5 
 
 
490 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  30.7 
 
 
517 aa  126  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  25.35 
 
 
400 aa  111  2e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1628  RND family efflux transporter MFP subunit  25.36 
 
 
326 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.39 
 
 
416 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4041  hypothetical protein  24.75 
 
 
366 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0972  secretion protein HlyD  26.05 
 
 
353 aa  101  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0336  secretion protein HlyD  27.63 
 
 
324 aa  100  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0816826  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0365  membrane-fusion protein  27.86 
 
 
394 aa  99.8  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0913  hypothetical protein  25.87 
 
 
338 aa  99.4  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4493  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.94 
 
 
367 aa  99  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1945  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.38 
 
 
322 aa  98.2  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0769  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.17 
 
 
322 aa  97.8  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.100875  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0495  secretion protein HlyD  24.93 
 
 
323 aa  98.2  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3271  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.86 
 
 
380 aa  97.4  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.525557  normal  0.197401 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1649  RND family efflux transporter MFP subunit  24.7 
 
 
354 aa  97.8  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.499517  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0621  RND family efflux transporter MFP subunit  25.84 
 
 
311 aa  97.4  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  3.87759e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0090  putative multidrug transporter, HlyD family  24.27 
 
 
368 aa  97.1  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  23.89 
 
 
360 aa  97.1  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56880  putative membrane fusion protein  24.17 
 
 
376 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0882  hypothetical protein  25.17 
 
 
338 aa  97.1  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.65 
 
 
397 aa  97.1  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  2.97953e-07 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  25.68 
 
 
354 aa  96.7  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.79 
 
 
404 aa  97.1  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.6 
 
 
409 aa  96.3  7e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01077  HlyD family secretion protein  25.29 
 
 
376 aa  95.9  9e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.34 
 
 
354 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000238284  normal  0.23398 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0558  secretion protein HlyD  23.91 
 
 
360 aa  94.4  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177986  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 
354 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2521  RND family efflux transporter MFP subunit  25.34 
 
 
354 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.199325  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6009  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.96 
 
 
356 aa  94  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359632  normal  0.895367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8876  Membrane-fusion protein-like protein  26.85 
 
 
393 aa  94  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.67 
 
 
405 aa  93.2  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4943  RND efflux membrane fusion protein precursor  23.06 
 
 
375 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4014  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.93 
 
 
362 aa  93.2  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181773  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3749  RND family efflux transporter MFP subunit  24.27 
 
 
340 aa  93.2  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.43 
 
 
351 aa  92.8  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2229  RND family efflux transporter MFP subunit  25.65 
 
 
405 aa  92.4  9e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1830  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 
359 aa  92  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495597  normal  0.102007 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  24.03 
 
 
369 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2634  RND family efflux transporter MFP subunit  25.34 
 
 
354 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  25.08 
 
 
358 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.23 
 
 
366 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  24.04 
 
 
367 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5198  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.54 
 
 
366 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197197  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2550  RND family efflux transporter MFP subunit  23.05 
 
 
360 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000229958  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1796  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.05 
 
 
360 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  4.36323e-06  hitchhiker  1.1193e-07 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.6 
 
 
419 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321445  normal  0.921537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  25.08 
 
 
358 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1580  RND family efflux transporter MFP subunit  20.34 
 
 
365 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610408  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1781  RND family efflux transporter MFP subunit  23.14 
 
 
368 aa  90.9  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.253325  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2213  secretion protein HlyD  22.19 
 
 
407 aa  91.3  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2665  RND family efflux transporter MFP subunit  23.05 
 
 
360 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000267288  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1288  RND family efflux transporter MFP subunit  20.68 
 
 
365 aa  90.9  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  24.35 
 
 
361 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1122  RND family efflux transporter MFP subunit  24.24 
 
 
366 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1496  RND family efflux transporter MFP subunit  20.34 
 
 
365 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1814  RND family efflux transporter MFP subunit  24.24 
 
 
432 aa  90.5  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0078  RND family efflux transporter MFP subunit  20.34 
 
 
365 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0383  RND family efflux transporter MFP subunit  20.34 
 
 
365 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  20.34 
 
 
365 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1201  RND family efflux transporter MFP subunit  20.34 
 
 
365 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1924  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.18 
 
 
352 aa  90.5  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.896235 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1044  RND family efflux transporter MFP subunit  20.34 
 
 
365 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  24.6 
 
 
383 aa  90.5  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4207  RND family efflux transporter MFP subunit  23.57 
 
 
366 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  24.66 
 
 
354 aa  90.1  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1658  RND family efflux transporter MFP subunit  23.39 
 
 
360 aa  90.1  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000232607  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2410  RND family efflux transporter MFP subunit  23.39 
 
 
360 aa  90.1  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000315716  hitchhiker  0.00636413 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  23.39 
 
 
360 aa  90.1  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00136978  hitchhiker  1.41161e-05 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2820  RND family efflux transporter MFP subunit  23.49 
 
 
363 aa  90.1  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120499  normal  0.368522 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0105  RND family efflux transporter MFP subunit  22.26 
 
 
348 aa  89.7  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2192  secretion protein HlyD  24.19 
 
 
352 aa  89.7  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1372  secretion protein HlyD  24.58 
 
 
405 aa  89.4  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203736  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2588  RND family efflux transporter MFP subunit  22.71 
 
 
360 aa  89.4  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  7.07575e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  25.39 
 
 
417 aa  89.4  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1440  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.58 
 
 
374 aa  88.6  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1752  RND family efflux transporter MFP subunit  23.7 
 
 
369 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1783  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.14 
 
 
354 aa  89  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  21.78 
 
 
367 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0747  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.61 
 
 
405 aa  88.6  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413213  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  24.74 
 
 
366 aa  89  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  25 
 
 
354 aa  88.6  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>