More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_11761 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 299 aa  606  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  95.33 
 
 		 300 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  94 
 
 		 300 aa  570  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  94 
 
 		 300 aa  570  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  75.92 
 
 		 299 aa  467  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  76.69 
 
 		 306 aa  464  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  75.59 
 
 		 299 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  76.01 
 
 		 300 aa  461  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  77.74 
 
 		 296 aa  442  1e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0739  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  77.74 
 
 		 296 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.396283  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  60.82 
 
 		 301 aa  348  8e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  57.82 
 
 		 309 aa  346  3e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  57.82 
 
 		 309 aa  346  3e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  58.84 
 
 		 309 aa  343  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  57.72 
 
 		 312 aa  340  2e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  56.12 
 
 		 320 aa  339  4e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  56.31 
 
 		 307 aa  334  9e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  56.76 
 
 		 316 aa  332  4e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  55.82 
 
 		 295 aa  324  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  55.48 
 
 		 295 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  54.42 
 
 		 337 aa  314  9.999999999999999e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  49.83 
 
 		 294 aa  298  7e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  56.12 
 
 		 297 aa  290  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  54.42 
 
 		 297 aa  289  4e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  49.32 
 
 		 297 aa  288  5.0000000000000004e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  54.39 
 
 		 297 aa  287  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  47.95 
 
 		 296 aa  284  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  52.04 
 
 		 297 aa  276  4e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  51.35 
 
 		 297 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  48.64 
 
 		 297 aa  273  2.0000000000000002e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  47.6 
 
 		 294 aa  271  7e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  47.14 
 
 		 297 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  49.49 
 
 		 296 aa  266  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  47.42 
 
 		 294 aa  265  7e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  49.83 
 
 		 295 aa  265  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  48.77 
 
 		 299 aa  263  3e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  47.24 
 
 		 297 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  46.76 
 
 		 295 aa  256  4e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  47.22 
 
 		 299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1668  geranyltranstransferase (farnesyldiphosphate synthase)  50.17 
 
 		 296 aa  248  7e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000016201  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  49.65 
 
 		 290 aa  248  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  46.02 
 
 		 297 aa  247  2e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  45.7 
 
 		 306 aa  246  4.9999999999999997e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  45.3 
 
 		 299 aa  244  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4288  geranyltranstransferase  46.74 
 
 		 296 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.185381  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  44.48 
 
 		 315 aa  241  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  48.08 
 
 		 294 aa  240  2e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4251  geranyltranstransferase  45.7 
 
 		 296 aa  240  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0195367  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0946  geranyltranstransferase  46.39 
 
 		 296 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.0000625392 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4308  geranyltranstransferase  45.7 
 
 		 296 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  45.82 
 
 		 299 aa  239  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2212  farnesyl-diphosphate synthase  44.33 
 
 		 294 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2441  Polyprenyl synthetase  48.84 
 
 		 318 aa  238  6.999999999999999e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3249  polyprenyl synthetase  44.33 
 
 		 294 aa  238  9e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923814  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2439  Polyprenyl synthetase  46.5 
 
 		 290 aa  238  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.097508  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  44.48 
 
 		 292 aa  238  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3775  polyprenyl synthetase  44.33 
 
 		 294 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0109984  normal  0.0572479 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0569  polyprenyl synthetase  44.18 
 
 		 301 aa  237  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0210108  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  43.99 
 
 		 293 aa  236  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3649  polyprenyl synthetase  44.52 
 
 		 294 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4487  polyprenyl synthetase  44.52 
 
 		 294 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3878  polyprenyl synthetase  44.52 
 
 		 294 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.235577 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2535  geranyltranstransferase  44.71 
 
 		 294 aa  235  8e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0843  geranyltranstransferase  44.71 
 
 		 294 aa  235  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  43.99 
 
 		 293 aa  235  8e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2393  geranyltranstransferase  44.71 
 
 		 294 aa  235  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1774  Polyprenyl synthetase  45.36 
 
 		 291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.284525  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0329  geranyltranstransferase  44.71 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0363  geranyltranstransferase  44.71 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1705  geranyltranstransferase  44.71 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2132  farnesyl-diphosphate synthase  45.76 
 
 		 296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.47194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0955  Polyprenyl synthetase  49.48 
 
 		 298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1511  geranyltranstransferase  44.71 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2871  polyprenyl synthetase  46.58 
 
 		 297 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4082  geranyltranstransferase  45.36 
 
 		 296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3920  geranyltranstransferase  45.36 
 
 		 296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00628392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3931  geranyltranstransferase  45.36 
 
 		 296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4198  geranyltranstransferase  45.36 
 
 		 296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.116270000000001e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4402  geranyltranstransferase  45.36 
 
 		 296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4030  polyprenyl synthetase  45.36 
 
 		 297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20600  geranyltranstransferase  48.97 
 
 		 295 aa  233  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.715859  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07880  geranyltranstransferase  48.97 
 
 		 295 aa  233  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408699  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  44.08 
 
 		 300 aa  233  3e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4821  polyprenyl synthetase  43.84 
 
 		 294 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  41.98 
 
 		 297 aa  229  4e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  43.77 
 
 		 298 aa  229  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1400  Polyprenyl synthetase  45.61 
 
 		 286 aa  228  9e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  45.89 
 
 		 297 aa  228  9e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  45.1 
 
 		 294 aa  228  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0613  geranyltranstransferase  44.37 
 
 		 294 aa  226  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2616  farnesyl-diphosphate synthase  45.02 
 
 		 294 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.394724 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  43.94 
 
 		 291 aa  225  7e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  47.22 
 
 		 295 aa  225  9e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  45.28 
 
 		 293 aa  224  1e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1613  polyprenyl synthetase  47.17 
 
 		 293 aa  224  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1580  polyprenyl synthetase  47.17 
 
 		 293 aa  224  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.211276  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2437  polyprenyl synthetase  44.98 
 
 		 298 aa  224  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  41.14 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0605  polyprenyl synthetase  46.74 
 
 		 295 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.173751 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  45.59 
 
 		 305 aa  223  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>