More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_09931 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_09931  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 
514 aa  1048    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0902215  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09481  methionyl-tRNA synthetase  75.15 
 
 
511 aa  781    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09951  methionyl-tRNA synthetase  96.3 
 
 
514 aa  993    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0934  methionyl-tRNA synthetase  93.74 
 
 
511 aa  943    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1140  methionyl-tRNA synthetase  60.08 
 
 
514 aa  628  1e-179  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.266684  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14741  methionyl-tRNA synthetase  55.53 
 
 
515 aa  625  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0426231 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08971  methionyl-tRNA synthetase  58.82 
 
 
509 aa  622  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.931117  decreased coverage  0.000000449236 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0342  methionyl-tRNA synthetase  57.81 
 
 
516 aa  612  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.190132  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10151  methionyl-tRNA synthetase  58.2 
 
 
516 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145983 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1334  methionyl-tRNA synthetase  56.7 
 
 
514 aa  610  1e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0404003 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4034  methionyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 
535 aa  528  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.461216  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0095  methionyl-tRNA synthetase  50.29 
 
 
530 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3992  methionyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 
535 aa  528  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1806  methionyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 
530 aa  515  1.0000000000000001e-145  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.0000579293 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1142  methionyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 
525 aa  511  1e-144  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.873399  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2723  methionyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 
530 aa  509  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.148224 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4858  methionyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 
533 aa  504  1e-141  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000526962  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3334  methionyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 
531 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178326  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
629 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
629 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 
653 aa  422  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 
634 aa  422  1e-117  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1694  methionyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 
511 aa  414  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00103031  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2321  methionyl-tRNA synthetase  41.17 
 
 
509 aa  413  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000064425  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 
654 aa  414  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0043  methionyl-tRNA synthetase  42 
 
 
655 aa  413  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3156  methionyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 
509 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000108199  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1056  methionyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
509 aa  409  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000270708 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2232  methionyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 
510 aa  409  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0033  methionyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 
648 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.984575  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 
650 aa  406  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 
650 aa  407  1.0000000000000001e-112  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 
632 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000521971  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3207  methionyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 
509 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000597609  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0359  methionyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 
493 aa  402  1e-111  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
645 aa  402  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 
653 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0031  methionyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 
650 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1949  methionyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 
508 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2847  methionyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 
645 aa  395  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2533  methionyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 
645 aa  398  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2115  methionyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 
512 aa  396  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000589281  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 
628 aa  393  1e-108  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1662  methionyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 
506 aa  395  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0049  methionyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 
645 aa  391  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000287272  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0842  methionyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 
666 aa  389  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04890  methionyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 
526 aa  386  1e-106  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.733065  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0041  methionyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 
516 aa  388  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.367271  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1459  methionyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 
500 aa  385  1e-105  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 
651 aa  385  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1514  methionyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 
525 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  41 
 
 
647 aa  380  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1557  methionyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 
665 aa  381  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 
634 aa  380  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1622  methionyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 
638 aa  379  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0065  methionyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 
518 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000885531  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  37.26 
 
 
660 aa  375  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 
659 aa  375  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  37.26 
 
 
660 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  37.64 
 
 
660 aa  376  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0175  methionyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 
539 aa  378  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.7084 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 
660 aa  374  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 
660 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 
660 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6468  methionyl-tRNA synthetase  37.43 
 
 
515 aa  375  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556327  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0673  methionyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 
642 aa  374  1e-102  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.999123  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 
660 aa  373  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 
660 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1701  methionyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 
519 aa  372  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0498077  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 
660 aa  375  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  37.57 
 
 
660 aa  372  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  37.7 
 
 
647 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000025899  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2661  methionyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 
529 aa  372  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.539364 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29029  predicted protein  39.35 
 
 
574 aa  371  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0486  methionyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 
523 aa  371  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3113  methionyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 
520 aa  368  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.249665  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_004310  BR0995  methionyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 
515 aa  367  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2079  methionyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 
515 aa  368  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87065  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31516  predicted protein  38.35 
 
 
591 aa  365  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0962  methionyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 
515 aa  367  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0933149  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0106  methionyl-tRNA synthetase  37.33 
 
 
533 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000102629  hitchhiker  0.0000228434 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2533  methionyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 
519 aa  369  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308491  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07450  methionyl-tRNA synthetase  37.31 
 
 
526 aa  365  1e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.988423 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3171  methionyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 
530 aa  364  2e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1746  methionyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 
675 aa  364  2e-99  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1583  methionyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 
517 aa  364  3e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2030  methionyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 
671 aa  363  5.0000000000000005e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1085  methionyl-tRNA synthetase  36.81 
 
 
536 aa  363  6e-99  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4187  methionyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 
522 aa  363  6e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2158  methionyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 
525 aa  362  7.0000000000000005e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.99655  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0352  methionyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 
545 aa  362  8e-99  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.338459  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2273  methionyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
519 aa  361  2e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000444544 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1490  methionyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 
523 aa  361  2e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1930  methionyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 
514 aa  360  2e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.640558  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1000  methionyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 
506 aa  360  3e-98  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6921  methionyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 
515 aa  360  4e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276994  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4558  methionyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 
522 aa  360  5e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.118201 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0210  methionyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 
675 aa  359  6e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0300  methionyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 
702 aa  359  6e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0807  methionyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 
506 aa  359  7e-98  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>