151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_07841 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0734  hypothetical protein  94.82 
 
 		 328 aa  638    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.536853  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07841  RNA processing exonuclease  96.95 
 
 		 328 aa  652    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07841  beta-lactamase fold exonuclease  100 
 
 		 328 aa  669    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.110589  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08581  RNA processing exonuclease  69.63 
 
 		 330 aa  474  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0814782  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1042  exonuclease  41.72 
 
 		 328 aa  310  2e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.251284  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1460  exonuclease involved in mRNA processing  42.99 
 
 		 328 aa  294  1e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.562175  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3872  hypothetical protein  43.45 
 
 		 348 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4134  hypothetical protein  42.04 
 
 		 348 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3523  RNA procession exonuclease  39.81 
 
 		 349 aa  281  2e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4860  putative mRNA 3-end processing factor  38.17 
 
 		 375 aa  275  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3043  putative mRNA 3-end processing factor  37.9 
 
 		 346 aa  272  5.000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0285628  normal  0.582199 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2561  putative mRNA 3-end processing factor  40.06 
 
 		 332 aa  268  7e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2959  mRNA 3'-end processing factor  37.5 
 
 		 332 aa  267  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.624115  hitchhiker  0.0000489273 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2916  mRNA 3'-end processing factor  38.02 
 
 		 362 aa  267  2e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0305  putative mRNA 3-end processing factor  36.56 
 
 		 366 aa  265  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0310  putative mRNA 3-end processing factor  37.58 
 
 		 366 aa  265  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.169646 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1212  hypothetical protein  40.13 
 
 		 344 aa  263  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3896  hypothetical protein  36.48 
 
 		 368 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.170406  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0374  putative mRNA 3-end processing factor  36.02 
 
 		 371 aa  262  4.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1582  RNA procession exonuclease-like protein  38.66 
 
 		 332 aa  262  6.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02275  hypothetical protein  38.92 
 
 		 347 aa  261  1e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1106  RNA processing exonuclease  40.13 
 
 		 338 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.599734 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6856  hypothetical protein  37.5 
 
 		 340 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.166328 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1519  hypothetical protein  37.7 
 
 		 340 aa  258  9e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1146  RNA procession exonuclease-like protein  40.13 
 
 		 338 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3335  RNA procession exonuclease  37.82 
 
 		 383 aa  256  5e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4306  RNA procession exonuclease-like protein  40.13 
 
 		 338 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2196  RNA procession exonuclease-like protein  39.81 
 
 		 335 aa  253  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.260801  hitchhiker  0.00381998 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1135  RNA procession exonuclease-like protein  38.22 
 
 		 338 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01738  mRNA 3'-end processing factor  39.54 
 
 		 340 aa  251  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5293  putative exonuclease involved in mRNA processing  39.37 
 
 		 382 aa  249  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4681  putative exonuclease involved in mRNA processing  37.93 
 
 		 350 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388572  normal  0.0823984 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1754  RNA procession exonuclease-like protein  41.67 
 
 		 351 aa  247  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1314  putative exonuclease involved in mRNA processing  38.1 
 
 		 383 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0772701  normal  0.174474 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2414  hypothetical protein  37.66 
 
 		 383 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1077  putative mRNA 3-end processing factor  37.66 
 
 		 383 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0552  hypothetical protein  36.39 
 
 		 347 aa  242  5e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2587  hypothetical protein  37.46 
 
 		 342 aa  242  7.999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136385 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1072  putative mRNA 3-end processing factor  37.5 
 
 		 344 aa  239  4e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0686869 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0750  putative mRNA 3-end processing factor  36.86 
 
 		 356 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1568  RNA procession exonuclease-like protein  37.06 
 
 		 358 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.359999 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0794  putative mRNA 3-end processing factor  37.38 
 
 		 349 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2665  putative mRNA 3-end processing factor  37.38 
 
 		 335 aa  235  7e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14848 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0150  exonuclease of the beta-lactamase fold involved in RNA processing-like protein  35.31 
 
 		 355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0799  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  36.39 
 
 		 348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.0112138 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0260  putative mRNA 3-end processing factor  33.03 
 
 		 344 aa  231  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00946134 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0871  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  36.27 
 
 		 348 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130781  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1540  putative mRNA 3-end processing factor  32.53 
 
 		 345 aa  229  5e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4616  putative mRNA 3-end processing factor  35.13 
 
 		 351 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0289  putative mRNA 3-end processing factor  32.62 
 
 		 337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.640549 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3978  RNA procession exonuclease-like protein  35 
 
 		 371 aa  225  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.107304  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0629  putative mRNA 3-end processing factor  33.75 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.88354  decreased coverage  0.00579405 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0461  hypothetical protein  35.58 
 
 		 390 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3431  putative mRNA 3-end processing factor  32.6 
 
 		 352 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.194998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4896  putative mRNA 3-end processing factor  34.5 
 
 		 335 aa  218  7.999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00669  RNA procession exonuclease-like protein  34.92 
 
 		 338 aa  217  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1612  RNA procession exonuclease-like protein  32.7 
 
 		 354 aa  217  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4043  putative mRNA 3-end processing factor  36.99 
 
 		 337 aa  215  8e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3560  putative mRNA 3-end processing factor  32.29 
 
 		 352 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.146642  normal  0.26456 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0913  putative exonuclease protein involved in mRNA processing  34.87 
 
 		 336 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.228952 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3236  putative mRNA 3-end processing factor  32.29 
 
 		 352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.193513 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3692  putative mRNA 3-end processing factor  31.97 
 
 		 351 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2803  putative mRNA 3-end processing factor  34.06 
 
 		 338 aa  212  7e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.196277 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6008  hypothetical protein  31.95 
 
 		 337 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0801  putative exonuclease protein involved in mRNA processing  34.74 
 
 		 336 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.157265 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1471  putative mRNA 3-end processing factor  32.44 
 
 		 348 aa  210  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0031  putative mRNA 3-end processing factor  33.44 
 
 		 334 aa  209  6e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.321442  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0411  putative exonuclease protein involved in mRNA processing  30.69 
 
 		 329 aa  206  5e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.894409 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0067  putative mRNA 3-end processing factor  31.9 
 
 		 357 aa  199  5e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1406  RNA procession exonuclease-like protein  32.41 
 
 		 313 aa  162  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0847473 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0060  putative mRNA 3'-end processing factor  26.09 
 
 		 330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0072  putative mRNA 3'-end processing factor  26.09 
 
 		 330 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0055  putative mRNA 3'-end processing factor  25.78 
 
 		 330 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0057  putative mRNA 3'-end processing factor  25.94 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.251824 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3148  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.48 
 
 		 1017 aa  130  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331414  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1113  hypothetical protein  26.48 
 
 		 321 aa  90.5  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.704257 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1313  beta-lactamase domain-containing protein  24.3 
 
 		 315 aa  89.7  6e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.143027  normal  0.259963 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1043  putative mRNA 3-end processing factor  26.71 
 
 		 319 aa  87.4  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0008566 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1883  putative mRNA 3-end processing factor  25.55 
 
 		 327 aa  85.5  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0973  putative mRNA 3-end processing factor  24.46 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.289039 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1132  hypothetical protein  26.79 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00888  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2687  beta-lactamase domain protein  23.72 
 
 		 591 aa  72.8  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0149  RNA procession exonuclease-like protein  24.58 
 
 		 327 aa  72.4  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0104249 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0788  putative mRNA 3-end processing factor  22.59 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1361  beta-lactamase domain protein  28 
 
 		 422 aa  60.5  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  23.64 
 
 		 821 aa  60.5  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0446  beta-lactamase domain-containing protein  23.64 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.279355  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1852  putative mRNA 3-end processing factor  23.96 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.681251  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0621  beta-lactamase domain-containing protein  23.29 
 
 		 317 aa  57  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2308  hypothetical protein  23.65 
 
 		 339 aa  57  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.146289  normal  0.484856 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1169  conserved hypothetical protein  23.7 
 
 		 328 aa  55.8  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.561924  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0930  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  22.82 
 
 		 410 aa  55.5  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1600  beta-lactamase domain-containing protein  23.8 
 
 		 421 aa  55.1  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0760665 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  27.27 
 
 		 452 aa  54.3  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2210  hypothetical protein  35.34 
 
 		 452 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  35.34 
 
 		 452 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  25.2 
 
 		 422 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0025  beta-lactamase domain-containing protein  22.37 
 
 		 432 aa  53.9  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  22.27 
 
 		 457 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  25.74 
 
 		 422 aa  53.1  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>