More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_05461 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0520  NAD binding site  88.53 
 
 
377 aa  659  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  100 
 
 
377 aa  765  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  93.85 
 
 
377 aa  715  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  73.94 
 
 
377 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05771  NAD binding site  52.12 
 
 
376 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.161819  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  51.85 
 
 
376 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07601  NAD binding site  47.3 
 
 
375 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0709  geranylgeranyl reductase  46.22 
 
 
377 aa  362  5e-99  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05221  NAD binding site  47.57 
 
 
375 aa  350  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1650  geranylgeranyl reductase  46.49 
 
 
381 aa  347  2e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  36.49 
 
 
376 aa  273  4e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0630  geranylgeranyl reductase  35.29 
 
 
373 aa  244  1e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  35.9 
 
 
368 aa  238  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0064  geranylgeranyl reductase  33.96 
 
 
373 aa  237  2e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.535363  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  33.51 
 
 
370 aa  229  7e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  33.15 
 
 
376 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2299  geranylgeranyl reductase  33.24 
 
 
374 aa  226  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.650791  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  27.62 
 
 
378 aa  135  9e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  4.24296e-05 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  25.45 
 
 
375 aa  113  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  26.82 
 
 
362 aa  112  9e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  7.05466e-05 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1330  geranylgeranyl reductase  27.75 
 
 
376 aa  110  3e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  24.57 
 
 
384 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.25722e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  25.13 
 
 
382 aa  100  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  25.31 
 
 
379 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  24.78 
 
 
384 aa  97.1  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  24.52 
 
 
368 aa  95.9  9e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  23.38 
 
 
385 aa  95.5  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0162  geranylgeranyl reductase  24.35 
 
 
392 aa  90.1  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.555099  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  22.99 
 
 
374 aa  85.9  1e-15  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  27.38 
 
 
380 aa  85.5  2e-15  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  25.66 
 
 
389 aa  84.7  2e-15  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  22.39 
 
 
382 aa  82  1e-14  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2189  geranylgeranyl reductase  24.57 
 
 
383 aa  82.8  1e-14  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  26.19 
 
 
387 aa  81.3  3e-14  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1604  geranylgeranyl reductase  25.33 
 
 
391 aa  78.2  2e-13  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3556  FAD dependent oxidoreductase  26.2 
 
 
432 aa  78.2  2e-13  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  23.19 
 
 
413 aa  77.8  3e-13  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  25 
 
 
384 aa  77.4  3e-13  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0574  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 
429 aa  77.8  3e-13  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  25.98 
 
 
398 aa  77  5e-13  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  26.79 
 
 
380 aa  76.6  7e-13  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  23.69 
 
 
367 aa  76.6  7e-13  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1199  geranylgeranyl reductase  25.28 
 
 
423 aa  76.3  9e-13  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  24.56 
 
 
401 aa  75.9  1e-12  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  26.56 
 
 
398 aa  75.9  1e-12  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  23.53 
 
 
403 aa  75.9  1e-12  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  28.36 
 
 
380 aa  74.7  2e-12  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  22.22 
 
 
434 aa  75.1  2e-12  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3481  geranylgeranyl reductase  26.76 
 
 
374 aa  75.1  2e-12  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  25.44 
 
 
379 aa  73.9  4e-12  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  24.19 
 
 
418 aa  73.9  5e-12  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  25.79 
 
 
348 aa  73.6  5e-12  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3232  FAD dependent oxidoreductase  26.38 
 
 
430 aa  73.2  7e-12  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  27.6 
 
 
380 aa  72.8  1e-11  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  24.78 
 
 
395 aa  72.4  1e-11  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  25.73 
 
 
379 aa  71.6  2e-11  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  23.04 
 
 
415 aa  72  2e-11  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  23.33 
 
 
430 aa  72  2e-11  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  21.33 
 
 
376 aa  71.6  2e-11  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  22.3 
 
 
410 aa  71.6  2e-11  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  21.97 
 
 
414 aa  71.2  3e-11  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  23.47 
 
 
410 aa  71.2  3e-11  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  25.69 
 
 
396 aa  70.9  4e-11  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  21.88 
 
 
390 aa  70.9  4e-11  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  24.76 
 
 
365 aa  69.3  1e-10  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  24.85 
 
 
421 aa  68.9  1e-10  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  21.72 
 
 
390 aa  69.3  1e-10  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  23.08 
 
 
409 aa  68.9  1e-10  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  24.69 
 
 
384 aa  69.3  1e-10  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2679  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 
430 aa  68.6  2e-10  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0083  putative oxidoreductase FixC  22.8 
 
 
428 aa  67.8  3e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.715205  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  21.69 
 
 
414 aa  68.2  3e-10  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4412  geranylgeranyl reductase  21.73 
 
 
426 aa  67.4  4e-10  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0475548  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  26.18 
 
 
380 aa  67  5e-10  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0083  putative oxidoreductase FixC  22.8 
 
 
428 aa  66.6  6e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2391  geranylgeranyl reductase  20.92 
 
 
375 aa  66.6  7e-10  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0086  putative oxidoreductase FixC  22.8 
 
 
428 aa  65.9  1e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  22.81 
 
 
390 aa  65.9  1e-09  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  23.03 
 
 
375 aa  65.5  1e-09  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3081  FAD dependent oxidoreductase  21.6 
 
 
413 aa  65.5  2e-09  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  22.69 
 
 
393 aa  65.1  2e-09  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  23.33 
 
 
402 aa  65.1  2e-09  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  23.74 
 
 
387 aa  65.1  2e-09  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  20.44 
 
 
425 aa  65.5  2e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  24.08 
 
 
393 aa  64.7  2e-09  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  25.07 
 
 
434 aa  65.1  2e-09  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0084  putative oxidoreductase FixC  22.48 
 
 
428 aa  64.7  2e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4041  FAD dependent oxidoreductase  24.84 
 
 
429 aa  64.3  3e-09  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0431  hypothetical protein  22.35 
 
 
422 aa  64.7  3e-09  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.446535  normal  0.169558 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  26.45 
 
 
406 aa  64.7  3e-09  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  22.76 
 
 
423 aa  64.7  3e-09  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0047  putative oxidoreductase FixC  23.95 
 
 
428 aa  63.9  4e-09  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0087  putative oxidoreductase FixC  22.48 
 
 
428 aa  63.9  5e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  19.94 
 
 
413 aa  63.5  5e-09  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  24.22 
 
 
408 aa  63.5  5e-09  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  23.66 
 
 
407 aa  63.5  5e-09  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  20.05 
 
 
390 aa  63.5  6e-09  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1644  FAD dependent oxidoreductase  22.41 
 
 
378 aa  63.2  7e-09  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00782092 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  21.21 
 
 
449 aa  63.2  7e-09  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00046  hypothetical protein  23.95 
 
 
428 aa  63.2  8e-09  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>