More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_05111 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_05111  exodeoxyribonuclease III  100 
 
 
281 aa  573  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  90.75 
 
 
281 aa  527  1e-149  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  88.06 
 
 
281 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  70.11 
 
 
281 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04851  exodeoxyribonuclease III  57.79 
 
 
277 aa  325  5e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.416527  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06981  exodeoxyribonuclease III  54.07 
 
 
279 aa  315  6e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0661  exodeoxyribonuclease III  50.9 
 
 
288 aa  313  1.9999999999999998e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.984285  normal  0.57398 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  50 
 
 
282 aa  303  2.0000000000000002e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1817  exodeoxyribonuclease III  54.01 
 
 
275 aa  296  2e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170882  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05411  exodeoxyribonuclease III  54.01 
 
 
275 aa  296  3e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.186769 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4594  exodeoxyribonuclease III Xth  48.69 
 
 
268 aa  276  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136344  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2559  exodeoxyribonuclease III  50.38 
 
 
260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  50 
 
 
261 aa  273  3e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  49.43 
 
 
262 aa  272  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  49.43 
 
 
262 aa  272  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5112  exodeoxyribonuclease III  49.24 
 
 
260 aa  268  1e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.130446  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  46.77 
 
 
265 aa  253  2.0000000000000002e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2071  exodeoxyribonuclease III  43.35 
 
 
256 aa  250  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.663777 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0172  exodeoxyribonuclease III  45.42 
 
 
255 aa  250  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000298085 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  40.68 
 
 
267 aa  246  3e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  44.66 
 
 
255 aa  244  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  41.83 
 
 
254 aa  242  3.9999999999999997e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  43.73 
 
 
277 aa  242  6e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  43.13 
 
 
256 aa  240  2e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  43.94 
 
 
255 aa  240  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  44.11 
 
 
256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  42.75 
 
 
256 aa  237  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  43.35 
 
 
254 aa  235  8e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  42.8 
 
 
322 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  42.8 
 
 
258 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  42.8 
 
 
258 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  42.8 
 
 
258 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  42.59 
 
 
258 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  42.8 
 
 
258 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  42.8 
 
 
258 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  42.8 
 
 
258 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1624  exodeoxyribonuclease III Xth  43.12 
 
 
269 aa  232  6e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  39.54 
 
 
254 aa  231  1e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  40.07 
 
 
258 aa  230  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2776  exodeoxyribonuclease III Xth  42.16 
 
 
260 aa  228  7e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1952  exodeoxyribonuclease III Xth  42.49 
 
 
269 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  0.0243221 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2983  exodeoxyribonuclease III  43.73 
 
 
274 aa  226  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385795  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1460  exodeoxyribonuclease III Xth  44.32 
 
 
254 aa  227  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178949  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1189  exodeoxyribonuclease III  40.15 
 
 
265 aa  226  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642421  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  41.44 
 
 
255 aa  226  3e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1297  exodeoxyribonuclease III  41.64 
 
 
275 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.295102  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1037  exodeoxyribonuclease III  41.51 
 
 
264 aa  225  6e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2163  exodeoxyribonuclease III Xth  40.3 
 
 
258 aa  225  6e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924471  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  41.51 
 
 
264 aa  225  7e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0209  exodeoxyribonuclease III xth  43.8 
 
 
237 aa  224  9e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5932  exodeoxyribonuclease III (xth)  40.3 
 
 
258 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342329  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2145  exodeoxyribonuclease III Xth  40.3 
 
 
258 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  42.53 
 
 
257 aa  223  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  39.16 
 
 
258 aa  222  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1820  exodeoxyribonuclease III  41.2 
 
 
267 aa  222  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.458905  hitchhiker  0.00350077 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1252  exodeoxyribonuclease III Xth  43.06 
 
 
282 aa  222  6e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010877  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1593  exodeoxyribonuclease III protein  41.76 
 
 
269 aa  221  7e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.224473  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1637  exodeoxyribonuclease III Xth  41.2 
 
 
261 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1526  exodeoxyribonuclease III  43.23 
 
 
258 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541899  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2611  exodeoxyribonuclease III Xth  43.02 
 
 
258 aa  219  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.458401 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2055  exodeoxyribonuclease III Xth  39.16 
 
 
271 aa  218  7e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0357  exodeoxyribonuclease III Xth  41.98 
 
 
257 aa  218  7e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.462834  normal  0.596536 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0178  exodeoxyribonuclease III  41.98 
 
 
257 aa  218  7e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2182  exodeoxyribonuclease III Xth  38.78 
 
 
271 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1126  exodeoxyribonuclease III Xth  39.54 
 
 
272 aa  217  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00222533  normal  0.38819 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  37.83 
 
 
254 aa  215  7e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4997  exodeoxyribonuclease III  39.55 
 
 
258 aa  211  7.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541642  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0701  exodeoxyribonuclease III Xth  40.36 
 
 
288 aa  211  9e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.60209 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1478  exodeoxyribonuclease III Xth  39.85 
 
 
258 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391852  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03249  exodeoxyribonuclease III  39.54 
 
 
259 aa  208  8e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1447  exodeoxyribonuclease III  39.7 
 
 
258 aa  207  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1194  exodeoxyribonuclease III Xth  38.95 
 
 
258 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118144  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1114  exodeoxyribonuclease III Xth  38.95 
 
 
258 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2331  exodeoxyribonuclease III Xth  37.55 
 
 
265 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1749  exodeoxyribonuclease III  38.93 
 
 
259 aa  205  7e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  37.55 
 
 
257 aa  203  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.645227  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1736  exodeoxyribonuclease III Xth  36.76 
 
 
265 aa  201  9e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956019  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4446  exodeoxyribonuclease III Xth  39.7 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3970  exodeoxyribonuclease III  37.88 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3018  exodeoxyribonuclease III Xth  36.74 
 
 
261 aa  201  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176682  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1721  exodeoxyribonuclease III Xth  36.4 
 
 
265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.678022  decreased coverage  0.000653482 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1180  exodeoxyribonuclease III  38.49 
 
 
264 aa  199  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.346551  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1886  putative Exodeoxyribonuclease III  35.85 
 
 
259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0111436  normal  0.144129 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1993  exodeoxyribonuclease III (xth)  36.36 
 
 
260 aa  195  5.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0563751  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  34.09 
 
 
262 aa  195  6e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2758  exodeoxyribonuclease III  34.96 
 
 
276 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.30939 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3202  exodeoxyribonuclease III Xth  34.96 
 
 
263 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.840556  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1755  exodeoxyribonuclease III (xth)  36.09 
 
 
266 aa  193  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1479  exodeoxyribonuclease III Xth  36.68 
 
 
263 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.688806 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0864  exodeoxyribonuclease III  34.47 
 
 
279 aa  191  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0873  exodeoxyribonuclease III  34.47 
 
 
260 aa  191  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1727  exodeoxyribonuclease III Xth  37.02 
 
 
258 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10432  exodeoxyribonuclease III protein xthA (exonuclease III)  35.71 
 
 
291 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0709218  normal  0.817281 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0675  exodeoxyribonuclease III  38.99 
 
 
281 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.107108  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1677  exodeoxyribonuclease III Xth  35.71 
 
 
263 aa  188  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4438  exodeoxyribonuclease III  34.85 
 
 
263 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2700  exodeoxyribonuclease III Xth  32.48 
 
 
270 aa  187  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  34.83 
 
 
262 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1810  exodeoxyribonuclease III xth  34.47 
 
 
266 aa  187  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1180  exodeoxyribonuclease III  35.09 
 
 
304 aa  186  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.287038  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>