147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_04711 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05021  hypothetical protein  97.4 
 
 
308 aa  575  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  89.29 
 
 
308 aa  529  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  74.3 
 
 
285 aa  428  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1778  hypothetical protein  47.22 
 
 
308 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05011  hypothetical protein  46.71 
 
 
308 aa  255  6e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.550155  normal  0.119353 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04451  hypothetical protein  47.24 
 
 
288 aa  241  7.999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.898486  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06441  hypothetical protein  44.48 
 
 
307 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0836643 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1753  putative cytochrome c oxidase assembly protein  43.26 
 
 
327 aa  208  1e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0609  putative cytochrome c oxidase assembly protein  40.68 
 
 
308 aa  206  5e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.868245  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  39.23 
 
 
307 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  35.23 
 
 
313 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  35.23 
 
 
313 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1210  cytochrome oxidase assembly  37.36 
 
 
336 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.294531  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1780  cytochrome oxidase assembly  36.6 
 
 
304 aa  159  7e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  35.07 
 
 
311 aa  157  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2601  putative cytochrome aa3 controlling protein  34.46 
 
 
304 aa  152  8.999999999999999e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.705731 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0527  cytochrome oxidase assembly  38.74 
 
 
333 aa  149  9e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  33.18 
 
 
373 aa  82.4  0.000000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  32.54 
 
 
376 aa  77.4  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  29 
 
 
363 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  31 
 
 
367 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  28.5 
 
 
363 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  27.24 
 
 
622 aa  70.1  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  28 
 
 
363 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  25.13 
 
 
326 aa  68.9  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  32.17 
 
 
369 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  32.17 
 
 
370 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  32.17 
 
 
369 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  32.17 
 
 
370 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  32.17 
 
 
370 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  32.17 
 
 
369 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  32.17 
 
 
369 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2078  cytochrome oxidase assembly  30.54 
 
 
351 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  32.17 
 
 
370 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  31.47 
 
 
369 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  31.47 
 
 
369 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  31.47 
 
 
369 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  31.47 
 
 
369 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  25.55 
 
 
383 aa  66.6  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  31.78 
 
 
369 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0553  cytochrome oxidase assembly  32.82 
 
 
369 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241728  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4163  putative cytochrome oxidase assembly protein  32.06 
 
 
369 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2895  cytochrome oxidase assembly  32.06 
 
 
370 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0465  cytochrome oxidase assembly  32.06 
 
 
370 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.77603  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2755  cytochrome oxidase assembly  32.06 
 
 
370 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886693  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  30.86 
 
 
367 aa  63.5  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  27.27 
 
 
327 aa  63.5  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  39.23 
 
 
325 aa  63.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  28.48 
 
 
323 aa  62.8  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  31.45 
 
 
311 aa  62.8  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  27.55 
 
 
335 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2378  cytochrome oxidase assembly  25.08 
 
 
337 aa  62.4  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  27.04 
 
 
335 aa  61.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  33.59 
 
 
339 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  29.75 
 
 
361 aa  60.8  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  28.38 
 
 
331 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2430  cytochrome oxidase assembly  30.77 
 
 
325 aa  60.1  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  26.69 
 
 
396 aa  60.1  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  33.85 
 
 
328 aa  59.7  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3174  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  33.85 
 
 
391 aa  59.3  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.350605  normal  0.387453 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  26.27 
 
 
399 aa  59.3  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  28.8 
 
 
325 aa  58.9  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  28.34 
 
 
339 aa  58.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6009  hypothetical protein  29.45 
 
 
329 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00257584  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0186  hypothetical protein  32.76 
 
 
137 aa  58.2  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.480963 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1786  cytochrome oxidase assembly  33.8 
 
 
338 aa  57.4  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.637517  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  24.14 
 
 
326 aa  57.4  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  25.53 
 
 
348 aa  57  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  30.37 
 
 
339 aa  56.6  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  27.18 
 
 
404 aa  56.2  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  32.23 
 
 
392 aa  56.2  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  31.01 
 
 
327 aa  56.2  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13300  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  32.17 
 
 
287 aa  56.2  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0813876  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1688  cytochrome oxidase assembly  32.2 
 
 
398 aa  55.8  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4613  cytochrome oxidase assembly protein, putative  32.33 
 
 
330 aa  55.8  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22000  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  30.12 
 
 
313 aa  55.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.891794  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0149  cytochrome oxidase assembly  33.07 
 
 
345 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  25.48 
 
 
286 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0072  cytochrome oxidase assembly  30.53 
 
 
359 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0043  putative cytochrome oxidase assembly protein  25.82 
 
 
394 aa  54.3  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.484274  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2061  cytochrome oxidase assembly  30.3 
 
 
309 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.603923  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3013  cytochrome oxidase assembly  32.23 
 
 
267 aa  54.7  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.217193  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2268  cytochrome oxidase assembly  31.06 
 
 
337 aa  53.9  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00686495  normal  0.0860504 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0171  cytochrome oxidase assembly  33.33 
 
 
327 aa  53.1  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2076  cytochrome oxidase assembly  36.22 
 
 
326 aa  53.1  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255138  normal  0.809724 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16080  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  21.63 
 
 
323 aa  52.8  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1387  cytochrome oxidase assembly  33.85 
 
 
407 aa  52.4  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1418  cytochrome oxidase assembly  25.62 
 
 
360 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1353  cytochrome oxidase assembly  28.86 
 
 
320 aa  52  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3827  cytochrome oxidase assembly  30.77 
 
 
411 aa  52  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.502475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2249  cytochrome oxidase assembly  27.01 
 
 
386 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000165994 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0334  putative cytochrome aa3 oxidase assembly protein,related to CtaA  27.89 
 
 
327 aa  51.2  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4119  cytochrome oxidase assembly  30.83 
 
 
325 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0148  cytochrome oxidase assembly  30.83 
 
 
325 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1175  cytochrome oxidase assembly  26.82 
 
 
356 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1197  cytochrome oxidase assembly  26.82 
 
 
356 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4187  cytochrome oxidase assembly  30.83 
 
 
325 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4318  cytochrome oxidase assembly  30.83 
 
 
325 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4065  cytochrome oxidase assembly  27.92 
 
 
506 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.328508  normal  0.355077 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>