More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_03101 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  100 
 
 
187 aa  377  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  95.72 
 
 
187 aa  362  3e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  94.65 
 
 
187 aa  359  2e-98  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03191  NUDIX hydrolase  81.87 
 
 
186 aa  301  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.798424  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1652  NUDIX hydrolase  63.47 
 
 
186 aa  233  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03661  NUDIX hydrolase  63.47 
 
 
186 aa  231  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25181  NUDIX hydrolase  58.93 
 
 
189 aa  218  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0238  NUDIX hydrolase  56.73 
 
 
186 aa  213  9.999999999999999e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0212  NUDIX hydrolase  56.73 
 
 
186 aa  210  1e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.465676  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03121  NUDIX hydrolase  59.76 
 
 
189 aa  208  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  53.89 
 
 
182 aa  195  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  50.55 
 
 
184 aa  188  5e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  50 
 
 
195 aa  183  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2271  ADP-ribose pyrophosphatase  52.6 
 
 
183 aa  177  5.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  53.29 
 
 
183 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  52.69 
 
 
183 aa  175  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0237  NUDIX hydrolase  50 
 
 
183 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373824  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  46.96 
 
 
184 aa  168  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  46.31 
 
 
185 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  41.36 
 
 
171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  40.74 
 
 
214 aa  125  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  38.15 
 
 
186 aa  123  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 
177 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  41.83 
 
 
177 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  38.82 
 
 
189 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  35.36 
 
 
179 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 
186 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  34.46 
 
 
176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  39.51 
 
 
164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  39.87 
 
 
180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  36.02 
 
 
183 aa  111  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0268  NUDIX hydrolase  40.13 
 
 
165 aa  111  6e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.880251  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
184 aa  111  8.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  38.22 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  39.73 
 
 
180 aa  108  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
179 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  36.2 
 
 
169 aa  107  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  32.2 
 
 
185 aa  105  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  36.2 
 
 
171 aa  105  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  34.73 
 
 
204 aa  105  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  36.54 
 
 
177 aa  105  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 
204 aa  105  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 
175 aa  104  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2211  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 
164 aa  104  7e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  35.76 
 
 
166 aa  103  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 
178 aa  103  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  40.4 
 
 
176 aa  103  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 
179 aa  102  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1876  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 
203 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.48572 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 
204 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2834  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 
169 aa  101  8e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  33.94 
 
 
205 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 
173 aa  100  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  34.84 
 
 
211 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  35.22 
 
 
192 aa  99.8  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 
173 aa  99.8  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 
179 aa  99.4  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3241  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 
200 aa  99  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.021012  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  40.14 
 
 
173 aa  99  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
173 aa  98.6  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  38.41 
 
 
281 aa  98.6  5e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  36 
 
 
187 aa  98.6  5e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  36.3 
 
 
207 aa  98.2  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 
182 aa  98.2  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
199 aa  97.8  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  31.52 
 
 
203 aa  97.8  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  34.64 
 
 
172 aa  97.4  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  43.61 
 
 
171 aa  96.3  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  31.98 
 
 
179 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1515  NUDIX hydrolase  34.84 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1507  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 
201 aa  95.5  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.694951  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 
175 aa  95.1  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  31.98 
 
 
179 aa  95.1  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  31.98 
 
 
179 aa  95.1  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  31.98 
 
 
179 aa  95.1  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  31.98 
 
 
179 aa  95.1  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  31.98 
 
 
179 aa  95.1  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  33.73 
 
 
176 aa  94.7  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  31.98 
 
 
179 aa  95.1  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  33.14 
 
 
176 aa  94.7  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  34.67 
 
 
199 aa  94.4  8e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  31.4 
 
 
179 aa  94.4  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 
176 aa  94.4  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_398  MutT/nudix, ADP-ribose pyrophosphatase  33.78 
 
 
176 aa  93.6  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.148699  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2913  ADP-ribose diphosphatase NudE  33.92 
 
 
183 aa  93.6  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 
192 aa  92.8  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 
179 aa  92.4  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  31.4 
 
 
179 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0433  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 
176 aa  92  5e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00447599  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1572  NUDIX hydrolase  36.02 
 
 
179 aa  91.3  8e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  29.19 
 
 
196 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2078  NUDIX family hydrolase  31.55 
 
 
194 aa  90.5  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 
178 aa  90.5  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0167  ADP-ribose diphosphatase NudE  35.33 
 
 
193 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  27.37 
 
 
201 aa  90.5  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3354  mutT/nudix family protein  39.13 
 
 
173 aa  89.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0185  hypothetical protein  33.54 
 
 
335 aa  90.1  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.533354  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0171  ADP-ribose diphosphatase NudE  35.33 
 
 
183 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4188  ADP-ribose diphosphatase NudE  35.33 
 
 
183 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>