More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_00471 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 876 aa  667    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 876 aa  667    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0050  alanyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 871 aa  655    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 875 aa  658    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03511  alanyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 865 aa  671    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3115  alanyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 874 aa  661    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0471495  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 867 aa  684    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 880 aa  694    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0797  alanyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 884 aa  670    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3904  alanyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 904 aa  635    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.639044  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1042  alanyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 876 aa  640    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3223  alanyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 		 931 aa  646    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3428  alanyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 		 874 aa  663    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 		 874 aa  646    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2579  alanyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 913 aa  641    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159446  normal  0.328441 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1611  alanyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 903 aa  672    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0248511  hitchhiker  0.0000135737 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3124  alanyl-tRNA synthetase  40.39 
 
 		 874 aa  660    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.600607  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 874 aa  678    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 860 aa  671    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 860 aa  679    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3556  alanyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 		 899 aa  635    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 		 859 aa  665    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3303  alanyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 871 aa  639    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.243985 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 876 aa  667    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1377  alanyl-tRNA synthetase  59.52 
 
 		 886 aa  1028    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.522237  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 874 aa  706    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0553  alanyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 886 aa  650    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32618  predicted protein  51.41 
 
 		 906 aa  864    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.63515 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0226  alanyl-tRNA synthetase  54.17 
 
 		 880 aa  954    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 874 aa  682    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0926  alanine--tRNA ligase  42.05 
 
 		 873 aa  693    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.961534  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 874 aa  671    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 		 875 aa  656    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 882 aa  679    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 897 aa  699    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2173  alanyl-tRNA synthetase  55.84 
 
 		 899 aa  992    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2518  alanyl-tRNA synthetase  56.06 
 
 		 889 aa  951    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 876 aa  697    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  39.3 
 
 		 880 aa  648    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 864 aa  704    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0990  alanyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 865 aa  662    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0045  alanyl-tRNA synthetase  98.42 
 
 		 886 aa  1783    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.214669  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0876  alanyl-tRNA synthetase  55.21 
 
 		 899 aa  942    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.27264  normal  0.0167096 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0022  alanyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 		 862 aa  662    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711035  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2323  alanyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 		 875 aa  651    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0626442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 881 aa  684    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 		 874 aa  676    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3628  alanyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 872 aa  636    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168897  hitchhiker  0.00000464441 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1670  alanyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 872 aa  662    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28371  alanyl-tRNA synthetase  55.02 
 
 		 930 aa  974    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.578023 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1637  alanyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 874 aa  682    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365835  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3088  alanyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 		 880 aa  973    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0590  alanyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 876 aa  656    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1299  alanyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 		 875 aa  649    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745017  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2745  alanyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 892 aa  660    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376883  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0568  alanyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 874 aa  661    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2910  alanyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 		 878 aa  657    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.70978 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 874 aa  716    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 874 aa  676    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1719  alanyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 874 aa  665    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0625  alanyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 		 868 aa  662    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 863 aa  671    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1638  alanyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 		 890 aa  656    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107041 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 884 aa  710    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 874 aa  682    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00471  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 886 aa  1808    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00581  alanyl-tRNA synthetase  59.54 
 
 		 886 aa  1005    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 897 aa  704    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 865 aa  685    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0047  alanyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 871 aa  657    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.620417  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2903  alanyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 892 aa  658    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0357783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 860 aa  666    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 874 aa  705    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4806  alanyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 		 874 aa  937    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00251805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1127  alanyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 		 874 aa  663    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.435644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1198  alanyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 874 aa  661    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.400961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 869 aa  699    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 		 874 aa  671    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0468  alanyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 		 880 aa  672    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00473822  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 874 aa  672    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 874 aa  704    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 874 aa  671    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1660  alanyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 874 aa  682    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0773336  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00511  alanyl-tRNA synthetase  74.49 
 
 		 886 aa  1370    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 		 897 aa  706    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 885 aa  664    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  39.25 
 
 		 878 aa  641    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1128  alanyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 		 874 aa  663    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 874 aa  682    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1423  alanyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 874 aa  682    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429159  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 878 aa  684    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00451  alanyl-tRNA synthetase  97.97 
 
 		 886 aa  1774    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0598  alanyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 		 885 aa  639    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3711  alanyl-tRNA synthetase  37.46 
 
 		 905 aa  635    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296443  hitchhiker  0.000064855 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 876 aa  659    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 		 876 aa  637    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 879 aa  677    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 878 aa  674    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2628  alanyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 874 aa  655    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1979  alanyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 874 aa  661    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>