More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_00001 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  93.25 
 
 		 385 aa  716    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00001  DNA polymerase III subunit beta  82.86 
 
 		 385 aa  645    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.354313  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  97.14 
 
 		 385 aa  746    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  100 
 
 		 385 aa  764    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  53.49 
 
 		 385 aa  449  1e-125  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  51.79 
 
 		 388 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0001  DNA polymerase III subunit beta  52.84 
 
 		 385 aa  445  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.392011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00001  DNA polymerase III subunit beta  55.18 
 
 		 397 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284448  normal  0.0167825 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00001  DNA polymerase III subunit beta  54.55 
 
 		 386 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1328  DNA polymerase III subunit beta  54.55 
 
 		 386 aa  418  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  45.08 
 
 		 390 aa  375  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  43.48 
 
 		 382 aa  349  5e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  43.65 
 
 		 393 aa  346  4e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  43.65 
 
 		 393 aa  346  4e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  42.64 
 
 		 387 aa  340  2e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0340  DNA polymerase III subunit beta  43.65 
 
 		 394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0199  DNA polymerase III subunit beta  37.69 
 
 		 374 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000579402  normal  0.0770055 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0075  DNA polymerase III beta subunit family protein  33.51 
 
 		 444 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.912734 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5506  DNA polymerase III, beta subunit  31.62 
 
 		 479 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.399861 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  33.59 
 
 		 366 aa  207  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  30.15 
 
 		 376 aa  197  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.46 
 
 		 365 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  31.51 
 
 		 366 aa  191  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.67 
 
 		 376 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.9 
 
 		 375 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.64 
 
 		 375 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.9 
 
 		 375 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  30.51 
 
 		 378 aa  186  7e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000328779  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  30 
 
 		 378 aa  186  8e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000512645  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  29.74 
 
 		 378 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000128167  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0019  DNA polymerase III, beta subunit  28.75 
 
 		 378 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.61 
 
 		 366 aa  182  8.000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4406  DNA polymerase III, beta subunit  28.72 
 
 		 377 aa  182  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0003  DNA polymerase III, beta subunit  30 
 
 		 374 aa  181  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00459981  hitchhiker  0.00000116577 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0749  DNA polymerase III, beta subunit  28.72 
 
 		 377 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  normal  0.0661529 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  29.52 
 
 		 374 aa  180  4e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.17 
 
 		 367 aa  180  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2456  DNA polymerase III subunit beta  29.34 
 
 		 376 aa  178  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0115889  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.34 
 
 		 370 aa  176  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.89 
 
 		 369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0003  DNA polymerase III, beta subunit  29.1 
 
 		 396 aa  174  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2499  DNA polymerase III subunit beta  27.99 
 
 		 376 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000103767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2430  DNA polymerase III subunit beta  27.99 
 
 		 376 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000841235  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2684  DNA polymerase III subunit beta  27.99 
 
 		 376 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0137  DNA polymerase III subunit beta  28.21 
 
 		 366 aa  172  9e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000108126  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.01 
 
 		 375 aa  172  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2750  DNA polymerase III subunit beta  27.99 
 
 		 376 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2460  DNA polymerase III subunit beta  27.74 
 
 		 376 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000810658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.41 
 
 		 379 aa  170  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  32.57 
 
 		 381 aa  170  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  32.57 
 
 		 381 aa  170  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  28.98 
 
 		 365 aa  170  3e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.41 
 
 		 379 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  32.15 
 
 		 379 aa  170  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2699  DNA polymerase III subunit beta  27.99 
 
 		 376 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000020623 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.2 
 
 		 374 aa  170  5e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.57 
 
 		 381 aa  169  9e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  32.15 
 
 		 379 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.79 
 
 		 378 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1551  DNA polymerase III, beta subunit  30.33 
 
 		 367 aa  169  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.422589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.15 
 
 		 379 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1513  DNA polymerase III, beta subunit  28.97 
 
 		 381 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000166783  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.77 
 
 		 367 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.226085  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.9 
 
 		 379 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.57 
 
 		 381 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2706  DNA polymerase III subunit beta  26.97 
 
 		 376 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0010  DNA polymerase III subunit beta  28.28 
 
 		 369 aa  167  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000914164  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2604  DNA polymerase III subunit beta  27.04 
 
 		 376 aa  167  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.756021  hitchhiker  0.0000491978 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00020  DNA polymerase III, beta subunit  29.27 
 
 		 365 aa  166  5e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000592113  decreased coverage  0.0000599685 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2720  DNA polymerase III subunit beta  27.48 
 
 		 376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.001463  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.44 
 
 		 372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0730917  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0003  DNA polymerase III, beta subunit  29.27 
 
 		 369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000352181 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3705  DNA polymerase III subunit beta  27.39 
 
 		 372 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0432616 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  31.65 
 
 		 379 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.72 
 
 		 388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.87 
 
 		 372 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.120269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.8 
 
 		 372 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002008  DNA polymerase III beta subunit  26.63 
 
 		 366 aa  164  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000997729  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.32 
 
 		 373 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0861969  hitchhiker  0.000000929484 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00443  DNA polymerase III subunit beta  26.37 
 
 		 366 aa  163  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.97 
 
 		 378 aa  162  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.065739  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.46 
 
 		 366 aa  162  9e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000544098  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.52 
 
 		 372 aa  162  9e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000275643  normal  0.722211 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.92 
 
 		 372 aa  162  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.205747 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  26.08 
 
 		 366 aa  162  1e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.89 
 
 		 398 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298765  normal  0.252015 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2795  DNA polymerase III subunit beta  27.91 
 
 		 370 aa  161  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.924667  normal  0.594035 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.79 
 
 		 371 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000194465  normal  0.0534413 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2834  DNA polymerase III subunit beta  28.21 
 
 		 372 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.36 
 
 		 372 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.71 
 
 		 372 aa  160  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000138199  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.09 
 
 		 366 aa  160  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000200886  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.63 
 
 		 370 aa  160  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  30.1 
 
 		 377 aa  160  5e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.21 
 
 		 398 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.042032 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0003  DNA polymerase III subunit beta  28.42 
 
 		 372 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295963  hitchhiker  0.00000350231 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  29.56 
 
 		 376 aa  159  6e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000188302  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.31 
 
 		 378 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10002  DNA polymerase III subunit beta  29.32 
 
 		 402 aa  159  8e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.21 
 
 		 398 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>