199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_16851 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_16851  phytoene dehydrogenase and related protein  100 
 
 		 503 aa  1032    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1137  UDP-galactopyranose mutase  59.76 
 
 		 505 aa  626  1e-178  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20111  phytoene dehydrogenase and related proteins  59.16 
 
 		 505 aa  621  1e-177  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.428487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22931  phytoene dehydrogenase  57.82 
 
 		 503 aa  589  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1658  UDP-galactopyranose mutase  54.82 
 
 		 501 aa  578  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17731  phytoene dehydrogenase  55.22 
 
 		 501 aa  565  1e-160  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17531  phytoene dehydrogenase  53.83 
 
 		 501 aa  564  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17571  phytoene dehydrogenase and related protein  55.02 
 
 		 501 aa  561  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.274386  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1944  phytoene dehydrogenase related enzyme  55.6 
 
 		 495 aa  545  1e-154  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0386  phytoene dehydrogenase related enzyme  55.51 
 
 		 500 aa  540  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  46.04 
 
 		 505 aa  430  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  45.6 
 
 		 504 aa  422  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  44.05 
 
 		 499 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  44.18 
 
 		 499 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  44.18 
 
 		 499 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  45.33 
 
 		 523 aa  402  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3330  C-3',4' desaturase CrtD  44.35 
 
 		 510 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4343  amine oxidase  42.54 
 
 		 517 aa  396  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  31.15 
 
 		 501 aa  193  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  29.38 
 
 		 489 aa  156  7e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  30.34 
 
 		 494 aa  150  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3446  phytoene dehydrogenase  23.83 
 
 		 489 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.503543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1161  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 		 500 aa  137  6.0000000000000005e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155951  normal  0.294938 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0245  amine oxidase  26.1 
 
 		 491 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  25.98 
 
 		 516 aa  127  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1385  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 492 aa  126  9e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0115639 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  24.91 
 
 		 518 aa  118  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2640  amine oxidase  26.14 
 
 		 495 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  26.41 
 
 		 514 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  26.68 
 
 		 508 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0933  phytoene dehydrogenase and related proteins-like  25.05 
 
 		 474 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  24.68 
 
 		 518 aa  110  8.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  23.3 
 
 		 520 aa  110  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  24.85 
 
 		 506 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  25.29 
 
 		 514 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  23.6 
 
 		 532 aa  104  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  24.28 
 
 		 514 aa  104  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  24.11 
 
 		 520 aa  103  9e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  23.69 
 
 		 520 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  24.43 
 
 		 512 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  24.43 
 
 		 512 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  24.9 
 
 		 514 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  24.9 
 
 		 506 aa  99  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2816  FAD dependent oxidoreductase  23.8 
 
 		 530 aa  98.6  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  25.1 
 
 		 503 aa  99  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2665  putative phytoene dehydrogenase  25.3 
 
 		 495 aa  98.2  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  24.71 
 
 		 504 aa  95.9  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0577  All-trans-retinol 13,14-reductase  22.74 
 
 		 542 aa  91.7  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  26.24 
 
 		 497 aa  90.5  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0305  amine oxidase  28.12 
 
 		 492 aa  88.2  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  25.45 
 
 		 497 aa  87  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  23.22 
 
 		 740 aa  86.7  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  24.29 
 
 		 508 aa  85.9  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  23.12 
 
 		 503 aa  83.6  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  23.42 
 
 		 507 aa  82.4  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  29.03 
 
 		 938 aa  82  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  24.09 
 
 		 509 aa  81.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  22.56 
 
 		 522 aa  80.5  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  23.71 
 
 		 509 aa  79.7  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  23.15 
 
 		 505 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  23.71 
 
 		 509 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1874  All-trans-retinol 13,14-reductase  20.81 
 
 		 501 aa  78.2  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 515 aa  77.8  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2032  FAD dependent oxidoreductase  21.05 
 
 		 520 aa  77.4  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.756687 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32217  predicted protein  24.33 
 
 		 504 aa  77.4  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.340213  normal  0.0518556 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0436  All-trans-retinol 13,14-reductase  22.9 
 
 		 511 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.601478 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1209  conserved hypothetical protein, FAD-binding domain protein  24.76 
 
 		 502 aa  74.3  0.000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  23.32 
 
 		 509 aa  74.3  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0425  All-trans-retinol 13,14-reductase  23.36 
 
 		 511 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  22.14 
 
 		 498 aa  73.9  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5031  phytoene desaturase  23.05 
 
 		 509 aa  70.9  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  22.68 
 
 		 501 aa  69.3  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  23.47 
 
 		 502 aa  68.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  21.12 
 
 		 503 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  24.41 
 
 		 544 aa  67.4  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  23.6 
 
 		 506 aa  67.4  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  24.27 
 
 		 513 aa  65.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2002  FAD dependent oxidoreductase  20.38 
 
 		 510 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1069  FAD dependent oxidoreductase  23.66 
 
 		 496 aa  65.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  23.75 
 
 		 505 aa  65.1  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1077  all-trans-retinol 13,14-reductase  42.35 
 
 		 505 aa  65.1  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1174  All-trans-retinol 13,14-reductase  20.53 
 
 		 522 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1995  All-trans-retinol 13,14-reductase  21.9 
 
 		 499 aa  63.5  0.000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  23.19 
 
 		 645 aa  63.2  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  23.55 
 
 		 595 aa  62.8  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  24.61 
 
 		 506 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  23.8 
 
 		 512 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3745  phytoene desaturase  22.61 
 
 		 512 aa  60.1  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3436  phytoene desaturase  22.61 
 
 		 512 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03825  hypothetical protein  39.13 
 
 		 508 aa  59.7  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  24.67 
 
 		 511 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  22.2 
 
 		 493 aa  58.2  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9210  CRTISO5 carotenoid isomerase 5,phytoene dehydrogenase-related protein  22.63 
 
 		 530 aa  56.2  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2268  phytoene desaturase  22.1 
 
 		 497 aa  55.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4146  All-trans-retinol 13,14-reductase  22.59 
 
 		 562 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.559453  decreased coverage  0.00452261 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  38.57 
 
 		 547 aa  55.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04430  phytoene desaturase  45.45 
 
 		 548 aa  55.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3156  phytoene desaturase  22.16 
 
 		 509 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205158  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0845  amine oxidase  23.98 
 
 		 492 aa  55.1  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3632  phytoene desaturase  21.8 
 
 		 512 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109765  normal  0.0371662 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>