219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_16231 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1280  radical SAM family protein  54.23 
 
 
879 aa  945    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00695626  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2030  Elongator protein 3/MiaB/NifB  64.99 
 
 
894 aa  1180    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0312  Elongator protein 3/MiaB/NifB  65.9 
 
 
887 aa  1210    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0877  Elongator protein 3/MiaB/NifB  57.73 
 
 
872 aa  964    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856877 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0670  hypothetical protein  51.78 
 
 
898 aa  922    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0267  Radical SAM domain protein  53.11 
 
 
874 aa  927    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148371  decreased coverage  0.00763103 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0485  radical SAM family protein  53.08 
 
 
910 aa  924    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363594  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16231  Fe-S oxidoreductase  100 
 
 
882 aa  1819    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0387  Radical SAM domain protein  54.34 
 
 
860 aa  961    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0682  Radical SAM domain protein  54.12 
 
 
857 aa  958    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.877734 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0662  Radical SAM domain protein  54.07 
 
 
856 aa  954    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3240  radical SAM domain-containing protein  37.42 
 
 
812 aa  527  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.47861  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0300  radical SAM domain-containing protein  36.82 
 
 
842 aa  525  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000298698  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0695  radical SAM family protein  37.79 
 
 
898 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.609463  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0141  Radical SAM domain protein  36.68 
 
 
828 aa  521  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3191  radical SAM family protein  36.88 
 
 
842 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0845541  hitchhiker  0.0000000000326362 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0158  Radical SAM domain protein  36.68 
 
 
828 aa  514  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0731  Radical SAM domain protein  37.5 
 
 
898 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0470  Radical SAM domain protein  36.94 
 
 
828 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0730  Radical SAM domain protein  35.25 
 
 
898 aa  505  1e-141  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0737  radical SAM domain-containing protein  35.5 
 
 
897 aa  500  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0351  radical SAM domain-containing protein  36.02 
 
 
826 aa  491  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1644  radical SAM domain-containing protein  33.68 
 
 
864 aa  481  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0512  Radical SAM domain protein  35.62 
 
 
852 aa  480  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00242025  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2585  Fe-S oxidoreductase  34.64 
 
 
836 aa  478  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00679393  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0239  Beta tubulin, autoregulation binding site  33.53 
 
 
897 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0547979 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1701  Elongator protein 3/MiaB/NifB  35.86 
 
 
860 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4341  Radical SAM domain protein  39.74 
 
 
618 aa  457  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0097  radical SAM domain-containing protein  35.47 
 
 
817 aa  457  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3328  Radical SAM domain protein  39.33 
 
 
633 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00435818  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14150  Radical SAM domain protein  39.65 
 
 
626 aa  452  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000319843  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7274  Fe-S oxidoreductase  40.71 
 
 
636 aa  443  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.867612  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1610  radical SAM domain-containing protein  36.07 
 
 
849 aa  441  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14180  Fe-S oxidoreductase  38.16 
 
 
626 aa  442  9.999999999999999e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2538  radical SAM domain-containing protein  38.69 
 
 
624 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569062  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5483  Radical SAM domain-containing protein  38.15 
 
 
653 aa  439  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1176  Radical SAM domain protein  40.77 
 
 
655 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0156  radical SAM domain-containing protein  39.97 
 
 
599 aa  438  1e-121  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0158  radical SAM domain-containing protein  39.8 
 
 
599 aa  437  1e-121  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.172348  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0554  radical SAM family protein  39.38 
 
 
626 aa  435  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2131  Radical SAM domain protein  37.95 
 
 
613 aa  433  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06130  Fe-S oxidoreductase  37.76 
 
 
626 aa  434  1e-120  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000171239 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2185  Elongator protein 3/MiaB/NifB  39.01 
 
 
644 aa  429  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.972123  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2463  radical SAM domain-containing protein  39.84 
 
 
640 aa  431  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.123021 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1585  Radical SAM domain protein  39.81 
 
 
642 aa  429  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.458582  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0753  radical SAM domain-containing protein  38.85 
 
 
654 aa  432  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1946  Radical SAM domain protein  39.51 
 
 
619 aa  430  1e-119  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1544  Radical SAM domain protein  39.21 
 
 
640 aa  431  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0496911  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1263  Radical SAM domain protein  38.43 
 
 
681 aa  431  1e-119  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0245777  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2123  radical SAM domain-containing protein  37.24 
 
 
617 aa  426  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0450793  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1374  radical SAM domain-containing protein  40.1 
 
 
610 aa  427  1e-118  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1455  radical SAM domain-containing protein  37.99 
 
 
619 aa  427  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3383  Radical SAM domain protein  38.28 
 
 
645 aa  420  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.660882  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0676  Radical SAM domain protein  37.46 
 
 
621 aa  421  1e-116  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00732227  normal  0.444552 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2192  Protein of unknown function DUF2344  32.56 
 
 
842 aa  422  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1616  hypothetical protein  37.82 
 
 
638 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3863  radical SAM domain-containing protein  39.07 
 
 
661 aa  418  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.721561  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0156  radical SAM family protein  37.08 
 
 
613 aa  419  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1317  Radical SAM domain protein  36.62 
 
 
614 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3484  radical SAM domain-containing protein  39.39 
 
 
663 aa  419  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3459  radical SAM domain-containing protein  39.16 
 
 
663 aa  413  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.525782  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5264  radical SAM domain-containing protein  40.66 
 
 
677 aa  414  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1025  Radical SAM domain protein  37.66 
 
 
922 aa  410  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1511  Radical SAM domain protein  38.15 
 
 
627 aa  411  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2565  radical SAM domain-containing protein  37.26 
 
 
628 aa  410  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1629  radical SAM domain-containing protein  37.82 
 
 
611 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1216  radical SAM family protein  39.26 
 
 
679 aa  404  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.837024  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0525  Radical SAM domain protein  36.94 
 
 
657 aa  403  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268937  normal  0.0105227 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7280  Radical SAM domain protein  37.44 
 
 
645 aa  402  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1233  Radical SAM domain protein  37.32 
 
 
597 aa  394  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1202  Radical SAM domain protein  38.35 
 
 
600 aa  391  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2388  radical SAM domain-containing protein  35.01 
 
 
617 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.938561  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2100  radical SAM domain-containing protein  35.01 
 
 
617 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.232765  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3784  Protein of unknown function DUF2344  36.38 
 
 
971 aa  377  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.539179  normal  0.106507 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0978  radical SAM domain-containing protein  34.98 
 
 
600 aa  363  6e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0179  radical SAM domain-containing protein  34.58 
 
 
591 aa  350  5e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.11642  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23731  hypothetical protein  69.53 
 
 
289 aa  337  7e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.106949 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1639  Radical SAM domain protein  28.83 
 
 
803 aa  328  2.0000000000000001e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3698  Radical SAM domain protein  30.51 
 
 
589 aa  291  3e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.360742  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3781  Radical SAM domain protein  30.51 
 
 
589 aa  290  7e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3640  radical SAM family protein  30.35 
 
 
589 aa  286  9e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3475  radical SAM domain-containing protein  30.43 
 
 
613 aa  280  7e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00430694  normal  0.324644 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3961  radical SAM domain-containing protein  31.1 
 
 
566 aa  274  6e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000506678  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3766  radical SAM domain-containing protein  30.23 
 
 
593 aa  269  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3282  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 
563 aa  261  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0422762  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1241  Radical SAM domain protein  31.07 
 
 
551 aa  258  3e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0874851  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0327  radical SAM domain-containing protein  33.14 
 
 
544 aa  253  1e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00004315  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0348  radical SAM domain-containing protein  31.77 
 
 
544 aa  247  9e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000123778  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_288  radical SAM domain protein  32.36 
 
 
559 aa  246  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000164247  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0548  Radical SAM domain protein  29.98 
 
 
557 aa  244  6e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.011862  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3436  Radical SAM domain protein  31.99 
 
 
537 aa  239  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000587564 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0418  radical SAM family protein  31.72 
 
 
557 aa  238  5.0000000000000005e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0560  Radical SAM domain protein  29.98 
 
 
557 aa  237  9e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.12594e-30 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30001  Fe-S oxidoreductase  30.61 
 
 
532 aa  237  9e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.601707 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2195  Fe-S oxidoreductase  27.92 
 
 
573 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0586  radical SAM family protein  29.47 
 
 
544 aa  232  3e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3512  radical SAM family protein  30.02 
 
 
540 aa  231  3e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.170838  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4437  Radical SAM domain protein  30.46 
 
 
537 aa  230  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.07608 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0662  Radical SAM domain protein  31.04 
 
 
545 aa  229  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0764321  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4039  Radical SAM domain protein  30.99 
 
 
538 aa  229  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.461651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>