More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_15821 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_15821  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
112 aa  217  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0470  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 
112 aa  186  1e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.933186  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2206  nitrogen regulatory protein P-II  83.04 
 
 
112 aa  186  1e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.642209  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18621  nitrogen regulatory protein P-II  83.04 
 
 
112 aa  185  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.436109  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0993  nitrogen regulatory protein P-II  83.04 
 
 
112 aa  185  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.469718  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16421  nitrogen regulatory protein P-II  85.71 
 
 
112 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2735  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 
112 aa  175  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0321  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  174  3e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0137  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  174  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000150493  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2842  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  173  7e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0456  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  173  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1848  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1874  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16651  nitrogen regulatory protein P-II  84.82 
 
 
112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.409816  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16531  nitrogen regulatory protein P-II  84.82 
 
 
112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0329531  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1556  nitrogen regulatory protein P-II  84.82 
 
 
112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.995978  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0034  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  170  5e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04671  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 
112 aa  167  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  65.18 
 
 
112 aa  151  2e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
112 aa  148  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0104  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  147  3e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  66.98 
 
 
112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 
112 aa  144  5e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 
112 aa  144  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 
112 aa  144  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 
112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
114 aa  143  8.000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
112 aa  142  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  62.5 
 
 
112 aa  142  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  63.39 
 
 
112 aa  142  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
112 aa  142  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  63.39 
 
 
112 aa  141  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  142  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3026  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  142  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.522952  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  59.82 
 
 
112 aa  141  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3917  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 
112 aa  141  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  141  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1494  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 
112 aa  141  3e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  141  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
112 aa  141  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
112 aa  141  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3267  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 
112 aa  141  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  64.15 
 
 
112 aa  141  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0681  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  141  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.4321 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.15 
 
 
112 aa  140  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  64.15 
 
 
112 aa  140  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  62.5 
 
 
112 aa  140  6e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 
112 aa  140  6e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 
112 aa  140  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  65.09 
 
 
112 aa  140  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  140  8e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2604  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  140  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320307  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
112 aa  140  8e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  61.61 
 
 
114 aa  140  8e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  140  8e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  140  8e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002572  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  140  9e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  61.61 
 
 
112 aa  139  9e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  61.61 
 
 
112 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02445  regulatory protein P-II for glutamine synthetase  61.61 
 
 
112 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  63.21 
 
 
112 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1021  nitrogen regulatory protein PII  61.61 
 
 
112 aa  139  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  61.61 
 
 
112 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2767  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  139  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 
112 aa  139  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  61.61 
 
 
112 aa  139  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  61.61 
 
 
112 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  61.61 
 
 
112 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  63.21 
 
 
112 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  61.61 
 
 
112 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3119  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2899  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  139  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0172484 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  61.61 
 
 
112 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  61.61 
 
 
112 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  61.61 
 
 
112 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  61.61 
 
 
112 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  61.61 
 
 
112 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  61.61 
 
 
112 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  139  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2479  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 
112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494885  normal  0.880519 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4874  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2590  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1095  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  58.04 
 
 
112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2098  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221402  hitchhiker  0.00315077 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0623  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000846933  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2374  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.35771 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  137  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  63.21 
 
 
112 aa  138  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  137  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03437  hypothetical protein  60.71 
 
 
112 aa  138  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2711  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  138  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000634529  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1937  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  138  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1355  nitrogen regulatory protein p-II  61.61 
 
 
112 aa  138  3e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>