More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_13541 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_13541  D-alanine--D-alanine ligase  100 
 
 		 353 aa  725    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.337392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0849  D-alanyl-alanine synthetase A  53.85 
 
 		 350 aa  402  1e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19931  D-alanyl-alanine synthetase A  57.22 
 
 		 353 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.115642 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1541  D-alanyl-alanine synthetase A  52.42 
 
 		 350 aa  395  1e-109  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17261  D-alanyl-alanine synthetase A  54.8 
 
 		 348 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.82734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0872  D-alanyl-alanine synthetase A  54.52 
 
 		 348 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.658926  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0360  D-alanyl-alanine synthetase A  53.07 
 
 		 367 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3354  D-alanyl-alanine synthetase A  51.29 
 
 		 351 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2763  D-alanyl-alanine synthetase A  51.29 
 
 		 351 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.118485  hitchhiker  0.00665374 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0272  D-alanine/D-alanine ligase  51 
 
 		 351 aa  353  2.9999999999999997e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0104  D-alanyl-alanine synthetase A  50.14 
 
 		 352 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0436954 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4217  D-alanyl-alanine synthetase A  49.72 
 
 		 366 aa  348  7e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1199  D-alanyl-alanine synthetase A  51 
 
 		 349 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1402  D-alanyl-alanine synthetase A  46.2 
 
 		 355 aa  332  4e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15051  D-alanyl-alanine synthetase A  46.15 
 
 		 355 aa  332  6e-90  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.442673  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2375  D-alanyl-alanine synthetase A  49.29 
 
 		 347 aa  328  8e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.875604  normal  0.964847 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14921  D-alanyl-alanine synthetase A  44.35 
 
 		 355 aa  327  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14671  D-alanyl-alanine synthetase A  44.86 
 
 		 355 aa  322  7e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0791512  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1636  D-alanine/D-alanine ligase  43.97 
 
 		 383 aa  310  4e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  45.48 
 
 		 376 aa  301  8.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  42.06 
 
 		 364 aa  293  3e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1603  D-alanine/D-alanine ligase  43.34 
 
 		 362 aa  288  1e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  41.92 
 
 		 367 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2721  D-alanyl-alanine synthetase A  43.38 
 
 		 361 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0289964  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3791  D-alanine--D-alanine ligase  42.78 
 
 		 370 aa  283  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100262  normal  0.807199 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  42.36 
 
 		 376 aa  282  6.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0011  D-alanine--D-alanine ligase  43.18 
 
 		 365 aa  281  2e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.133339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5065  D-alanyl-alanine synthetase A  42.82 
 
 		 361 aa  278  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.250957  normal  0.846892 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0260  D-alanyl-alanine synthetase A  42.82 
 
 		 361 aa  277  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1090  D-alanine--D-alanine ligase  42.23 
 
 		 371 aa  277  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0232  D-alanyl-alanine synthetase A  42.66 
 
 		 362 aa  276  3e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0217  D-alanyl-alanine synthetase A  41.69 
 
 		 361 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0257  D-alanyl-alanine synthetase A  41.69 
 
 		 361 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3506  D-alanine--D-alanine ligase  41.9 
 
 		 361 aa  274  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109153  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0265  D-alanyl-alanine synthetase A  41.41 
 
 		 361 aa  273  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0219  D-alanyl-alanine synthetase A  41.69 
 
 		 361 aa  273  3e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0279  D-alanyl-alanine synthetase A  41.41 
 
 		 361 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0223  D-alanyl-alanine synthetase A  41.53 
 
 		 362 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2121  D-alanyl-alanine synthetase A  41.14 
 
 		 339 aa  272  7e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3791  D-alanine--D-alanine ligase  41.01 
 
 		 353 aa  270  4e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4592  D-alanine--D-alanine ligase  40.84 
 
 		 393 aa  266  2.9999999999999995e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79248  normal  0.646635 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  43.1 
 
 		 359 aa  266  5e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0407  D-alanine/D-alanine ligase  39.78 
 
 		 358 aa  263  4e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2952  D-alanine--D-alanine ligase  43.39 
 
 		 351 aa  261  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2039  D-alanyl-alanine synthetase A  41.57 
 
 		 364 aa  259  7e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2120  D-alanyl-alanine synthetase A  40.78 
 
 		 356 aa  259  7e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.183623  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2158  D-alanyl-alanine synthetase A  40.78 
 
 		 356 aa  259  7e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08980  D-alanine--D-alanine ligase  40.23 
 
 		 343 aa  258  1e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2856  D-alanine/D-alanine ligase  42.31 
 
 		 362 aa  258  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8041  D-alanyl-alanine synthetase A  37.14 
 
 		 394 aa  256  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3243  D-alanine/D-alanine ligase  39.84 
 
 		 366 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0850  D-alanyl-alanine synthetase A  40.56 
 
 		 366 aa  254  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2792  D-alanine/D-alanine ligase  38.36 
 
 		 386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.237488 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3345  D-alanine/D-alanine ligase  39.23 
 
 		 366 aa  252  5.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4219  D-alanyl-alanine synthetase A  38.92 
 
 		 367 aa  250  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  39.56 
 
 		 364 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0434  D-alanyl-alanine synthetase A  39.56 
 
 		 364 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552987  normal  0.545444 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0422  D-alanyl-alanine synthetase A  39.56 
 
 		 364 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.947692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0905  D-alanyl-alanine synthetase A  38.11 
 
 		 360 aa  250  3e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1690  D-alanyl-alanine synthetase A  39.22 
 
 		 357 aa  249  4e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.820491  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0298  D-alanyl-alanine synthetase A  38.27 
 
 		 364 aa  249  6e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0173  D-alanyl-alanine synthetase A  39.44 
 
 		 364 aa  248  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1929  D-alanyl-alanine synthetase A  37.03 
 
 		 371 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1975  D-alanyl-alanine synthetase A  37.03 
 
 		 371 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.916646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1367  D-alanine--D-alanine ligase  38.59 
 
 		 367 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1909  D-alanyl-alanine synthetase A  37.03 
 
 		 371 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667964  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0410  D-alanyl-alanine synthetase A  38.84 
 
 		 364 aa  248  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00328  D-alanylalanine synthetase  38.84 
 
 		 364 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3227  D-alanine/D-alanine ligase  38.84 
 
 		 364 aa  248  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0453  D-alanyl-alanine synthetase A  38.84 
 
 		 364 aa  248  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3251  D-alanyl-alanine synthetase A  38.84 
 
 		 364 aa  248  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.10036 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0447  D-alanyl-alanine synthetase A  38.84 
 
 		 364 aa  248  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0406  D-alanyl-alanine synthetase A  38.84 
 
 		 364 aa  248  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12996  D-alanyl-alanine synthetase A  38.25 
 
 		 373 aa  246  3e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00428062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0415  D-alanyl-alanine synthetase A  39.01 
 
 		 364 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0476  D-alanyl-alanine synthetase A  39.01 
 
 		 364 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8008  D-alanine--D-alanine ligase  37.64 
 
 		 369 aa  246  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5988  D-alanyl-alanine synthetase A  39 
 
 		 355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11160  D-alanine--D-alanine ligase  37.6 
 
 		 400 aa  241  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0940695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1595  D-alanyl-alanine synthetase A  36.83 
 
 		 372 aa  241  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2143  D-alanyl-alanine synthetase A  37.57 
 
 		 367 aa  241  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1631  D-alanyl-alanine synthetase A  37.33 
 
 		 360 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1544  D-alanyl-alanine synthetase A  40.34 
 
 		 348 aa  238  1e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02772  D-alanyl-alanine synthetase A  38.29 
 
 		 369 aa  237  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0767  D-alanyl-alanine synthetase A  38.18 
 
 		 348 aa  236  6e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4044  D-alanine/D-alanine ligase  36.81 
 
 		 384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.15517  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0388  D-ala D-ala ligase  38.42 
 
 		 375 aa  234  2.0000000000000002e-60  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.822373  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2841  D-alanine/D-alanine ligase  37.33 
 
 		 362 aa  233  5e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09160  D-alanyl-alanine synthetase A  36.59 
 
 		 365 aa  232  7.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.616014 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1529  D-alanyl-alanine synthetase A  37.64 
 
 		 363 aa  232  7.000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2514  D-alanyl-alanine synthetase A  38.21 
 
 		 382 aa  231  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.94876  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1662  D-alanyl-alanine synthetase A  37.67 
 
 		 363 aa  231  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3291  D-alanine--D-alanine ligase  35.85 
 
 		 373 aa  230  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304475  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2310  D-alanine/D-alanine ligase  37.13 
 
 		 389 aa  230  3e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0189199  hitchhiker  0.00305681 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10770  D-alanine--D-alanine ligase  39.57 
 
 		 376 aa  229  4e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.309547  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2251  D-alanyl-alanine synthetase A  37.84 
 
 		 382 aa  229  6e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000796375 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1363  D-alanine--D-alanine ligase  36.27 
 
 		 376 aa  229  6e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.905553  normal  0.282026 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0633  D-alanyl-alanine synthetase A  35.73 
 
 		 371 aa  229  7e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1586  D-alanine--D-alanine ligase  35.6 
 
 		 377 aa  229  8e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0347832 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1331  D-alanyl-alanine synthetase A  37.33 
 
 		 361 aa  228  2e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>