More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_12411 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_12411  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  100 
 
 
407 aa  830    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.485468  hitchhiker  0.0071561 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01121  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  55.44 
 
 
395 aa  438  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.273629 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14101  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  50 
 
 
398 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2405  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  48.52 
 
 
402 aa  358  7e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.12432  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4084  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  45.55 
 
 
392 aa  350  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0525  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  45.48 
 
 
395 aa  351  2e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2587  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  44.5 
 
 
383 aa  333  3e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0384123  hitchhiker  0.000234634 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0171  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  42.38 
 
 
381 aa  317  3e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0252  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  42.38 
 
 
381 aa  317  3e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0593  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  43.94 
 
 
383 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2329  pyridoxal phosphate-dependent enzyme apparently involved in regulation of cell wall biogenesis  44.47 
 
 
385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3098  UDP-bacillosamine synthetase  44.41 
 
 
385 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001802  putative aminotransferase DegT family  42.71 
 
 
383 aa  300  3e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2305  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family protein  39.54 
 
 
383 aa  299  5e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00668  UDP-bacillosamine synthetase  41.91 
 
 
383 aa  298  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0047  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  42.55 
 
 
386 aa  297  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1586  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  44.77 
 
 
382 aa  296  3e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.257863  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0629  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.64 
 
 
384 aa  293  3e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4858  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  43.37 
 
 
395 aa  292  8e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707328  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1461  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  40.82 
 
 
399 aa  292  9e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3119  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  41.76 
 
 
391 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2975  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  41.76 
 
 
391 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0369  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  43.8 
 
 
389 aa  290  3e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0393  aminotransferase  45.14 
 
 
380 aa  275  7e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1514  aminotransferase  44.77 
 
 
381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2644  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  40.16 
 
 
394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1974  DegT/DnrJ/EryC1/StrS family protein  39.69 
 
 
384 aa  262  8.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.953061  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16970  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.07 
 
 
391 aa  241  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2126  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.01 
 
 
372 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0334323  normal  0.0133651 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2644  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.28 
 
 
389 aa  232  7.000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0037  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.31 
 
 
379 aa  229  7e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3387  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.09 
 
 
381 aa  228  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5132  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.51 
 
 
380 aa  223  7e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1355  perosamine synthetase, putative  37.3 
 
 
364 aa  220  3e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3253  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.33 
 
 
384 aa  220  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0563  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.21 
 
 
381 aa  220  3.9999999999999997e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3134  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.11 
 
 
368 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0752  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.99 
 
 
368 aa  215  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.582657 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0334  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.26 
 
 
377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.272347  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0312  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.48 
 
 
387 aa  210  3e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.991338  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2624  perosamine synthase  34.03 
 
 
367 aa  209  5e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2766  perosamine synthetase  35.15 
 
 
368 aa  206  5e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2521  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.74 
 
 
369 aa  206  7e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00162044 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0950  putative perosamine synthetase  35.44 
 
 
365 aa  205  1e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.251305  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5394  aminotransferase family protein  34.06 
 
 
371 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0821  hypothetical protein  33.25 
 
 
500 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2600  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  35.2 
 
 
362 aa  204  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0792  hypothetical protein  33.51 
 
 
500 aa  204  3e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3048  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.22 
 
 
382 aa  203  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0714  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.11 
 
 
375 aa  203  4e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1573  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.84 
 
 
500 aa  203  4e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10738  putative aminotransferase  34.77 
 
 
365 aa  203  4e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.250686  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2577  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.25 
 
 
365 aa  199  7e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.176672  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2345  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.43 
 
 
382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2970  aminotransferase, DegT/DnrJ/EryC1/StrS family  33.7 
 
 
364 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000014581 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1139  general glycosylation pathway protein  35.47 
 
 
386 aa  196  5.000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.957255  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0448  processing protease  34.52 
 
 
363 aa  196  8.000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1264  general glycosylation pathway protein  35.73 
 
 
386 aa  194  2e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.905092  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3629  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.39 
 
 
372 aa  194  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0599  general glycosylation pathway protein  35.03 
 
 
386 aa  194  3e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1203  putative perosamine synthetase  35.25 
 
 
363 aa  193  4e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0521  perosamine synthase, putative  31.81 
 
 
367 aa  193  6e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2633  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.24 
 
 
390 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.152572  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0427  glutamine--scyllo-inositol transaminase  32.63 
 
 
374 aa  189  9e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0732605  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1969  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.44 
 
 
384 aa  187  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.886816  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3402  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.79 
 
 
507 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1257  UDP-4-keto-6-deoxy-GlcNAc C4 aminotransferase  33.69 
 
 
386 aa  182  7e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0361  aminotransferase-like  30.68 
 
 
383 aa  181  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3378  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  30.53 
 
 
368 aa  178  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.65764  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0289  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.3 
 
 
367 aa  177  4e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1213  cell wall biosynthesis enzyme  31.44 
 
 
368 aa  177  4e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.578129  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2570  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  30.49 
 
 
372 aa  176  9e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0711  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family protein  31.01 
 
 
388 aa  175  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3061  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  30.27 
 
 
393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3059  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.39 
 
 
370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5255  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.52 
 
 
381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5139  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  31.03 
 
 
391 aa  173  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1470  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.12 
 
 
376 aa  169  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0146  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  30.23 
 
 
378 aa  169  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.581364  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4223  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  31.32 
 
 
374 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206706  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0056  perosamine synthetase  31.82 
 
 
375 aa  167  4e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0267366  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2221  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  29.2 
 
 
389 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0229  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  29.97 
 
 
389 aa  164  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00533175  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0082  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  30.59 
 
 
371 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0080  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  30.59 
 
 
371 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182547 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1938  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.12 
 
 
397 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2855  aminotransferase family, DegT/DnrJ/EryC1/StrS  31.76 
 
 
385 aa  162  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  hitchhiker  0.00000526937 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1589  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  29.17 
 
 
370 aa  162  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5668  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.76 
 
 
385 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.01985 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1981  perosamine synthetase  29.62 
 
 
591 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0777  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  28.42 
 
 
400 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1039  glutamine--scyllo-inositol transaminase  32.84 
 
 
394 aa  160  3e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000569321 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2323  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  30.75 
 
 
386 aa  160  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.256367 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1720  UDP-4-keto-6-deoxy-N-acetylglucosamine 4-aminotransferase  31.09 
 
 
401 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.946093  hitchhiker  0.000000214942 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8499  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  30.59 
 
 
387 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0666  aminotransferase  30.06 
 
 
586 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198261  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0594  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  29.84 
 
 
372 aa  157  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3093  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  28.38 
 
 
391 aa  157  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.354679 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1964  perosamine synthetase  30.06 
 
 
591 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0571  aminotransferase  30.06 
 
 
586 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>