More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_12271 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  100 
 
 		 320 aa  657    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  71.56 
 
 		 320 aa  498  1e-140  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  71.56 
 
 		 320 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0761  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  70.94 
 
 		 324 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.926297  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  70 
 
 		 320 aa  488  1e-137  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16011  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  70.62 
 
 		 324 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.975575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  64.69 
 
 		 320 aa  461  1e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13431  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  64.38 
 
 		 320 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1250  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  64.38 
 
 		 320 aa  457  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.263784  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13181  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  63.12 
 
 		 320 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.974044  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  49.53 
 
 		 332 aa  350  1e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  48.75 
 
 		 320 aa  339  2.9999999999999998e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  48.86 
 
 		 323 aa  335  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  48.86 
 
 		 323 aa  335  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  47.9 
 
 		 328 aa  333  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  48.38 
 
 		 339 aa  332  4e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  47.04 
 
 		 327 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3162  NmrA-like  47.68 
 
 		 325 aa  314  9.999999999999999e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.186566  hitchhiker  0.00806133 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_47864  predicted protein  39.87 
 
 		 314 aa  250  3e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  31 
 
 		 287 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  29.82 
 
 		 287 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  29.82 
 
 		 287 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  31.74 
 
 		 287 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6307  NmrA family protein  30.61 
 
 		 306 aa  92.4  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.378385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  30.74 
 
 		 287 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  28.05 
 
 		 291 aa  90.1  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  30.15 
 
 		 289 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  29.15 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  25.81 
 
 		 300 aa  85.9  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  26.1 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  36.67 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.64 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  28.07 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  28.51 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  30.26 
 
 		 281 aa  82.4  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1068  NmrA family protein  27.31 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.746478  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  26.47 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5106  NmrA family protein  24.51 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.920576  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  31.46 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  25 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  24.69 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.52 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1407  NmrA family protein  24.72 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226857 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.94 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  30.47 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0060  hypothetical protein  26.79 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  23.53 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  24.69 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  27.62 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0487  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.34 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00126012  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  26.48 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  32.23 
 
 		 329 aa  75.5  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  24.81 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7062  NmrA family protein  27.4 
 
 		 512 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  27.23 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3897  NmrA-like  28.18 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.94 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.96 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  29.33 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.83 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000606737 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2237  NmrA family protein  26.43 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 270 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.57 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219396  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.54 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.25 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.99 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.12 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.26 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.1 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.91 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1422  NmrA family protein  24.9 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.578575 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2445  NmrA family protein  25.78 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.385594  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.35 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.27 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2408  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.87 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0479  NmrA family protein  29.44 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  25.86 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  26.58 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  26.52 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1587  NmrA family protein  25.78 
 
 		 287 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428697  normal  0.242272 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2018  hypothetical protein  24.16 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.810011  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.55 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000218299  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.43 
 
 		 429 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1032  NmrA family protein  29.07 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.860276  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  30 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0228  NmrA family protein  28.07 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0008  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.21 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.97826 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  32.1 
 
 		 315 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1791  NmrA family protein  27.33 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.46 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.33 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.62 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0144299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.2 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4675  NmrA family protein  26.16 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.764449 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1353  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  21.19 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.27 
 
 		 459 aa  65.9  0.0000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0520232 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.05 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  27.88 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35 
 
 		 347 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>