More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_10011 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03756  GTP-binding protein  54.41 
 
 		 607 aa  643    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4115  GTP-binding protein TypA  54.41 
 
 		 607 aa  643    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3553  GTP-binding protein TypA  54.76 
 
 		 607 aa  651    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.718809  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  57.79 
 
 		 598 aa  695    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5044  GTP-binding protein TypA  53.9 
 
 		 606 aa  644    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0615  GTP-binding protein TypA  53.39 
 
 		 599 aa  637    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.546843 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0696  GTP-binding protein TypA  57.33 
 
 		 615 aa  718    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2852  GTP-binding protein TypA  53.45 
 
 		 606 aa  639    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011881  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08221  tyrosine binding protein  82.78 
 
 		 598 aa  1040    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.848748  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1296  GTP-binding elongation factor protein  55.03 
 
 		 606 aa  647    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609673  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  57.05 
 
 		 614 aa  712    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1191  GTP-binding protein TypA  57.29 
 
 		 615 aa  723    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0472002  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  54.67 
 
 		 602 aa  665    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0473  elongation factor Tu family protein  54.47 
 
 		 613 aa  687    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08211  tyrosine binding protein  83.22 
 
 		 600 aa  1030    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96814  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4408  virulence regulator BipA  56.46 
 
 		 603 aa  669    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0308  GTP-binding protein TypA  55.44 
 
 		 609 aa  655    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196053  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  57.05 
 
 		 614 aa  712    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  57.05 
 
 		 614 aa  712    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  57.05 
 
 		 614 aa  711    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  55.61 
 
 		 608 aa  661    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2875  hypothetical protein  54.61 
 
 		 608 aa  656    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2737  hypothetical protein  54.61 
 
 		 608 aa  657    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4918  GTP-binding protein TypA  54.07 
 
 		 606 aa  645    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4378  GTP-binding protein TypA  75.68 
 
 		 596 aa  940    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1998  GTP-binding protein TypA  56.09 
 
 		 613 aa  681    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.472185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1224  GTP-binding protein TypA  53.69 
 
 		 605 aa  642    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0166  GTP-binding protein TypA  83.39 
 
 		 598 aa  1030    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0168881  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2021  GTP-binding protein TypA  55.61 
 
 		 606 aa  648    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487667  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  56.07 
 
 		 610 aa  689    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1918  putative GTP-binding elongation factor protein  53.59 
 
 		 610 aa  639    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23891  normal  0.145014 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0763  small GTP-binding protein domain-containing protein  75.68 
 
 		 596 aa  942    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  55.61 
 
 		 608 aa  661    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0720  GTP-binding protein TypA  54.42 
 
 		 609 aa  644    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000568805  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0347  GTP-binding protein TypA  53.22 
 
 		 606 aa  640    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0307  GTP-binding protein TypA  55.44 
 
 		 609 aa  655    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0237117  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  58.75 
 
 		 602 aa  712    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  55.44 
 
 		 608 aa  660    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1424  GTP-binding protein TypA  55.13 
 
 		 610 aa  676    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1236  GTP-binding protein TypA  85.64 
 
 		 600 aa  1063    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292914  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1518  GTP-binding protein TypA  54.81 
 
 		 608 aa  671    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.678291  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1243  GTP-binding protein TypA  86.64 
 
 		 602 aa  1073    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.590892 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  57.41 
 
 		 598 aa  684    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0169  GTP-binding protein TypA  54.27 
 
 		 607 aa  646    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  57.05 
 
 		 614 aa  712    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0006  GTP-binding protein TypA  54.55 
 
 		 600 aa  641    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0770  tyrosine binding protein  83.08 
 
 		 598 aa  1040    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1525  GTP-binding protein TypA  77.14 
 
 		 597 aa  954    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490404 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  56.06 
 
 		 603 aa  692    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0100  GTP-binding protein TypA  56.35 
 
 		 613 aa  676    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  55.27 
 
 		 592 aa  691    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  55.78 
 
 		 608 aa  664    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1987  small GTP-binding TypA  53.13 
 
 		 615 aa  638    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69102  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5850  GTP-binding protein TypA/BipA  53.61 
 
 		 605 aa  640    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0948932  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3483  GTP-binding virulence regulator protein BipA  53.28 
 
 		 607 aa  635    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.325344 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  60.95 
 
 		 614 aa  763    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07981  tyrosine binding protein  83.22 
 
 		 598 aa  1028    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.633904 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16761  tyrosine binding protein  84.64 
 
 		 600 aa  1059    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.262859 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  55.61 
 
 		 608 aa  661    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  55.61 
 
 		 608 aa  661    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1259  GTP-binding protein TypA  56.97 
 
 		 602 aa  684    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.273411 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  55.61 
 
 		 608 aa  661    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2813  GTP-binding protein TypA  55.09 
 
 		 608 aa  659    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.472576 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3455  GTP-binding protein TypA  54.45 
 
 		 603 aa  650    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000132117  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0413  GTP-binding protein TypA  56.12 
 
 		 603 aa  662    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  55.44 
 
 		 608 aa  661    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0637  GTP-binding protein TypA  55.8 
 
 		 614 aa  688    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000155128  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  56.28 
 
 		 599 aa  678    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  53.47 
 
 		 605 aa  654    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  56.83 
 
 		 593 aa  668    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  54.84 
 
 		 602 aa  668    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  55.44 
 
 		 608 aa  661    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  55.61 
 
 		 608 aa  660    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1024  GTP-binding protein TypA  53.01 
 
 		 623 aa  646    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08241  tyrosine binding protein  83.11 
 
 		 598 aa  1043    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1169  GTP-binding protein TypA  57.29 
 
 		 615 aa  723    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0173416  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  56.71 
 
 		 610 aa  673    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  56.88 
 
 		 610 aa  674    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0472  GTP-binding protein TypA  55.74 
 
 		 608 aa  671    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4442  GTP-binding protein TypA  77.48 
 
 		 596 aa  968    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0306  GTP-binding protein TypA  56.29 
 
 		 603 aa  670    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.562357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3718  GTP-binding protein TypA  56.29 
 
 		 603 aa  670    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0941  GTP-binding protein TypA  57.05 
 
 		 602 aa  684    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0324  GTP-binding protein TypA  54.29 
 
 		 603 aa  654    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0339  GTP-binding protein TypA  53.5 
 
 		 608 aa  655    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0649933 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  55.44 
 
 		 608 aa  660    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67560  GTP-binding protein TypA/BipA  53.61 
 
 		 605 aa  643    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2298  membrane GTPase for stress response  54.92 
 
 		 613 aa  669    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0807  stress response membrane GTPase  53.18 
 
 		 611 aa  670    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0319085  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1181  stress response membrane GTPase  53.97 
 
 		 618 aa  681    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0076831  hitchhiker  0.00656826 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1342  stress response membrane GTPase  53.52 
 
 		 613 aa  676    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0910775  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0771  GTP-binding protein TypA/BipA (tyrosine phosphorylated protein A)  55.15 
 
 		 615 aa  682    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0726544  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  55.61 
 
 		 608 aa  660    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2868  GTP-binding protein TypA  53.04 
 
 		 594 aa  637    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1545  GTP-binding protein TypA  56.13 
 
 		 611 aa  646    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0301  GTP-binding protein TypA  55.78 
 
 		 603 aa  662    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567265 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0013  GTP-binding protein TypA/BipA  54.84 
 
 		 602 aa  663    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  56.56 
 
 		 601 aa  681    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1793  GTP-binding protein TypA  55.31 
 
 		 608 aa  658    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.520396  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4025  GTP-binding protein TypA  53.41 
 
 		 606 aa  637    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.759535 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>