76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_09521 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_09521  hypothetical protein  100 
 
 
352 aa  722    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722234 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0215  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  84.09 
 
 
352 aa  624  1e-178  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08471  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  83.81 
 
 
352 aa  624  1e-177  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.679252  hitchhiker  0.00174435 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1271  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  76 
 
 
352 aa  561  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0702178  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13721  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  76.86 
 
 
352 aa  553  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13421  hypothetical protein  75.71 
 
 
352 aa  548  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.233914  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13631  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  76.29 
 
 
352 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07351  light-harvesting complex protein  66.86 
 
 
351 aa  488  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.112937 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06831  light-harvesting complex protein  64.87 
 
 
352 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06541  light-harvesting complex protein  64.87 
 
 
352 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06931  light-harvesting complex protein  64.02 
 
 
352 aa  471  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0627  light-harvesting complex protein  65.44 
 
 
352 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.536853  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17721  light-harvesting complex protein  69.71 
 
 
368 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0066  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbA  63.71 
 
 
349 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06881  light-harvesting complex protein  64 
 
 
349 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1590  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  62.11 
 
 
345 aa  443  1e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.10047  hitchhiker  0.00277314 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10131  light-harvesting complex protein  64.86 
 
 
350 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1005  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  61.36 
 
 
359 aa  435  1e-121  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0722  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbE  58.33 
 
 
362 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.683508  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15601  hypothetical protein  58.33 
 
 
362 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.963648 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0723  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbB  60.62 
 
 
354 aa  421  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.543048  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0719  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbB  63.45 
 
 
349 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.17492  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11601  hypothetical protein  64.5 
 
 
349 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0985613 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15611  hypothetical protein  60.62 
 
 
354 aa  421  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.732375  normal  0.917864 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15561  hypothetical protein  63.45 
 
 
349 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.95378 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14281  hypothetical protein  57.3 
 
 
365 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517015 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0717  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbH  61.29 
 
 
351 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15541  hypothetical protein  61.29 
 
 
351 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.418255  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11571  hypothetical protein  57.5 
 
 
361 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0991489 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11631  hypothetical protein  58.4 
 
 
352 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0312993 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15551  hypothetical protein  55.15 
 
 
370 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.203138  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0718  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbC  55.15 
 
 
370 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14531  hypothetical protein  56.9 
 
 
355 aa  388  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358475 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1795  chlorophyll a/b binding light-harvesting protein  50.29 
 
 
359 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2434  chlorophyll a/b binding light-harvesting protein  52.3 
 
 
342 aa  325  9e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000346716  hitchhiker  0.0000000117955 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1542  iron-stress chlorophyll-binding protein  51.3 
 
 
342 aa  316  3e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398653  normal  0.0103257 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1667  photosystem antenna protein-like  48.28 
 
 
344 aa  312  4.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00889751  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2484  photosystem antenna protein-like  41.23 
 
 
343 aa  240  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.965644  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2485  photosystem antenna protein-like  37.98 
 
 
522 aa  201  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.90279  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2483  photosystem antenna protein-like  38.77 
 
 
368 aa  185  8e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0578  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  38.57 
 
 
459 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13251  photosystem II PsbC protein (CP43)  37.28 
 
 
460 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  unclonable  0.000121028  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13501  photosystem II PsbC protein (CP43)  37.28 
 
 
460 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.151398  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13351  photosystem II PsbC protein (CP43)  37.28 
 
 
460 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08421  photosystem II PsbC protein (CP43)  37.28 
 
 
464 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1257  photosystem II PsbC protein (CP43)  37.05 
 
 
460 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0172037  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16081  photosystem II PsbC protein (CP43)  35.61 
 
 
460 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.548682  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0768  photosystem II PsbC protein (CP43)  35.84 
 
 
460 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0055  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  37 
 
 
460 aa  169  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0513  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  37.5 
 
 
459 aa  169  7e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50837  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0053  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  37 
 
 
460 aa  169  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000498494  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1060  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  37.99 
 
 
461 aa  169  8e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0000366993  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0656  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  38.21 
 
 
461 aa  168  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1243  photosynthetic II protein PsbC  37.99 
 
 
459 aa  164  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2113  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1993  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  38.25 
 
 
462 aa  163  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.296438  normal  0.146878 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12341  photosystem II PsbC protein (CP43)  35.61 
 
 
460 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.606702  normal  0.098859 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0217  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  38.79 
 
 
473 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0294116  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0667  photosynthetic II protein PsbC  38.43 
 
 
462 aa  160  3e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.329399  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03471  photosystem II PsbB protein (CP47)  29.29 
 
 
507 aa  76.3  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0321  photosystem II PsbB protein (CP47)  29.45 
 
 
507 aa  74.3  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03401  photosystem II PsbB protein (CP47)  29.11 
 
 
507 aa  73.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03391  photosystem II PsbB protein (CP47)  29.11 
 
 
507 aa  73.2  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0452672  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04051  photosystem II PsbB protein (CP47)  30.14 
 
 
507 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.644071 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1692  photosystem II PsbB protein (CP47)  30.14 
 
 
507 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03501  photosystem II PsbB protein (CP47)  29.04 
 
 
518 aa  67.4  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.234957  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1507  photosystem antenna protein-like  33.07 
 
 
509 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000124352  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1864  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  30.38 
 
 
519 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0470  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  29.11 
 
 
519 aa  60.5  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0861  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  33.07 
 
 
510 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000036456  decreased coverage  0.00000114007 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22121  photosystem II PsbB protein (CP47)  25 
 
 
510 aa  59.7  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4113  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  31.5 
 
 
509 aa  59.7  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0697  photosystem II core light harvesting protein  30.95 
 
 
508 aa  57.8  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000016119  normal  0.0946335 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4666  photosystem antenna protein-like  33.05 
 
 
508 aa  57.4  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0622483  normal  0.0120025 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1572  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  32.2 
 
 
508 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287144 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3069  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  32.2 
 
 
508 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3051  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  32.2 
 
 
508 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000997071  normal  0.381945 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>