More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_09271 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0197  transcription-repair coupling factor  33.88 
 
 		 1157 aa  648    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5656599999999998e-21 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4404  transcription-repair coupling factor  49.28 
 
 		 1166 aa  1212    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0017  transcription-repair coupling factor  35.45 
 
 		 1157 aa  665    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0270668  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14371  transcriptional-repair coupling factor  57.56 
 
 		 1193 aa  1407    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1287  transcription-repair coupling factor  35.92 
 
 		 1155 aa  652    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0502901  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  34.39 
 
 		 1169 aa  672    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10511  transcriptional-repair coupling factor  59.78 
 
 		 1167 aa  1404    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605187 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  36.06 
 
 		 1176 aa  701    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2656  transcription-repair coupling factor  34.03 
 
 		 1207 aa  659    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0357057  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4373  transcription-repair coupling factor  51.32 
 
 		 1158 aa  1233    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.456695  hitchhiker  0.00000184147 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  36.06 
 
 		 1176 aa  700    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  36.06 
 
 		 1178 aa  701    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  36.06 
 
 		 1176 aa  701    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09151  transcriptional-repair coupling factor  50.68 
 
 		 1175 aa  1192    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5258  transcription-repair coupling factor  36.37 
 
 		 1176 aa  700    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0059  transcription-repair coupling factor  36.06 
 
 		 1176 aa  701    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0067  transcription-repair coupling factor  34.84 
 
 		 1196 aa  696    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0424  transcription-repair coupling factor  34.23 
 
 		 1210 aa  637    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0369  transcriptional-repair coupling factor  59.43 
 
 		 1167 aa  1397    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10301  transcriptional-repair coupling factor  50.55 
 
 		 1170 aa  1207    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0538  transcription-repair coupling factor  33.59 
 
 		 1168 aa  655    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2767  transcription-repair coupling factor  49.46 
 
 		 1188 aa  1229    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4624  transcription-repair coupling factor  33.03 
 
 		 1211 aa  637    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09271  transcriptional-repair coupling factor  100 
 
 		 1169 aa  2402    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.254503  hitchhiker  0.0000230767 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0638  transcription-repair coupling factor  36.74 
 
 		 1141 aa  640    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138681  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0262  transcription-repair coupling factor  33.66 
 
 		 1179 aa  657    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0091  transcription-repair coupling factor  33.22 
 
 		 1161 aa  642    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0140  transcription-repair coupling factor  36.1 
 
 		 1159 aa  683    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00133746  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1176  transcription-repair coupling factor  55.58 
 
 		 1192 aa  1440    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.141232  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1300  transcription-repair coupling factor  56.49 
 
 		 1192 aa  1434    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1827  transcription-repair coupling factor  50.72 
 
 		 1169 aa  1279    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0072  transcription-repair coupling factor  33.16 
 
 		 1176 aa  671    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0902915  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  36.06 
 
 		 1176 aa  700    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0961  transcriptional-repair coupling factor  49.57 
 
 		 1174 aa  1168    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.489301  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1326  transcription-repair coupling factor  50.13 
 
 		 1153 aa  1264    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0700  transcription-repair coupling factor  35.04 
 
 		 1165 aa  664    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00154056  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0081  transcription-repair coupling factor  35.85 
 
 		 1183 aa  699    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000883466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0525  transcription-repair coupling factor  33.59 
 
 		 1168 aa  655    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2632  transcription-repair coupling factor  35.52 
 
 		 1178 aa  753    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0214  transcription-repair coupling factor  35.3 
 
 		 1197 aa  712    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0058  transcription-repair coupling factor  36.26 
 
 		 1176 aa  701    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0898  transcription-repair coupling factor  33.43 
 
 		 1214 aa  639    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.165774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21200  transcription-repair coupling factor  35.63 
 
 		 1170 aa  717    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.010694  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4312  transcription-repair coupling factor  51.4 
 
 		 1158 aa  1233    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1023  transcription-repair coupling factor  33.1 
 
 		 1168 aa  639    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3738  transcription-repair coupling factor  51.01 
 
 		 1168 aa  1252    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4549  transcription-repair coupling factor  33.55 
 
 		 1182 aa  672    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.191603 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0112  transcription-repair coupling factor  34.68 
 
 		 1179 aa  659    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0048  transcription-repair coupling factor  36.5 
 
 		 1176 aa  702    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4245  transcription-repair coupling factor  32.98 
 
 		 1211 aa  638    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3741  transcription-repair coupling factor  34.68 
 
 		 1182 aa  674    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.34254 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1355  transcription-repair coupling factor  35.25 
 
 		 1150 aa  681    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0111  transcription-repair coupling factor  37.67 
 
 		 1169 aa  722    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00148726  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2807  transcription-repair coupling factor  36.82 
 
 		 1162 aa  718    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2493  transcription-repair coupling factor  36.14 
 
 		 1162 aa  721    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0593  transcription-repair coupling factor  36.23 
 
 		 1165 aa  726    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1671  transcription-repair coupling factor  48.27 
 
 		 1180 aa  1162    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0214  transcription-repair coupling factor  33.76 
 
 		 1157 aa  655    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0683043  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0182  transcription-repair coupling factor  35.77 
 
 		 1183 aa  718    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0073  transcription-repair coupling factor  34.38 
 
 		 1073 aa  640    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0131  transcription-repair coupling factor  35.11 
 
 		 1197 aa  665    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.10317  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0011  transcription-repair coupling factor  34.29 
 
 		 1162 aa  666    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0062  transcription-repair coupling factor  36.06 
 
 		 1176 aa  701    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0271  transcription-repair coupling factor  34.07 
 
 		 1165 aa  681    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0399  transcription-repair coupling factor  33.39 
 
 		 1179 aa  652    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0007  transcription-repair coupling factor  35.52 
 
 		 1168 aa  652    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1478  transcription-repair coupling factor  35.71 
 
 		 1246 aa  702    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313815 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0499  transcription-repair coupling factor  34.97 
 
 		 1177 aa  673    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.245405  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3090  transcription-repair coupling factor  36.57 
 
 		 1174 aa  697    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.192538  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10301  transcriptional-repair coupling factor  50.04 
 
 		 1169 aa  1197    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2072  transcription-repair coupling factor  37.33 
 
 		 1123 aa  685    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4331  transcription-repair coupling factor  32.98 
 
 		 1211 aa  638    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.376638 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0048  transcription-repair coupling factor  35.7 
 
 		 1177 aa  704    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0048  transcription-repair coupling factor  36.55 
 
 		 1176 aa  714    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0050  transcription-repair coupling factor  37.61 
 
 		 1177 aa  720    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0188  transcription-repair coupling factor  32.93 
 
 		 1182 aa  632  1e-180  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0803  transcription-repair coupling factor  33.11 
 
 		 1188 aa  634  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0214899 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2685  transcription-repair coupling factor  33.84 
 
 		 1218 aa  630  1e-179  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0620  transcription-repair coupling factor  35.1 
 
 		 1244 aa  632  1e-179  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3479  transcription-repair coupling factor  32.85 
 
 		 1189 aa  630  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.706369  normal  0.219385 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1013  transcription-repair coupling factor  32.05 
 
 		 1205 aa  632  1e-179  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0526678 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1064  transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase)  34.04 
 
 		 1154 aa  628  1e-178  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.566316  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3926  transcription-repair coupling factor  33.09 
 
 		 1208 aa  629  1e-178  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.892466 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1092  transcription-repair coupling factor  34.47 
 
 		 1148 aa  627  1e-178  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0967  transcription-repair coupling factor  33.71 
 
 		 1170 aa  626  1e-178  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.8826  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11038  transcription-repair coupling factor mfd  32.43 
 
 		 1234 aa  625  1e-177  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.970521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07780  transcription-repair coupling factor Mfd  32.32 
 
 		 1212 aa  622  1e-177  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.111573 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1913  transcription-repair coupling factor  34.68 
 
 		 1192 aa  621  1e-176  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1281  transcription-repair coupling factor  36.05 
 
 		 1148 aa  619  1e-175  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0884  transcription-repair coupling factor  32.04 
 
 		 1216 aa  617  1e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2139  transcription-repair coupling factor  34.53 
 
 		 1207 aa  619  1e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0910  transcription-repair coupling factor  35.74 
 
 		 1179 aa  617  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0657  transcription-repair coupling factor  32.74 
 
 		 1202 aa  617  1e-175  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1298  transcription-repair coupling factor  33.65 
 
 		 1220 aa  617  1e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122104 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1245  transcription-repair coupling factor  32.78 
 
 		 1222 aa  617  1e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1651  transcription-repair coupling factor  34.14 
 
 		 1198 aa  616  1e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0949353  normal  0.53283 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0008  transcription-repair coupling factor  34.27 
 
 		 1165 aa  613  9.999999999999999e-175  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1246  transcription-repair coupling factor  34.16 
 
 		 1157 aa  614  9.999999999999999e-175  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.545868  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5241  transcription-repair coupling factor  34.5 
 
 		 1112 aa  613  9.999999999999999e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1299  transcription-repair coupling factor  34.16 
 
 		 1157 aa  613  9.999999999999999e-175  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>