More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_09021 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_09021  SpoU family tRNA/rRNA methyltransferase  100 
 
 
162 aa  333  9e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.149348  decreased coverage  0.000000259965 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1147  SpoU family tRNA/rRNA methyltransferase  60 
 
 
166 aa  192  2e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.303231  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14671  SpoU family tRNA/rRNA methyltransferase  60.67 
 
 
166 aa  189  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.120716 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1327  SpoU family tRNA/rRNA methyltransferase  58 
 
 
163 aa  183  8e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0858796 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10001  SpoU family tRNA/rRNA methyltransferase  58 
 
 
160 aa  181  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.437921  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09981  SpoU family tRNA/rRNA methyltransferase  57.33 
 
 
160 aa  179  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.582415  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0939  SpoU family tRNA/rRNA methyltransferase  56.67 
 
 
160 aa  175  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.113139  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0346  SpoU family tRNA/rRNA methyltransferase  52.98 
 
 
166 aa  170  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.519168  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10191  SpoU family tRNA/rRNA methyltransferase  52.32 
 
 
166 aa  169  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.349898  hitchhiker  0.000072924 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09431  SpoU family tRNA/rRNA methyltransferase  56.67 
 
 
160 aa  162  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1874  RNA methyltransferase TrmH, group 2  50 
 
 
156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2268  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  46.41 
 
 
152 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00048141  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2332  RNA methyltransferase  45.7 
 
 
152 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2205  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  46.41 
 
 
152 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1836  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.68 
 
 
152 aa  134  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.646648  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0238  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.3 
 
 
153 aa  133  9e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.460006  normal  0.0379576 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0450  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.03 
 
 
152 aa  132  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0313  rRNA methyltransferase, TrmH family  46.75 
 
 
169 aa  130  9e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000102446  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1004  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.38 
 
 
188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0026  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.7 
 
 
160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0307  RNA methyltransferase  48.3 
 
 
154 aa  128  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1880  RNA methyltransferase TrmH, group 2  45.7 
 
 
155 aa  128  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000892134  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0152  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.86 
 
 
166 aa  127  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0834  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.71 
 
 
152 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0618819 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33322  predicted protein  46.54 
 
 
183 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1308  rRNA methylase-like protein cspR  41.33 
 
 
153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0138  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.79 
 
 
153 aa  125  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0147773  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3194  RNA methyltransferase TrmH, group 2  45.21 
 
 
153 aa  125  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00355106  hitchhiker  0.0000259155 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1528  RNA methyltransferase  42.38 
 
 
152 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130723  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4609  TrmA family RNA methyltransferase  43.33 
 
 
153 aa  123  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00112922  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3946  RNA methyltransferase  47.62 
 
 
153 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0012  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.81 
 
 
153 aa  122  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121067  normal  0.063625 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1518  RNA methyltransferase  40.67 
 
 
153 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0265  RNA methyltransferase  45.58 
 
 
154 aa  122  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0255655 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4242  RNA methyltransferase  42.95 
 
 
154 aa  121  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4529  RNA methyltransferase  46.26 
 
 
154 aa  121  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0124  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.3 
 
 
154 aa  121  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1909  RNA methyltransferase  42.86 
 
 
156 aa  120  6e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0507641  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3498  RNA methyltransferase  46.26 
 
 
154 aa  120  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584508  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1943  RNA methyltransferase  42.86 
 
 
156 aa  120  6e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.158878  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3807  RNA methyltransferase  46.26 
 
 
154 aa  120  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.509614  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0213  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  46.26 
 
 
154 aa  120  7e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.653568  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4126  RNA methyltransferase  46.26 
 
 
154 aa  120  7e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00837599  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3736  RNA methyltransferase  46.26 
 
 
154 aa  120  7e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3934  RNA methyltransferase  46.26 
 
 
154 aa  120  7e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000097835  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2090  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.71 
 
 
153 aa  120  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000512947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0211  RNA methyltransferase  46.26 
 
 
154 aa  120  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000450191  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1700  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.38 
 
 
157 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000455125  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0924  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.95 
 
 
158 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.73808e-35 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4247  RNA methyltransferase  46.26 
 
 
154 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0108586  hitchhiker  0.00213899 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2278  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.68 
 
 
164 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.117934  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0132  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.05 
 
 
154 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1687  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.33 
 
 
164 aa  119  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0505  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  43.31 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3301  RNA methyltransferase  42.95 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0858286 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2088  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.79 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.227987  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1268  rRNA methylase (SpoU class)  44.87 
 
 
169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000665769  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1391  RNA methyltransferase  41.56 
 
 
156 aa  118  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444743  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5323  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  42.95 
 
 
151 aa  118  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2343  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  42.86 
 
 
159 aa  119  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.2665  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4881  RNA methyltransferase TrmH, group 2  42.28 
 
 
151 aa  118  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0580  RNA methyltransferase  44.81 
 
 
169 aa  118  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0432  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  40.91 
 
 
152 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.112018  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2885  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40.27 
 
 
158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.938343  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0453  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  41.06 
 
 
154 aa  118  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0805  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  42.86 
 
 
168 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.309509 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3854  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.62 
 
 
157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3293  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.95 
 
 
160 aa  117  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.212145  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0462  RNA methyltransferase  42.68 
 
 
162 aa  117  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4812  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  42.28 
 
 
157 aa  117  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799981  hitchhiker  0.00015333 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0264  RNA methyltransferase  44.9 
 
 
154 aa  117  9e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000114775 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3440  RNA methyltransferase TrmH, group 2  43.05 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1588  RNA methyltransferase  41.18 
 
 
182 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000775856  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1370  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  42.04 
 
 
157 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0127  RNA methyltransferase  40.26 
 
 
164 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00636988  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3322  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.31 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000129205  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3163  RNA methyltransferase  40.94 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4386  RNA methyltransferase  44.97 
 
 
154 aa  116  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2182  RNA methyltransferase TrmH, group 2  42.28 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00014694  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11010  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  39.74 
 
 
162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0271045  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0470  RNA methyltransferase  42.04 
 
 
162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0194  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.86 
 
 
156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.141115  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0548  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  42.04 
 
 
162 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.67047e-31 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0584  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  42.04 
 
 
162 aa  115  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0602  RNA methyltransferase  42.04 
 
 
162 aa  115  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.863015  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0516  RNA methyltransferase  42.04 
 
 
162 aa  115  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0459  RNA methyltransferase  42.04 
 
 
162 aa  115  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.172229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0455  RNA methyltransferase  42.04 
 
 
162 aa  115  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4754  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  42.04 
 
 
162 aa  115  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101258  hitchhiker  0.00000000000898658 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0547  RNA methyltransferase  42.04 
 
 
162 aa  115  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0694927  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0623  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  42.04 
 
 
162 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5052  RNA methyltransferase  39.61 
 
 
157 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0599206  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4038  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.28 
 
 
154 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09600  predicted rRNA methylase SpoU family  39.75 
 
 
159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000307354  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0763  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.75 
 
 
152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.635512  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0241  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  39.6 
 
 
171 aa  114  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1155  rRNA methylase (SpoU class)  43.87 
 
 
168 aa  114  5e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0200534  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0417  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  39.6 
 
 
171 aa  114  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.897811  hitchhiker  0.000103614 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1197  RNA methyltransferase  43.23 
 
 
164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.188758  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0081  RNA methyltransferase  42.86 
 
 
162 aa  114  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>