More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_07811 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_07811  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  100 
 
 
251 aa  511  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244277 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0100  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  43.43 
 
 
254 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07251  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  43.25 
 
 
254 aa  206  3e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041784 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0668  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  42.29 
 
 
257 aa  205  7e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0450086  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07231  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  42.29 
 
 
257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.419144  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07411  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  41.11 
 
 
259 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.54697  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07211  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  42.69 
 
 
257 aa  192  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.664589  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14251  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  43.03 
 
 
258 aa  188  9e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1285  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  41.3 
 
 
243 aa  171  1e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1192  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  38.55 
 
 
243 aa  156  3e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0525282  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0806  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  36.65 
 
 
243 aa  133  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5042  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  34.41 
 
 
235 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.319742  normal  0.272315 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1175  protein of unknown function DUF558  34.17 
 
 
241 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0765  hypothetical protein  35.48 
 
 
235 aa  121  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.417208  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4176  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  33.2 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1295  protein of unknown function DUF558  37.82 
 
 
239 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3545  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  35.41 
 
 
258 aa  120  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1323  protein of unknown function DUF558  37.82 
 
 
239 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.107771 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2076  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  32.11 
 
 
245 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1732  hypothetical protein  28.9 
 
 
245 aa  99  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.127797  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1186  protein of unknown function DUF558  31.22 
 
 
240 aa  95.9  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0115216 
 
 
-
 
NC_002978  WD1212  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  32.44 
 
 
228 aa  93.6  3e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2370  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  26.81 
 
 
248 aa  92  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00405719  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1513  hypothetical protein  31.3 
 
 
242 aa  92  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.680118  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3975  protein of unknown function DUF558  30.3 
 
 
251 aa  91.3  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0036  hypothetical protein  31.28 
 
 
227 aa  90.9  2e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2136  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  30.45 
 
 
257 aa  89.4  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0581453 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4594  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  26.43 
 
 
235 aa  87.8  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.246782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01646  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  28.63 
 
 
244 aa  87  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2182  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  27.54 
 
 
248 aa  87.4  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000164058  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1997  protein of unknown function DUF558  29.26 
 
 
232 aa  86.7  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2054  hypothetical protein  28.31 
 
 
249 aa  85.9  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2161  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  26.43 
 
 
244 aa  85.1  9e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1841  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  30.18 
 
 
246 aa  85.1  9e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.110015  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0337  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  26.5 
 
 
247 aa  84.3  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0215  hypothetical protein  31.09 
 
 
254 aa  85.1  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79026  normal  0.274516 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2898  protein of unknown function DUF558  32.24 
 
 
244 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0493  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  28.44 
 
 
239 aa  83.2  0.000000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2251  hypothetical protein  29.65 
 
 
245 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00851758  unclonable  0.000000139128 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0549  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  26.94 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3113  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  29.11 
 
 
250 aa  82.8  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0201  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  27.85 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1575  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  25.66 
 
 
245 aa  82  0.000000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.214687  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2013  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  26.03 
 
 
245 aa  82  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.551557 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1332  protein of unknown function DUF558  28.63 
 
 
246 aa  81.6  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000369372  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03291  hypothetical protein  30.26 
 
 
242 aa  81.6  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0838  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  28.19 
 
 
230 aa  81.6  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.083399 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0268  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  29.39 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.104604 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0587  hypothetical protein  28.88 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.256095  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3972  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  28.24 
 
 
243 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4114  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  29.52 
 
 
242 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002463  ribosomal RNA small subunit methyltransferase E  27.6 
 
 
243 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4065  protein of unknown function DUF558  25.22 
 
 
234 aa  80.1  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3224  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  27.97 
 
 
243 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000433897  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3472  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  29.07 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.871498  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0361  hypothetical protein  29.95 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0811383  normal  0.947003 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3050  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  26.75 
 
 
244 aa  80.1  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0610  protein of unknown function DUF558  30.18 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3038  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  30.84 
 
 
260 aa  79.3  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1295  hypothetical protein  29.77 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1795  protein of unknown function DUF558  29.03 
 
 
245 aa  79.3  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4859  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  27.6 
 
 
239 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.771335  normal  0.0487283 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3218  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  28.24 
 
 
257 aa  79  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000318733  hitchhiker  0.0000151601 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3834  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  26.69 
 
 
244 aa  79  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075899 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1461  protein of unknown function DUF558  27.35 
 
 
245 aa  79  0.00000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.7294  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0479  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  28.89 
 
 
239 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2703  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  26.18 
 
 
251 aa  78.6  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2249  hypothetical protein  28.63 
 
 
250 aa  78.2  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.368782  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4985  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  27.56 
 
 
239 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0506786  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7237  protein of unknown function DUF558  25.46 
 
 
234 aa  78.2  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3350  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  25.79 
 
 
243 aa  77.8  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000530934  decreased coverage  0.00215529 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0540  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  27.9 
 
 
241 aa  78.2  0.0000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00650711  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3334  hypothetical protein  30 
 
 
242 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12770  conserved hypothetical protein TIGR00046  25.51 
 
 
249 aa  77.8  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000425435  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2434  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  26.34 
 
 
249 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000454475  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1971  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  27.23 
 
 
257 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000062031 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1823  hypothetical protein  28.12 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.432103  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03572  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  26.13 
 
 
243 aa  77  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0379  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  26.32 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4134  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  28.7 
 
 
243 aa  77  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0859841 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4025  hypothetical protein  23.98 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00355277  hitchhiker  0.00148636 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1597  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  24.57 
 
 
234 aa  77  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.269441  normal  0.48223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3251  protein of unknown function DUF558  28.99 
 
 
244 aa  77  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.131486  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5035  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  27.15 
 
 
239 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1152  hypothetical protein  27.19 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.920301 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0227  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  25 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0047  hypothetical protein  28.32 
 
 
251 aa  75.9  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1575  hypothetical protein  26.27 
 
 
248 aa  75.9  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0110049  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0600  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  27.78 
 
 
243 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.604988  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03190  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  31.14 
 
 
239 aa  75.5  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0021  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  25.57 
 
 
243 aa  75.5  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0840  hypothetical protein  27.03 
 
 
248 aa  75.1  0.0000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.240115  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1722  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  28.95 
 
 
251 aa  75.1  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3268  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  26.85 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0123615  normal  0.0473044 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0839  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  24.89 
 
 
243 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000711088  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3341  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  26.85 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0620938  normal  0.265707 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0837  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  24.89 
 
 
243 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3343  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  24.89 
 
 
243 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3333  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  26.85 
 
 
243 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.338082  normal  0.6082 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0832  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  27.83 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>