289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_07091 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_07091  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  290  6e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0838601 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1183  hypothetical protein  58.04 
 
 
144 aa  194  5.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1287  hypothetical protein  60.14 
 
 
144 aa  191  4e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16031  hypothetical protein  57.55 
 
 
150 aa  180  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09451  hypothetical protein  56.25 
 
 
145 aa  169  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499948  normal  0.0862143 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0276  hypothetical protein  55.56 
 
 
153 aa  144  6e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.219326  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09251  hypothetical protein  43.75 
 
 
138 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10181  hypothetical protein  43.75 
 
 
137 aa  111  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09231  hypothetical protein  42.36 
 
 
138 aa  110  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0123975  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0864  hypothetical protein  42.36 
 
 
138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0226584  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2467  hypothetical protein  38.61 
 
 
159 aa  104  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.574307  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 
159 aa  104  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1306  protein of unknown function DUF163  40.67 
 
 
152 aa  100  7e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.820189  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0171  rRNA large subunit methyltransferase  37.09 
 
 
156 aa  99  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  36.31 
 
 
159 aa  98.2  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  32.9 
 
 
156 aa  94.4  5e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2069  rRNA large subunit methyltransferase  35.1 
 
 
156 aa  94  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.214177 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03300  conserved hypothetical protein TIGR00246  38.1 
 
 
148 aa  94  7e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  35.48 
 
 
159 aa  92.8  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1809  hypothetical protein  34.87 
 
 
156 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.454132  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  35.48 
 
 
159 aa  92.8  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1707  rRNA large subunit methyltransferase  35.76 
 
 
155 aa  92  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11098  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  31.61 
 
 
159 aa  92  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1902  rRNA large subunit methyltransferase  35.76 
 
 
155 aa  92  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0816634  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2337  rRNA large subunit methyltransferase  35.1 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390809  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  36.81 
 
 
160 aa  92.4  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0613  rRNA large subunit methyltransferase  37.67 
 
 
147 aa  91.7  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  35.48 
 
 
159 aa  91.3  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5626  rRNA large subunit methyltransferase  35.1 
 
 
156 aa  91.3  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1010  rRNA large subunit methyltransferase  34.44 
 
 
156 aa  91.3  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2216  rRNA large subunit methyltransferase  34.44 
 
 
156 aa  90.9  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3199  rRNA large subunit methyltransferase  36.42 
 
 
155 aa  90.5  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0492492  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2126  protein of unknown function DUF163  34.42 
 
 
156 aa  90.9  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.933959  normal  0.0354668 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  33.54 
 
 
159 aa  90.5  7e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  36.18 
 
 
157 aa  90.1  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  35.67 
 
 
159 aa  90.1  9e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2439  hypothetical protein  36.13 
 
 
173 aa  89.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0979  rRNA large subunit methyltransferase  34.44 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495213  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1687  rRNA large subunit methyltransferase  34.44 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2322  rRNA large subunit methyltransferase  34.44 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.749932 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  32.08 
 
 
159 aa  89.4  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2299  rRNA large subunit methyltransferase  34.44 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1993  rRNA large subunit methyltransferase  35.76 
 
 
156 aa  89.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350093  normal  0.83098 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  35.48 
 
 
159 aa  89  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  33.76 
 
 
160 aa  88.6  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  34.19 
 
 
159 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  35.48 
 
 
159 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  35.48 
 
 
159 aa  89  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  35.48 
 
 
159 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3264  rRNA large subunit methyltransferase  34.64 
 
 
156 aa  88.6  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  35.48 
 
 
159 aa  89  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2393  rRNA large subunit methyltransferase  35.76 
 
 
156 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147472  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  32.69 
 
 
160 aa  88.6  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  35.48 
 
 
159 aa  88.6  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  36.13 
 
 
177 aa  88.6  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2505  rRNA large subunit methyltransferase  31.17 
 
 
156 aa  88.2  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.945711  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  35.48 
 
 
159 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1296  rRNA large subunit methyltransferase  33.77 
 
 
156 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.433807  normal  0.073248 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  35.48 
 
 
167 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  35.48 
 
 
167 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2688  rRNA large subunit methyltransferase  33.77 
 
 
155 aa  87.8  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169878  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2624  rRNA large subunit methyltransferase  36.42 
 
 
155 aa  87.8  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0866518  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  28.39 
 
 
165 aa  87.4  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  34.84 
 
 
159 aa  87.4  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1889  rRNA large subunit methyltransferase  33.77 
 
 
156 aa  87  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1379  rRNA large subunit methyltransferase  33.77 
 
 
156 aa  87  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.588338  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1235  rRNA large subunit methyltransferase  33.77 
 
 
156 aa  87  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0486  hypothetical protein  34.97 
 
 
145 aa  87  7e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000178654  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1070  rRNA large subunit methyltransferase  33.77 
 
 
156 aa  87  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503879  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  31.61 
 
 
159 aa  87.4  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0797  rRNA large subunit methyltransferase  33.77 
 
 
156 aa  87  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0353  rRNA large subunit methyltransferase  33.77 
 
 
156 aa  87  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389517  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1226  rRNA large subunit methyltransferase  33.77 
 
 
156 aa  87  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3525  rRNA large subunit methyltransferase  33.77 
 
 
155 aa  87  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144296  normal  0.0487834 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  34.42 
 
 
157 aa  86.7  9e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  34.23 
 
 
153 aa  86.3  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167091  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4971  rRNA large subunit methyltransferase  32.47 
 
 
155 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0362  hypothetical protein  33.77 
 
 
156 aa  86.7  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1082  protein of unknown function DUF163  36.3 
 
 
152 aa  86.3  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  31.41 
 
 
159 aa  85.9  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3630  protein of unknown function DUF163  34.21 
 
 
153 aa  85.5  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000133759  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  31.13 
 
 
154 aa  85.9  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  32.26 
 
 
159 aa  85.5  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1973  rRNA large subunit methyltransferase  35.06 
 
 
155 aa  85.5  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0845  protein of unknown function DUF163  33.33 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0190186 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  31.61 
 
 
159 aa  85.9  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  34.19 
 
 
159 aa  85.1  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1764  rRNA large subunit methyltransferase  33.75 
 
 
162 aa  85.1  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.190607 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2788  rRNA large subunit methyltransferase  34.87 
 
 
155 aa  85.1  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2916  protein of unknown function DUF163  33.54 
 
 
159 aa  84.7  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  30.97 
 
 
159 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1733  rRNA large subunit methyltransferase  35.06 
 
 
155 aa  84.7  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3770  protein of unknown function DUF163  30.97 
 
 
157 aa  84.3  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1447  protein of unknown function DUF163  35.1 
 
 
154 aa  84.7  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000183222  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0780  rRNA large subunit methyltransferase  33.12 
 
 
159 aa  84.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329962  normal  0.230436 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0378  hypothetical protein  36 
 
 
137 aa  84  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0592  rRNA large subunit methyltransferase  32.03 
 
 
155 aa  84  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.338399 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2195  rRNA large subunit methyltransferase  33.11 
 
 
156 aa  84  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2080  rRNA large subunit methyltransferase  35.06 
 
 
155 aa  84  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  34.03 
 
 
145 aa  83.6  8e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>