132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_06941 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_06941  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  100 
 
 
115 aa  234  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00555121  normal  0.159245 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15781  STAS domain-containing protein  73.04 
 
 
118 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1153  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  70.43 
 
 
129 aa  170  7.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.406028  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1306  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  66.96 
 
 
128 aa  166  9e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09291  STAS domain-containing protein  70.83 
 
 
99 aa  147  3e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0243906 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0260  anti-anti-sigma regulatory factor  69.79 
 
 
99 aa  144  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2121  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  49.12 
 
 
130 aa  107  5e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3195  anti-sigma-factor antagonist  47.79 
 
 
132 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1941  anti-sigma-factor antagonist  45.54 
 
 
114 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623131  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4411  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  44.25 
 
 
133 aa  94.4  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3686  anti-sigma-factor antagonist  42.99 
 
 
116 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2424  anti-sigma-factor antagonist  42.99 
 
 
116 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2283  anti-sigma-factor antagonist  45.98 
 
 
93 aa  75.1  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.389876  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2311  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  56.45 
 
 
80 aa  69.3  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0655484 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1122  anti-anti-sigma factor  26.42 
 
 
112 aa  53.5  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  26.67 
 
 
109 aa  51.2  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  29.13 
 
 
111 aa  50.4  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  29.21 
 
 
111 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  28.42 
 
 
111 aa  48.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2021  anti-sigma-factor antagonist  27.52 
 
 
112 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.60085  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  28.28 
 
 
120 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0312  hypothetical protein, putative anti-sigma factor antagonist  26.88 
 
 
105 aa  47.8  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  24.24 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1481  anti-sigma-factor antagonist  27.18 
 
 
128 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979403  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  30.95 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  25.84 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  26.92 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1812  hypothetical protein  61.54 
 
 
41 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  28.28 
 
 
111 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  26.32 
 
 
122 aa  45.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1161  anti-sigma-factor antagonist  23.53 
 
 
436 aa  45.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.871215  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0901  anti-sigma-factor antagonist  26.97 
 
 
112 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  27.84 
 
 
117 aa  45.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1366  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  27.84 
 
 
107 aa  44.7  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.528676  normal  0.641817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3003  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 
130 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1423  anti-sigma-factor antagonist  26.58 
 
 
116 aa  45.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  25.84 
 
 
111 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  25.84 
 
 
111 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  25.84 
 
 
111 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 
115 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  27.78 
 
 
111 aa  44.3  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2983  anti-sigma-factor antagonist  28.3 
 
 
111 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  27.38 
 
 
151 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1066  anti sigma b factor antagonist RsbV  25.84 
 
 
112 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8531e-37 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  26.42 
 
 
113 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1663  anti-sigma-factor antagonist  24.75 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.457146  normal  0.122734 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  25.49 
 
 
123 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3867  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  27.66 
 
 
114 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0300049 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2150  anti-sigma-factor antagonist  34.43 
 
 
99 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302168  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4098  anti-sigma-factor antagonist  22.12 
 
 
120 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.217078  normal  0.168859 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  26.97 
 
 
104 aa  43.5  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  26.97 
 
 
104 aa  43.5  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  26.42 
 
 
110 aa  43.5  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1084  anti sigma b factor antagonist RsbV  24.72 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  23.16 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  26.53 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  23.16 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  27.88 
 
 
116 aa  42.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2076  anti-anti-sigma factor family protein  25.33 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.898204  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4407  anti-sigma-factor antagonist  28 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.508963  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  26.21 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1682  anti-sigma-factor antagonist  28.75 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  22.47 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  26.09 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003528  anti-anti-sigma regulatory factor  29.67 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4702  anti-sigma-factor antagonist  26.37 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.886766  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  24.69 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  32.35 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02233  hypothetical protein  27.84 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3486  anti-sigma-factor antagonist  33.85 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3105  anti-sigma-factor antagonist  31.43 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  23.6 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  25.74 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  27.38 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1392  anti-sigma-factor antagonist  26.04 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0962748  normal  0.699009 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2286  anti-sigma-factor antagonist  22.94 
 
 
113 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.964684  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  32.31 
 
 
120 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  27.38 
 
 
122 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  25.32 
 
 
113 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  23.81 
 
 
117 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  25.32 
 
 
113 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  25.32 
 
 
113 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4938  anti-sigma-factor antagonist  28.16 
 
 
125 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.704435 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  24.72 
 
 
117 aa  41.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11396  anti-anti-sigma factor rsfA  21.62 
 
 
128 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.971346 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3738  anti-sigma-factor antagonist  26.21 
 
 
121 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  21.21 
 
 
113 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  25.84 
 
 
112 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  23.68 
 
 
116 aa  41.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10331  hypothetical protein  63.64 
 
 
35 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.639916  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1183  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 
112 aa  41.2  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  26.87 
 
 
116 aa  41.2  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  26.42 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  26.42 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  30.61 
 
 
114 aa  41.2  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  22.34 
 
 
110 aa  41.2  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  24.74 
 
 
117 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>