More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_03121 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_03121  NUDIX hydrolase  100 
 
 
189 aa  387  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03661  NUDIX hydrolase  67.21 
 
 
186 aa  261  4e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1652  NUDIX hydrolase  67.21 
 
 
186 aa  261  6e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0238  NUDIX hydrolase  65.05 
 
 
186 aa  260  8.999999999999999e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0212  NUDIX hydrolase  65.05 
 
 
186 aa  259  2e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.465676  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25181  NUDIX hydrolase  65.09 
 
 
189 aa  244  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  59.76 
 
 
187 aa  208  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  59.76 
 
 
187 aa  207  6e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  58.54 
 
 
187 aa  204  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03191  NUDIX hydrolase  58.33 
 
 
186 aa  201  7e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.798424  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  56.65 
 
 
184 aa  194  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  55.21 
 
 
182 aa  183  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0237  NUDIX hydrolase  52.22 
 
 
183 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373824  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  53.37 
 
 
183 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  53.37 
 
 
183 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2271  ADP-ribose pyrophosphatase  52.91 
 
 
183 aa  177  7e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  52.15 
 
 
184 aa  176  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  49.15 
 
 
195 aa  170  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 
194 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
176 aa  123  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  38.69 
 
 
189 aa  122  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  40.72 
 
 
186 aa  122  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  37.58 
 
 
171 aa  121  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
179 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 
184 aa  120  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  41.67 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  38.36 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 
180 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 
186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0268  NUDIX hydrolase  42.14 
 
 
165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.880251  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  38.36 
 
 
177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  35.23 
 
 
173 aa  108  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  40.41 
 
 
180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  34.66 
 
 
173 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  37.27 
 
 
183 aa  107  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 
178 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  38.65 
 
 
177 aa  107  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  37.68 
 
 
185 aa  106  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 
173 aa  106  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  36.46 
 
 
204 aa  106  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  34.95 
 
 
204 aa  103  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 
179 aa  103  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  37.34 
 
 
180 aa  103  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 
179 aa  102  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  37.82 
 
 
207 aa  101  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 
196 aa  101  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 
199 aa  101  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  38.06 
 
 
172 aa  101  8e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3354  mutT/nudix family protein  38.46 
 
 
173 aa  100  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  36.54 
 
 
177 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2834  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 
169 aa  99.8  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 
173 aa  99.8  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 
196 aa  99.4  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  35.26 
 
 
196 aa  99  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 
196 aa  99.4  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  30.95 
 
 
210 aa  99  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  33.94 
 
 
187 aa  99  4e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  40.71 
 
 
199 aa  99  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  35.26 
 
 
196 aa  98.6  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  35.26 
 
 
196 aa  98.6  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 
184 aa  98.2  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  37.91 
 
 
164 aa  98.2  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  35.76 
 
 
182 aa  97.1  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 
194 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 
178 aa  97.4  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 
179 aa  97.4  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  34.78 
 
 
179 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  34.78 
 
 
179 aa  96.7  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  34.78 
 
 
179 aa  96.7  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  34.78 
 
 
179 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  41.84 
 
 
171 aa  96.7  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  34.78 
 
 
179 aa  96.7  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  37.27 
 
 
176 aa  96.3  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  32.87 
 
 
196 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  34.78 
 
 
179 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  34.78 
 
 
179 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 
213 aa  96.3  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  38.22 
 
 
190 aa  95.9  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  35.42 
 
 
179 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  37.09 
 
 
169 aa  95.5  4e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  33.53 
 
 
179 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.12 
 
 
196 aa  95.5  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1876  NUDIX hydrolase  35.17 
 
 
203 aa  95.1  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.48572 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  36.55 
 
 
205 aa  95.1  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1507  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 
201 aa  95.1  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.694951  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  38.26 
 
 
281 aa  94.4  9e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3241  NUDIX hydrolase  36.49 
 
 
200 aa  94.4  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.021012  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 
210 aa  94.4  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  32.47 
 
 
196 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.47 
 
 
196 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.47 
 
 
196 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.47 
 
 
196 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  32.47 
 
 
196 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1145  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.47 
 
 
196 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107087  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  34.27 
 
 
196 aa  93.2  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  34.27 
 
 
194 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 
179 aa  93.6  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2211  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 
164 aa  92.4  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.75 
 
 
196 aa  92.4  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 
203 aa  91.7  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>