More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_01781 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  83.47 
 
 
381 aa  669    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  81.6 
 
 
375 aa  656    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  81.33 
 
 
375 aa  654    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  82.93 
 
 
381 aa  662    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  78.61 
 
 
396 aa  634    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  79.89 
 
 
397 aa  647    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  83.47 
 
 
381 aa  668    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  100 
 
 
378 aa  785    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26921  citrate synthase  84.04 
 
 
396 aa  659    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  83.47 
 
 
381 aa  667    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  68.28 
 
 
378 aa  560  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  67.91 
 
 
383 aa  558  1e-158  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  68.82 
 
 
378 aa  560  1e-158  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  69.35 
 
 
378 aa  555  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0612  citrate synthase  70.78 
 
 
386 aa  556  1e-157  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.148892  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  67.12 
 
 
386 aa  551  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  69.35 
 
 
389 aa  551  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  67.12 
 
 
386 aa  551  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2672  citrate synthase  53.56 
 
 
386 aa  431  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.530506  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2141  Citrate (Si)-synthase  54.74 
 
 
389 aa  428  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.636674  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3065  citrate synthase  53.56 
 
 
386 aa  431  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  53.14 
 
 
387 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0350  citrate synthase  50.92 
 
 
391 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  48.79 
 
 
375 aa  399  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.55 
 
 
379 aa  343  2e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  47.3 
 
 
385 aa  343  2.9999999999999997e-93  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  46.01 
 
 
372 aa  334  1e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.38 
 
 
390 aa  334  2e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.53 
 
 
377 aa  323  2e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  44.15 
 
 
372 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  44.15 
 
 
382 aa  315  6e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  44.41 
 
 
371 aa  315  8e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  43.88 
 
 
371 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  43.88 
 
 
371 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  43.88 
 
 
371 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  43.88 
 
 
371 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  43.88 
 
 
371 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  43.88 
 
 
382 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  43.88 
 
 
382 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  43.88 
 
 
382 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.67 
 
 
380 aa  314  1.9999999999999998e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.59 
 
 
378 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  41.98 
 
 
373 aa  311  2e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.7 
 
 
430 aa  309  5.9999999999999995e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  43.88 
 
 
386 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.68 
 
 
382 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  40.8 
 
 
370 aa  307  2.0000000000000002e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.62 
 
 
382 aa  304  1.0000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  42.25 
 
 
373 aa  303  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  42.25 
 
 
373 aa  303  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  43.16 
 
 
374 aa  300  3e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.42 
 
 
382 aa  300  3e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0563  citrate synthase  41.09 
 
 
412 aa  298  1e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.62 
 
 
397 aa  298  1e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2234  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.41 
 
 
409 aa  298  1e-79  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.709963 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3584  citrate synthase I  41.9 
 
 
425 aa  293  3e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887444 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2105  citrate (Si)-synthase  42.97 
 
 
397 aa  293  4e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414267  normal  0.0115455 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1692  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.45 
 
 
409 aa  292  5e-78  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.141022  normal  0.100865 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.33 
 
 
379 aa  292  8e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1130  citrate synthase I  40.87 
 
 
431 aa  291  9e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.684999  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1187  citrate synthase  40.83 
 
 
431 aa  291  1e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1275  citrate synthase  40.36 
 
 
427 aa  290  2e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.152797  normal  0.229785 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  39.64 
 
 
431 aa  289  7e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02359  type II citrate synthase  42.04 
 
 
442 aa  289  7e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0995  citrate synthase I  39.49 
 
 
436 aa  286  4e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0713  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.05 
 
 
404 aa  286  5e-76  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.756288  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1088  citrate synthase I  39.48 
 
 
443 aa  286  5e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.864155  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.98 
 
 
380 aa  286  5e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37633  predicted protein  38.89 
 
 
544 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.506551  normal  0.0169313 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2068  citrate synthase I  39.9 
 
 
450 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.355535  normal  0.380729 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1964  citrate synthase I  40 
 
 
427 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148224  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2136  citrate synthase I  40.16 
 
 
427 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.873392  normal  0.0485985 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1035  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.48 
 
 
375 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1731  citrate synthase I  39.53 
 
 
439 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0072  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.44 
 
 
372 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1870  citrate synthase I  40.16 
 
 
448 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.859731 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3716  citrate synthase I  40.16 
 
 
430 aa  283  3.0000000000000004e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364105  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1063  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.16 
 
 
393 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0154  citrate synthase  40.43 
 
 
374 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.649155 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33600  citrate synthase  40.16 
 
 
437 aa  283  4.0000000000000003e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1132  citrate synthase  38.86 
 
 
431 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4194  type II citrate synthase  39.22 
 
 
429 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0867349  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3765  type II citrate synthase  39.22 
 
 
429 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0679988  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29820  type II citrate synthase  38.54 
 
 
427 aa  282  6.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0995  citrate synthase I  39.07 
 
 
434 aa  282  7.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.655069 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2224  citrate synthase I  40.31 
 
 
425 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1660  type II citrate synthase  39.22 
 
 
429 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0317  citrate synthase I  40.36 
 
 
447 aa  281  1e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004117  citrate synthase (si)  39.74 
 
 
429 aa  280  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01350  type II citrate synthase  39.74 
 
 
429 aa  281  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0924  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.41 
 
 
379 aa  280  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.78 
 
 
387 aa  280  3e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0999  citrate synthase I  38.97 
 
 
438 aa  280  3e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4703  citrate synthase I  39.74 
 
 
463 aa  280  3e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  39.9 
 
 
433 aa  280  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2031  citrate (Si)-synthase  40.64 
 
 
473 aa  280  3e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602388  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3517  type II citrate synthase  38.96 
 
 
429 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1148  type II citrate synthase  39.38 
 
 
430 aa  280  4e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3212  citrate synthase  40 
 
 
427 aa  280  4e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4838  type II citrate synthase  39.58 
 
 
434 aa  279  5e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.782916  normal  0.17167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>