More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_01441 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_01441  thymidylate kinase  100 
 
 
215 aa  441  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.65977 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  54.93 
 
 
209 aa  258  4e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26491  thymidylate kinase  54.25 
 
 
216 aa  244  8e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0312  thymidylate kinase  54.07 
 
 
209 aa  244  9e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01581  thymidylate kinase  54.76 
 
 
210 aa  239  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.978183  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  53.33 
 
 
212 aa  236  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  51.9 
 
 
212 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  51.9 
 
 
212 aa  231  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1496  thymidylate kinase  55.24 
 
 
211 aa  222  3e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0919131  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02021  thymidylate kinase  54.29 
 
 
211 aa  221  9e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.409154  normal  0.831835 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  43.54 
 
 
215 aa  176  3e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  40.28 
 
 
211 aa  164  9e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  40.59 
 
 
203 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  40.53 
 
 
234 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  45.23 
 
 
225 aa  157  8e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  42.78 
 
 
209 aa  152  4e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  42.11 
 
 
208 aa  151  8.999999999999999e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  40.49 
 
 
199 aa  150  2e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  36.7 
 
 
215 aa  149  3e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  39.05 
 
 
206 aa  148  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  42.78 
 
 
901 aa  148  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  37.62 
 
 
221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  40.65 
 
 
686 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  38.97 
 
 
207 aa  144  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  41.67 
 
 
205 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  42.7 
 
 
207 aa  142  3e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  44.81 
 
 
205 aa  142  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  40.62 
 
 
204 aa  142  4e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  40.53 
 
 
207 aa  142  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  41.18 
 
 
205 aa  141  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  38.39 
 
 
217 aa  141  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  36.62 
 
 
212 aa  141  8e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  35.78 
 
 
217 aa  140  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  38.16 
 
 
207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  40.11 
 
 
205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  37.61 
 
 
233 aa  139  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  37.93 
 
 
208 aa  139  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  41.99 
 
 
206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  37.14 
 
 
703 aa  138  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  42.86 
 
 
200 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  42.54 
 
 
707 aa  136  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  37.98 
 
 
215 aa  136  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  40.21 
 
 
217 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  36.28 
 
 
213 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  39.8 
 
 
213 aa  135  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  38.78 
 
 
688 aa  134  7.000000000000001e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  37.26 
 
 
213 aa  134  8e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  35.58 
 
 
210 aa  134  9e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  38.28 
 
 
203 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  39.66 
 
 
224 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  39.58 
 
 
222 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  36.87 
 
 
213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  38.39 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  35.55 
 
 
216 aa  134  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  39.23 
 
 
210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  35.89 
 
 
281 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  40.66 
 
 
206 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  39.78 
 
 
214 aa  132  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  40.66 
 
 
206 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  40.66 
 
 
206 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  40.66 
 
 
206 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  40.66 
 
 
206 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  40.66 
 
 
206 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  40.66 
 
 
206 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  39.6 
 
 
686 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  39.81 
 
 
207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  40.66 
 
 
206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  41.76 
 
 
205 aa  132  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  34.42 
 
 
221 aa  132  6e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  39.35 
 
 
223 aa  131  6.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  36.15 
 
 
212 aa  131  7.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  40.88 
 
 
206 aa  131  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  36.14 
 
 
705 aa  131  9e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  38.5 
 
 
197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  35.59 
 
 
219 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  38.62 
 
 
204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  37.74 
 
 
212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  37.62 
 
 
671 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  36.89 
 
 
223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  37.38 
 
 
223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  40.33 
 
 
214 aa  129  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  38.67 
 
 
206 aa  129  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  40.33 
 
 
206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  40.33 
 
 
206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  39.15 
 
 
243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  40.33 
 
 
206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  42.22 
 
 
234 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  40.33 
 
 
206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  40.33 
 
 
206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  40.22 
 
 
206 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  38.68 
 
 
203 aa  128  6e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  36.28 
 
 
688 aa  128  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  41.9 
 
 
662 aa  128  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  36.79 
 
 
210 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  37.57 
 
 
219 aa  127  9.000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  38.55 
 
 
211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  39.68 
 
 
214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  36.82 
 
 
224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  40.33 
 
 
206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  35.21 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>