More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_00871 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_00871  recombination factor protein RarA  100 
 
 
455 aa  939    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0752794  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02651  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  67.93 
 
 
735 aa  651    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1441  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  66.89 
 
 
734 aa  627  1e-178  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.641024  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01421  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  66.45 
 
 
734 aa  623  1e-177  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.869861  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2304  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  67.75 
 
 
721 aa  616  1e-175  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.320416 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0388  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  66.43 
 
 
733 aa  610  1e-173  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  58.18 
 
 
739 aa  557  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  57.57 
 
 
731 aa  542  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  59.46 
 
 
458 aa  528  1e-149  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00901  recombination factor protein RarA  55.68 
 
 
429 aa  498  1e-140  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00891  recombination factor protein RarA  54.76 
 
 
429 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  55.99 
 
 
726 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  54.73 
 
 
441 aa  491  1e-137  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0080  recombination factor protein RarA  55.22 
 
 
429 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00871  recombination factor protein RarA  55.22 
 
 
428 aa  488  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  51.48 
 
 
441 aa  452  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  50.23 
 
 
450 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  52.1 
 
 
447 aa  441  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  48.64 
 
 
444 aa  434  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  51.34 
 
 
437 aa  430  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  50.73 
 
 
435 aa  425  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0027  AAA ATPase central domain protein  48.57 
 
 
459 aa  424  1e-117  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.797145 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  48.28 
 
 
438 aa  423  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  47.29 
 
 
441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  47.79 
 
 
432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1199  AAA ATPase central domain protein  47.41 
 
 
428 aa  402  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  47.87 
 
 
422 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2558  AAA ATPase central domain protein  45.49 
 
 
446 aa  400  9.999999999999999e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  47.54 
 
 
441 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  46.53 
 
 
432 aa  396  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05070  Recombination protein MgsA  48.01 
 
 
435 aa  395  1e-109  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.395442  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0452  AAA ATPase central domain protein  46.88 
 
 
443 aa  392  1e-108  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  46.82 
 
 
435 aa  392  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  47.78 
 
 
434 aa  389  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  47.07 
 
 
457 aa  389  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  47.31 
 
 
457 aa  388  1e-106  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  46.59 
 
 
440 aa  384  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0141  ATPase central domain-containing protein  46.17 
 
 
416 aa  384  1e-105  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  43.86 
 
 
432 aa  385  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  44.06 
 
 
440 aa  384  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07770  Recombination protein MgsA  46.09 
 
 
446 aa  385  1e-105  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.138045 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  46.14 
 
 
457 aa  380  1e-104  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  47.07 
 
 
435 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  47.31 
 
 
434 aa  382  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  45.06 
 
 
432 aa  381  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  47.14 
 
 
505 aa  376  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  45.66 
 
 
485 aa  372  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  43.38 
 
 
451 aa  373  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  42.92 
 
 
463 aa  370  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  44.63 
 
 
447 aa  370  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  44.13 
 
 
431 aa  367  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  45.93 
 
 
443 aa  366  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  44 
 
 
447 aa  362  7.0000000000000005e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  46.48 
 
 
437 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  46.48 
 
 
437 aa  361  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  45.74 
 
 
448 aa  361  2e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1076  recombination factor protein RarA  43.07 
 
 
544 aa  359  7e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1498  AAA ATPase central domain protein  42.07 
 
 
435 aa  357  2.9999999999999997e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3121  recombination factor protein RarA  43.61 
 
 
459 aa  356  5.999999999999999e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0192623  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  46.43 
 
 
437 aa  355  7.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  44.93 
 
 
463 aa  351  1e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3217  recombination factor protein RarA  43.96 
 
 
519 aa  350  2e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0809903  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  44.39 
 
 
434 aa  350  4e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  43.66 
 
 
456 aa  348  2e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3309  AAA ATPase central domain protein  42.66 
 
 
494 aa  348  2e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000347883  normal  0.0560035 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  42.29 
 
 
439 aa  346  4e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  42.16 
 
 
461 aa  346  4e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  42.62 
 
 
444 aa  345  1e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  44.79 
 
 
423 aa  345  1e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0774  recombination factor protein RarA  48.05 
 
 
444 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0591315  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2386  recombination factor protein RarA  44.26 
 
 
440 aa  343  4e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.010148 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  43.33 
 
 
459 aa  343  5e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  43.76 
 
 
429 aa  343  5e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5272  recombination factor protein RarA  41.91 
 
 
448 aa  342  5.999999999999999e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  40.94 
 
 
447 aa  342  9e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3254  recombination factor protein RarA  41.71 
 
 
455 aa  342  1e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0183203  hitchhiker  0.0000000120861 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1989  recombination factor protein RarA  43.24 
 
 
447 aa  341  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1721  recombination factor protein RarA  43 
 
 
447 aa  340  2e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  43.78 
 
 
441 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1685  recombination factor protein RarA  42.75 
 
 
447 aa  340  2.9999999999999998e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.171868 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  42.26 
 
 
445 aa  340  2.9999999999999998e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1691  recombination factor protein RarA  42.47 
 
 
465 aa  340  2.9999999999999998e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  43.54 
 
 
441 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  43.78 
 
 
441 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  42.55 
 
 
441 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2594  recombination factor protein RarA  42.51 
 
 
447 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.558915  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2081  recombination factor protein RarA  45.09 
 
 
441 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  43.5 
 
 
453 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  44.76 
 
 
426 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2683  recombination factor protein RarA  42.51 
 
 
444 aa  337  2.9999999999999997e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.826715  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1615  recombination factor protein RarA  42.51 
 
 
444 aa  337  2.9999999999999997e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.240713  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  42.55 
 
 
441 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1416  recombination factor protein RarA  42.51 
 
 
447 aa  336  5e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3882  AAA ATPase central domain-containing protein  44.55 
 
 
448 aa  336  5.999999999999999e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.781323 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0627  recombination factor protein RarA  42.59 
 
 
449 aa  336  5.999999999999999e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0620237  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2022  recombination factor protein RarA  42.82 
 
 
443 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000134258  hitchhiker  0.0000234257 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  42.31 
 
 
440 aa  335  7e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  42.31 
 
 
440 aa  335  7e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003877  ATPase AAA family  42.12 
 
 
449 aa  335  1e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000221838  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01799  recombination factor protein RarA  41.94 
 
 
451 aa  335  1e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>