32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_00721 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_00721  high light inducible protein  100 
 
 
82 aa  167  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.624875 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2265  high light inducible protein  60.32 
 
 
66 aa  84.3  5e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.594666 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03161  high light inducible protein  48.68 
 
 
113 aa  83.6  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.906124 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01281  high light inducible protein  49.38 
 
 
79 aa  80.1  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0214149  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0066  high light inducible protein-like  44.74 
 
 
91 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00751  high light inducible protein  54 
 
 
91 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0415  high light inducible protein  53.12 
 
 
69 aa  67.4  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00731  high light inducible protein  41.77 
 
 
77 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00761  high light inducible protein  54 
 
 
91 aa  64.3  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1427  high light inducible protein hli5  50.62 
 
 
79 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1282  hypothetical protein  46.55 
 
 
66 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1331  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  58.54 
 
 
58 aa  60.1  0.000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2057  CAB/ELIP/HLIP-related protein  44.64 
 
 
59 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519028 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0691  HLIP; single helix LHC light protein  45.45 
 
 
58 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000595991  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0672  CAB/ELIP/HLIP-related protein  45.45 
 
 
58 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0175  CAB/ELIP/HLIP-related protein  43.64 
 
 
56 aa  51.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000121153  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3583  CAB/ELIP/HLIP-like protein  48.78 
 
 
56 aa  49.3  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1759  CAB/ELIP/HLIP-related protein  43.18 
 
 
67 aa  48.9  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1910  CAB/ELIP/HLIP-related protein  39.34 
 
 
56 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0846233  normal  0.275472 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0155  hypothetical protein  39.47 
 
 
94 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2720  CAB/ELIP/HLIP-related protein  48.78 
 
 
54 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.556008  hitchhiker  0.0000310202 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16731  putative high light inducible protein  42.5 
 
 
50 aa  43.9  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2064  hypothetical protein  35.38 
 
 
63 aa  43.9  0.0009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0330706  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16621  putative high light inducible protein  42.5 
 
 
50 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0646927  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16861  putative high light inducible protein  42.5 
 
 
50 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2542  hypothetical protein  40 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1575  putative high light inducible protein  42.5 
 
 
50 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3554  high light inducible protein  50 
 
 
59 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18831  putative high light inducible protein  37.5 
 
 
50 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1013  putative high light inducible protein  37.5 
 
 
50 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0608  putative high light inducible protein  38.46 
 
 
50 aa  40.4  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131116  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4300  hypothetical protein  33.85 
 
 
66 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>