More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_00511 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 
876 aa  663    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 
876 aa  662    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 
859 aa  664    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 
875 aa  645    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 
875 aa  644    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3124  alanyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 
874 aa  689    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.600607  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 
867 aa  664    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3115  alanyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 
874 aa  689    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0471495  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0797  alanyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 
884 aa  664    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4471  alanyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 
880 aa  652    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00256411  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3238  alanyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 
875 aa  638    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000222674  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00511  alanyl-tRNA synthetase  55.71 
 
 
886 aa  1013    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1201  alanyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 
885 aa  637    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3428  alanyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 
874 aa  665    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 
874 aa  667    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4284  alanyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 
880 aa  650    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4121  alanyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 
880 aa  648    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000164484  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4132  alanyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 
880 aa  650    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 
874 aa  670    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 
860 aa  667    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
860 aa  665    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3556  alanyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 
899 aa  660    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118826  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1719  alanyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 
874 aa  651    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3101  alanyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 
880 aa  654    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.438368  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0990  alanyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 
865 aa  635    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1377  alanyl-tRNA synthetase  59.54 
 
 
886 aa  1040    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.522237  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 
874 aa  680    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0553  alanyl-tRNA synthetase  42.7 
 
 
886 aa  659    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1164  alanyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
885 aa  635    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.855181  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0226  alanyl-tRNA synthetase  57.24 
 
 
880 aa  1008    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821584  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 
874 aa  673    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0926  alanine--tRNA ligase  42.81 
 
 
873 aa  663    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.961534  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 
876 aa  670    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1637  alanyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 
874 aa  673    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365835  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 
882 aa  655    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
897 aa  678    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2173  alanyl-tRNA synthetase  66.55 
 
 
899 aa  1162    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00451  alanyl-tRNA synthetase  55.31 
 
 
886 aa  1028    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2518  alanyl-tRNA synthetase  66.32 
 
 
889 aa  1116    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 
876 aa  670    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 
876 aa  662    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 
864 aa  647    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4616  alanyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 
880 aa  650    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00215408  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 
863 aa  680    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0045  alanyl-tRNA synthetase  55.2 
 
 
886 aa  1025    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.214669  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0876  alanyl-tRNA synthetase  59.77 
 
 
899 aa  1016    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.27264  normal  0.0167096 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0022  alanyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 
862 aa  650    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711035  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28371  alanyl-tRNA synthetase  65.77 
 
 
930 aa  1166    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.578023 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 
881 aa  652    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 
874 aa  668    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
874 aa  677    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3904  alanyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 
904 aa  636    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.639044  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1670  alanyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 
872 aa  637    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 
878 aa  696    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0590  alanyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 
876 aa  646    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 
874 aa  676    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03511  alanyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 
865 aa  636    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0568  alanyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 
874 aa  640    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3628  alanyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 
872 aa  644    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168897  hitchhiker  0.00000464441 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 
874 aa  683    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 
874 aa  669    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1675  alanyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 
876 aa  645    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.131241  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 
863 aa  661    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 
860 aa  645    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 
876 aa  662    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 
884 aa  692    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1423  alanyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 
874 aa  673    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429159  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1611  alanyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 
903 aa  640    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0248511  hitchhiker  0.0000135737 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32618  predicted protein  53.96 
 
 
906 aa  899    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.63515 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2323  alanyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 
875 aa  651    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0626442  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 
897 aa  676    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 
865 aa  691    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1709  alanyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 
876 aa  645    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00471  alanyl-tRNA synthetase  55.2 
 
 
886 aa  1024    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 
874 aa  673    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 
874 aa  662    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4806  alanyl-tRNA synthetase  59.39 
 
 
874 aa  1003    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00251805  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1127  alanyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 
874 aa  667    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.435644  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1198  alanyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 
874 aa  664    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.400961  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 
869 aa  666    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 
874 aa  659    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0468  alanyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 
880 aa  639    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00473822  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1660  alanyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 
874 aa  673    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0773336  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 
874 aa  679    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 
874 aa  636    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1979  alanyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 
874 aa  655    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00581  alanyl-tRNA synthetase  59.91 
 
 
886 aa  1014    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 
897 aa  677    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 
885 aa  637    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 
878 aa  649    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1128  alanyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 
874 aa  666    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12986  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1521  alanyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
887 aa  650    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 
874 aa  673    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 
878 aa  645    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 
880 aa  677    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3223  alanyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 
931 aa  642    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1048  alanyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 
900 aa  645    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3088  alanyl-tRNA synthetase  55.29 
 
 
880 aa  993    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 
876 aa  649    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2745  alanyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 
892 aa  677    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>