More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_00511 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_3339  alanyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
874 aa  674  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0101035  hitchhiker  6.88194e-07 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1196  alanyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 
875 aa  653  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00838926  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 
892 aa  686  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.00247e-06  unclonable  3.09197e-08 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 
874 aa  676  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 
876 aa  662  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  4.68314e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 
876 aa  662  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.53011e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03511  alanyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 
865 aa  636  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0990  alanyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 
865 aa  635  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1499  alanyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 
867 aa  663  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3238  alanyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 
875 aa  638  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.22674e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3904  alanyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 
904 aa  636  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.639044  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3101  alanyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 
880 aa  654  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.438368  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00511  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
890 aa  1832  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.409533  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3267  alanyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 
874 aa  689  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235906  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2617  alanyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
879 aa  655  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00109675  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 
876 aa  662  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  7.29274e-05  hitchhiker  2.729e-05 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1433  alanyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 
863 aa  673  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 
876 aa  660  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3373  alanyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 
875 aa  636  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0247326  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 
880 aa  655  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1394  alanyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 
883 aa  638  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 
877 aa  709  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.63922e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4235  alanyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 
880 aa  649  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.688921  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 
874 aa  679  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0620  alanyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 
876 aa  661  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4054  alanyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 
874 aa  663  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100715  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3124  alanyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 
874 aa  689  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.600607  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3628  alanyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 
872 aa  644  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168897  hitchhiker  4.64441e-06 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 
878 aa  696  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
874 aa  677  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00471  alanyl-tRNA synthetase  55.2 
 
 
886 aa  1024  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 
874 aa  673  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1660  alanyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 
874 aa  673  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0773336  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1637  alanyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 
874 aa  673  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365835  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3115  alanyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 
874 aa  689  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0471495  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 
880 aa  677  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 
874 aa  673  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2323  alanyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 
875 aa  651  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0626442  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28371  alanyl-tRNA synthetase  65.77 
 
 
930 aa  1166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.578023 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32618  predicted protein  53.96 
 
 
906 aa  899  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.63515 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1719  alanyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 
874 aa  651  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 
875 aa  644  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1521  alanyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
887 aa  650  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1709  alanyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 
876 aa  645  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 
859 aa  664  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1611  alanyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 
903 aa  640  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0248511  hitchhiker  1.35737e-05 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3223  alanyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 
931 aa  642  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1164  alanyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
885 aa  635  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.855181  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1675  alanyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 
876 aa  645  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.131241  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 
863 aa  661  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 
876 aa  670  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 
860 aa  645  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2745  alanyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 
892 aa  677  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376883  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00581  alanyl-tRNA synthetase  59.91 
 
 
886 aa  1014  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 
874 aa  675  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3088  alanyl-tRNA synthetase  55.29 
 
 
880 aa  993  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1779  alanyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 
874 aa  654  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2557  alanyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 
887 aa  636  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.243689  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1289  alanyl-tRNA synthetase  43 
 
 
865 aa  675  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 
876 aa  701  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 
879 aa  707  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0658  alanyl-tRNA synthetase  56.54 
 
 
889 aa  1020  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3565  alanyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 
875 aa  653  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000341381  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4468  alanyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 
880 aa  650  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.90216e-06 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0728  alanyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 
880 aa  647  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00762442  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0934  alanyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 
877 aa  688  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0898  alanyl-tRNA synthetase  57.39 
 
 
881 aa  1009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 
883 aa  647  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34460  alanyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 
874 aa  644  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440747  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2168  alanyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 
884 aa  645  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176955  normal  0.0912251 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1614  alanyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 
869 aa  640  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 
882 aa  660  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2740  alanyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 
870 aa  647  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002521  alanyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 
860 aa  644  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1946  alanyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 
890 aa  651  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197292  hitchhiker  0.00683804 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 
878 aa  680  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  1.49569e-05 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 
879 aa  674  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1452  alanyl-tRNA synthetase  58.2 
 
 
879 aa  1028  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3738  alanyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 
875 aa  645  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  42.58 
 
 
876 aa  663  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0814  alanyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 
893 aa  672  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1423  alanyl-tRNA synthetase  58.09 
 
 
879 aa  1026  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4508  alanyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 
880 aa  651  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 
876 aa  669  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  41.66 
 
 
876 aa  655  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 
878 aa  668  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00147  alanyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 
882 aa  661  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328967  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0744  alanyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 
888 aa  671  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.453512  normal  0.711122 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 
874 aa  674  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 
876 aa  662  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.08446e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 
874 aa  682  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0087  alanyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 
884 aa  637  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000138455  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 
874 aa  681  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1437  alanyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 
874 aa  639  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.738644 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1478  alanyl-tRNA synthetase  43 
 
 
882 aa  649  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.734898  normal  0.362746 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 
876 aa  660  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  3.67228e-05 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 
876 aa  660  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  1.32365e-06 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1250  alanyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 
874 aa  688  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.586835  hitchhiker  2.63081e-10 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4521  alanyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 
880 aa  650  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00304935  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1957  alanyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 
884 aa  637  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103878  normal  0.2106 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>